Jessica Kissinger

Jessica Kissinger es profesora distinguida de investigación en el Franklin College of Arts and Sciences de la Universidad de Georgia y directora del Instituto de Bioinformática . Su investigación se centra en la evolución , el ensamblaje y la curación de datos de genomas de parásitos protozoarios , en particular Cryptosporidium , Toxoplasma gondii y Plasmodium .

Kissinger obtuvo su doctorado en la Universidad de Indiana Bloomington en 1995. ^{[ 1 ]} Durante su posdoctorado trabajó con David Roos para ayudar a establecer la serie de colecciones de genomas de la Base de Datos de Patógenos Eucariotas ( EuPathDB ), incluyendo PlasmoDB , específica para la malaria , para facilitar las consultas y el acceso de los científicos. ^{[ 2 ] [ 3 ]} Desde su lanzamiento en 1999, la base de datos ha acumulado 9 TB de datos, ha recibido contribuciones de subvención renovadas de los NIH en cada ciclo de financiación y ahora recibe 6 millones de búsquedas al año de 13 000 personas. ^{[ 4 ]} Más recientemente, Kissinger y Roos recibieron una subvención que se espera que ascienda a 23,4 millones de dólares estadounidenses para el mantenimiento del recurso. ^{[ 4 ]} El éxito de EuPathDB ha llevado a la creación de la Base de Datos de Epidemiología Clínica ( ClinEpiDB ) basada en el mismo marco, junto con Christian Stoekert y Christiane Hertz-Fowler . ^{[ 5 ]}

En 2008, siendo profesora asociada, fue nombrada Miembro Nacional Asociada de las Academias Nacionales de Ciencias, Ingeniería y Medicina . ^{[ 6 ]} Ayudó a establecer el Instituto de Bioinformática en la Universidad de Georgia y luego se convirtió en su directora. ^{[ 7 ]} En 2016, la Universidad le otorgó el Premio Richard F. Reiff a la Internacionalización (junto con la profesora Rose Chepyator-Thomson ) por sus colaboraciones internacionales, la apertura de datos a nivel internacional y por ser miembro del grupo directivo de los Centros Internacionales de Excelencia para la Investigación de la Malaria de África Occidental en los Institutos Nacionales de Salud . ^{[ 7 ]}

Más allá de la creación de bases de datos, Kissinger se centra en el análisis y la comparación de genomas de parásitos. Utilizando ensamblajes genómicos de todo el grupo Apicomplexa (que incluye los parásitos de la malaria y la toxoplasmosis), se demostró que la sintenia genética (genes organizados en los mismos grupos en diferentes genomas) era sustancialmente menor de lo esperado en los genomas animales, lo que sugiere que los genomas de los parásitos han sufrido reordenamientos importantes o que su ancestro común más reciente es más antiguo de lo que se pensaba. ^{[ 8 ]} En 2012, su laboratorio ayudó a desarrollar una herramienta computacional, MCScanX, para identificar la sintenia entre genomas, que ha sido citada más de 650 veces. ^{[ 9 ] [ 10 ]}

Kissinger continúa haciendo que los macrodatos obtenidos de las investigaciones sobre parásitos sean lo más accesibles posible. El Centro de Interacción Huésped-Patógeno de la Malaria , una colaboración con la Universidad de Emory , financiado por el Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas y dirigido por Mary Galinski , está emprendiendo un importante proyecto para caracterizar miles de asociaciones entre la malaria y los mamíferos, y Kissinger participa en la conversión de estos datos a un formato que pueda ser utilizado por todos. ^{[ 11 ]} Sobre el proyecto, comentó: «El objetivo de mi equipo es integrar los terabytes de datos que se producen tanto sobre el huésped como sobre el parásito y hacerlos accesibles a nuestros modeladores matemáticos, que buscan patrones y señales, así como a la comunidad global de investigación sobre la malaria, para garantizar que esta gran inversión tenga el mayor impacto posible en la investigación sobre la malaria». ^{[ 11 ]}