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KDM5A

La lisina-específica desmetilasa 5A es una enzima que en humanos está codificada por el gen KDM5A . [ 5 ] [ 6 ] Función La proteína codificada por este gen es una proteína nucle...

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La lisina-específica desmetilasa 5A es una enzima que en humanos está codificada por el gen KDM5A . [ 5 ] [ 6 ]

Función

La proteína codificada por este gen es una proteína nuclear de expresión ubicua. Se une directamente, junto con otras proteínas, a la proteína del retinoblastoma, que regula la proliferación celular. Anteriormente se la conocía como proteína de unión al retinoblastoma 2 (RBP2). Esta proteína también interactúa con la rombotina-2, que desempeña funciones específicas en la eritropoyesis y en la leucemogénesis de células T. Se cree que la rombotina-2 afecta directamente la actividad de la proteína codificada o bien modula indirectamente las funciones de la proteína del retinoblastoma al unirse a ella. Se han encontrado variantes de transcripción con empalme alternativo que codifican isoformas distintas para este gen. [ 6 ]

Se descubrió que el homólogo de Drosophila , LID, es una histona desmetilasa H3K4 que se une a c-Myc . [ 7 ] Recientemente se le cambió el nombre a Lisina Desmetilasa 5 (KDM5).

Enzimáticamente se puede designar como una trimetillisina dioxigenasa , que es un miembro de la superfamilia de hidroxilasas dependientes de alfa-cetoglutarato ( EC 1.14.11.8 ).

Interacciones

Se ha demostrado que JARID1A interactúa con el receptor de estrógeno alfa , [ 8 ] LMO2 [ 9 ] y la proteína del retinoblastoma . [ 8 ] [ 10 ]

JARID1A es un componente principal del reloj circadiano, cuya sobreexpresión al final de la fase de sueño bloquea la actividad de HDAC1. El bloqueo de la actividad de HDAC1 produce una sobreexpresión de CLOCK y BMAL1 y, en consecuencia, una sobreexpresión de las proteínas PER. El PSF (factor de empalme asociado a la proteína de unión al tracto de polipirimidina) dentro del complejo PER recluta a SIN3A, un andamio para el ensamblaje de complejos inhibidores transcripcionales, y entrega rítmicamente histonas deacetilasas al promotor de Per1, que reprimen la transcripción de Per1. [ 11 ] [ 12 ]

La inhibición de JARID1A promovió la diferenciación osteogénica de células estromales derivadas de tejido adiposo humano in vitro e in vivo, y resultó en aumentos marcados de la expresión de ARNm de genes asociados a la osteogénesis, como la fosfatasa alcalina (ALP), la osteocalcina (OC) y la osterix (OSX). Se demostró que RBP2 ocupa los promotores de OSX y OC para mantener el nivel de la marca H3K4me3 mediante ensayos de inmunoprecipitación de cromatina. RBP2 también se asoció física y funcionalmente con RUNX2, un factor de transcripción esencial que regula la diferenciación osteoblástica. La inhibición de RUNX2 afectó la actividad represora de RBP2 en la diferenciación osteogénica de células estromales derivadas de tejido adiposo humano. [ 13 ]

Referencias

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  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000030180 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Defeo-Jones D, Huang PS, Jones RE, Haskell KM, Vuocolo GA, Hanobik MG, Huber HE, Oliff A (julio de 1991). "Clonación de ADNc para proteínas celulares que se unen al producto del gen del retinoblastoma". Nature . 352 ( 6332): 251– 4. Bibcode : 1991Natur.352..251D . doi : 10.1038/352251a0 . PMID 1857421. S2CID 4357523 .  
  6. 1 2 "Gen Entrez: JARID1A jumonji, dominio interactivo rico en AT 1A" .
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  8. 1 2 Chan SW, Hong W (julio de 2001). "La proteína de unión al retinoblastoma 2 (Rbp2) potencia la transcripción mediada por el receptor de hormonas nucleares" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (30): 28402–12 . doi : 10.1074/jbc.M100313200 . PMID 11358960 . 
  9. ↑ Mao S, Neale GA, Goorha RM (abril de 1997). "El oncogén de células T rhombotin-2 interactúa con la proteína de unión al retinoblastoma 2" . Oncogene . 14 (13): 1531–9 . doi : 10.1038/sj.onc.1200988 . PMID 9129143 . 
  10. ↑ Kim YW, Otterson GA, Kratzke RA, Coxon AB, Kaye FJ (noviembre de 1994). "Especificidad diferencial para la unión de la proteína de unión al retinoblastoma 2 a RB, p107 y proteína de unión a TATA" . Biología molecular y celular . 14 (11): 7256–64 . doi : 10.1128/mcb.14.11.7256 . PMC 359260. PMID 7935440 .  
  11. ↑ DiTacchio L, Le HD, Vollmers C, Hatori M, Witcher M, Secombe J, Panda S (2011). "La histona lisina desmetilasa JARID1a activa CLOCK-BMAL1 e influye en el reloj circadiano" . Science . 333 ( 6051): 1881– 5. Bibcode : 2011Sci...333.1881D . doi : 10.1126/science.1206022 . PMC 3204309. PMID 21960634 .  
  12. ↑ Duong HA, Robles MS, Knutti D, Weitz CJ (2011). "Un mecanismo molecular para la retroalimentación negativa del reloj circadiano" . Science . 332 ( 6036): 1436– 9. Bibcode : 2011Sci...332.1436D . doi : 10.1126/science.1196766 . PMC 3859310. PMID 21680841 .  
  13. ↑ Ge W, Shi L, Zhou Y, Liu Y, Ma GE, Jiang Y, Xu Y, Zhang X, Feng H (2011). "Inhibición de la diferenciación osteogénica de células estromales derivadas de tejido adiposo humano mediante la represión de la transcripción activada por RUNX2 por la proteína de unión al retinoblastoma 2" . Stem Cells . 29 (7): 1112–25 . doi : 10.1002/stem.663 . PMID 21604327. S2CID 41977627 .  

Lecturas adicionales

  • Kim YW, Otterson GA, Kratzke RA, Coxon AB, Kaye FJ (noviembre de 1994). "Especificidad diferencial para la unión de la proteína de unión al retinoblastoma 2 a RB, p107 y proteína de unión a TATA" . Biología molecular y celular . 14 (11): 7256–64 . doi : 10.1128/mcb.14.11.7256 . PMC 359260. PMID 7935440 .  
  • Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 . 
  • Fattaey AR, Helin K, Dembski MS, Dyson N, Harlow E, Vuocolo GA, Hanobik MG, Haskell KM, Oliff A, Defeo-Jones D (noviembre de 1993). "Caracterización de las proteínas de unión al retinoblastoma RBP1 y RBP2". Oncogén . 8 (11): 3149– 56. PMID 8414517 . 
  • Baens M, Aerssens J, van Zand K, Van den Berghe H, Marynen P (septiembre de 1995). "Aislamiento y asignación regional de ADNc del cromosoma 12p humano". Genómica . 29 (1): 44– 52. doi : 10.1006/geno.1995.1213 . PMID 8530100 . 
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  • Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E, Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (septiembre de 1996). "Generación y análisis de 280.000 etiquetas de secuencia expresadas en humanos" . Investigación del genoma . 6 (9): 807– 28. doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549 . 
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Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .