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Articulo de referencia

KDM2A

La lisina-específica desmetilasa 2A (KDM2A), también conocida como proteína 11 con dominio F y repeticiones ricas en leucina (FBXL11), es una enzima que en humanos está codifica...

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La lisina-específica desmetilasa 2A (KDM2A), también conocida como proteína 11 con dominio F y repeticiones ricas en leucina (FBXL11), es una enzima que en humanos está codificada por el gen KDM2A . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] KDM2A es un miembro de la superfamilia de hidroxilasas dependientes de alfa-cetoglutarato , que son proteínas que contienen hierro no hemo.

Función

Este gen codifica un miembro de la familia de proteínas F-box , que se caracteriza por un motivo de aproximadamente 40 aminoácidos, la F-box. Las proteínas F-box constituyen una de las cuatro subunidades del complejo de ubiquitina ligasa llamado SCF (SKP1-cullin-F-box), que participa en la ubiquitinación dependiente de la fosforilación . Las proteínas F-box se dividen en tres clases: Fbws, que contienen dominios WD-40 ; Fbls, que contienen repeticiones ricas en leucina ; y Fbxs, que contienen diferentes módulos de interacción proteína-proteína o ningún motivo reconocible. La proteína codificada por este gen pertenece a la clase Fbls y, además de una F-box, contiene al menos seis repeticiones ricas en leucina altamente degeneradas. [ 7 ]

FBXL11/KDM2A es una enzima desmetilasa de la lisina 36 de la histona H3 . La actividad enzimática de FBXL11/KDM2A depende de un dominio JmjC conservado en el extremo N-terminal de la proteína que coordina hierro y alfa-cetoglutarato para catalizar la desmetilación mediante un mecanismo basado en hidroxilación. [ 8 ] Recientemente se ha demostrado que un dominio de unión al ADN ZF-CxxC dentro de FBXL11/KDM2A tiene la capacidad de interactuar con ADN no metilado y este dominio dirige FBXL11/KDM2A a las regiones de islas CpG del genoma donde elimina específicamente la metilación de la lisina 36 de la histona H3. [ 9 ] Este mecanismo actúa para crear un entorno de cromatina en las islas CpG que resalta estos elementos reguladores y los diferencia de las regiones no reguladoras en los grandes y complejos genomas de mamíferos. En un estudio en hepatocitos de ratón, se demostró que este gen regula la gluconeogénesis hepática. [ 10 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000173120 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000054611 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (julio de 1999). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XIII. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro" . DNA Res . 6 (1): 63–70 . doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032 . 
  6. ↑ Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (dic. 1999). "Una familia de proteínas F-box de mamíferos" . Curr Biol . 9 (20): 1180–2 . Bibcode : 1999CBio....9.1180W . doi : 10.1016/ S0960-9822 (00)80021-4 . PMID 10531037. S2CID 14341845 .  
  7. 1 2 "Gen Entrez: FBXL11 Proteína 11 con dominio F-box y repeticiones ricas en leucina" .
  8. ↑ Tsukada Y, Fang J, Erdjument-Bromage H, Warren ME, Borchers CH, Tempst P, Zhang Y (febrero de 2006). "Desmetilación de histonas por una familia de proteínas que contienen el dominio JmjC". Nature . 439 ( 7078): 811– 6. Bibcode : 2006Natur.439..811T . doi : 10.1038/nature04433 . PMID 16362057. S2CID 4415889 .  
  9. ↑ Blackledge NP, Zhou JC, Tolstorukov MY, Farcas AM, Park PJ, Klose RJ (abril de 2010). "Las islas CpG reclutan una desmetilasa de la lisina 36 de la histona H3" . Molecular Cell . 38 (2): 179–90 . doi : 10.1016/j.molcel.2010.04.009 . PMC 3098377. PMID 20417597 .  
  10. ^ Pan D, Mao C, Zou T, Yao AY, Cooper MP, Boyartchuk V, Wang YX (2012). "La histona desmetilasa Jhdm1a regula la gluconeogénesis hepática" . PLOS Genética . 8 (6) e1002761. doi : 10.1371/journal.pgen.1002761 . PMC 3375226 . PMID 22719268 .  

Lecturas adicionales

  • Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (2003). "Construcción de clones de ADNc listos para expresión para genes KIAA: curación manual de 330 clones de ADNc de KIAA" . Res. ADN . 9 (3): 99– 106. doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954 . 
  • Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (1999). "Identificación de una familia de proteínas F-box humanas" . Curr. Biol . 9 (20): 1177– 9. Bibcode : 1999CBio....9.1177C . doi : 10.1016/ S0960-9822 (00)80020-2 . PMID 10531035. S2CID 7467493 .  
  • Ilyin GP, ​​Rialland M, Pigeon C, Guguen-Guillouzo C (2001). "Clonación de ADNc y análisis de expresión de nuevos miembros de la familia de proteínas F-box de mamíferos". Genomics . 67 (1): 40– 7. doi : 10.1006/geno.2000.6211 . PMID 10945468 . 
  • Hattori A, Okumura K, Nagase T, Kikuno R, Hirosawa M, Ohara O (2001). "Caracterización de clones de ADNc largos del bazo humano adulto" . DNA Res . 7 (6): 357– 66. doi : 10.1093/dnares/7.6.357 . PMID 11214971 . 
  • Watanabe N, Arai H, Nishihara Y, Taniguchi M, Watanabe N, Hunter T, Osada H (2004). "Las quinasas de la fase M inducen la ubiquitinación dependiente de la fosforilación de Wee1 somático por SCFbeta-TrCP" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (13): 4419–24 . Bibcode : 2004PNAS..101.4419W . doi : 10.1073 / pnas.0307700101 . PMC 384762. PMID 15070733 .  
  • Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil ​​A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Mapeo proteómico funcional de una vía de señalización humana" . Res del genoma . 14 (7): 1324– 32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .  
  • Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). "Dinámica del proteoma nucleolar". Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .  
  • Tsukada Y, Fang J, Erdjument-Bromage H, Warren ME, Borchers CH, Tempst P, Zhang Y (2006). "Desmetilación de histonas por una familia de proteínas que contienen el dominio JmjC". Nature . 439 ( 7078): 811– 6. Bibcode : 2006Natur.439..811T . doi : 10.1038/nature04433 . PMID 16362057. S2CID 4415889 .  
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Cell . 127 ( 3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .