Articulo de referencia

Kenneth M. Merz Jr.

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Kenneth M. Merz Jr. es un bioquímico y biólogo molecular estadounidense, actualmente titular de la Cátedra Joseph Zichis y profesor universitario distinguido en la Universidad Estatal de Michigan , además de editor jefe de la revista Journal of Chemical Information and Modeling de la Sociedad Química Estadounidense . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] Experto altamente citado en su campo, [ 6 ] sus intereses de investigación se centran en la química y biología computacional y el diseño de fármacos asistido por computadora (CADD). [ 7 ] [ 4 ] Su grupo ha participado en el desarrollo del conjunto de programas AMBER, ampliamente utilizado para simular sistemas químicos y biológicos, y del programa QUICK para cálculos de química cuántica. [ 8 ] [ 9 ]

Educación y primeros años de vida

Merz nació en Niagara Falls, Nueva York , el 24 de enero de 1959. Su familia se mudó a Gladwyne, Pensilvania , donde se graduó de la escuela secundaria Harriton en 1977. [ 10 ] Merz estudió química a nivel de pregrado en Washington College y se graduó en 1981. [ 8 ] En 1985, recibió su doctorado de la Universidad de Texas en Austin bajo la supervisión de MJS Dewar . Después de nombramientos postdoctorales con Roald Hoffmann de 1986 a 1987 y Peter Kollman de 1987 a 1989, comenzó su carrera académica en la Universidad Estatal de Pensilvania . [ 8 ] [ 4 ]

Carrera

Merz se unió al departamento de química de la Universidad Estatal de Pensilvania como profesor asistente en 1989. [ 11 ] [ 9 ] Fue ascendido a profesor asociado en 1996 y a profesor en 1998. [ 9 ] Mientras estaba en la Universidad Estatal de Pensilvania, tomó un año sabático para trabajar en la industria biofarmacéutica (1998-2001) como director sénior del Centro de Informática y Descubrimiento de Fármacos (CIDD) en Pharmacopeia, Inc. y como director sénior del Grupo de Investigación y Desarrollo ADMET en la división de software Accelrys de Pharmacopeia. [ 12 ] [ 11 ] También fundó, en 2001, la empresa de software QuantumBio, Inc. ubicada en State College, Pensilvania . [ 12 ] En 2005, se unió a la facultad de la Universidad de Florida en el departamento de química y como parte del Proyecto de Teoría Cuántica. [ 13 ] Mientras estuvo en la Universidad de Florida , fue nombrado Profesor Titular Coronel Allan R. y Margaret G. Crow, 2009-2011, [ 14 ] Profesor de la Fundación de Investigación de la Universidad de Florida (UFRF), [ 11 ] 2011-2013 y Profesor de Química Edmund H. Prominski, 2011-2013. [ 15 ] En 2013, Merz se trasladó a la Universidad Estatal de Michigan como profesor en los Departamentos de Química y Bioquímica y Biología Molecular . [ 1 ] Fue director del Instituto de Investigación Habilitada por Cibertecnología (2013-2019) y es la Cátedra Joseph Zichis en Química y profesor distinguido de la universidad. [ 12 ] Si bien su nombramiento principal es en la Universidad Estatal de Michigan , también ha ocupado cátedras visitantes en el Imperial College , el Instituto de Investigación en Biomedicina , la École Polytechnique , la Universidad de Florencia , la Universidad de Estrasburgo , la Universidad de Oviedo y la ETH Zúrich . [ 11 ]

Investigación

Merz es conocido por sus contribuciones al uso de métodos mecánicos cuánticos de escala lineal en ciencias biológicas y farmacéuticas ; métodos QM/MM; diseño de campos de fuerza para proteínas y metaloenzimas ; cargas puntuales atómicas; estudios de energía libre y refinamiento de RMN y rayos X utilizando métodos QM; el conjunto de programas AMBER para simulación biomolecular; y el programa QM ab initio QUICK. [ 1 ] [ 5 ]

Publicaciones

  • El problema del plegamiento de proteínas y la predicción de la estructura terciaria KM Merz, Jr.; SM LeGrand Eds.; Birkhaüser: Boston, MA, 1994. [ 16 ]
  • Estructura, función y dinámica de las bicapas lipídicas KM Merz, Jr.; B. Roux Eds.; Birkhaüser: Boston, MA, 1996.
  • Diseño de fármacos basado en la estructura D. Ringe; CR Reynolds; KM Merz, Jr., Eds.; Cambridge University Press: Boston, MA, 2010 [ 17 ]

Premios

  • Elección como miembro de la ACS (2010). [ 15 ]
  • Premio ACS a la informática en la investigación química y farmacéutica (2010). [ 18 ]
  • Mención honorífica de exalumnos, Washington College (2011). [ 19 ]
  • Elección como miembro de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia (1999). [ 9 ]
  • Beca John Simon Guggenheim (1996-1997). [ 11 ]

Publicaciones seleccionadas

  • Uso de enfoques de mecánica cuántica para estudiar sistemas biológicos; KM Merz, Jr. Acc. Chem. Res. 2014 47 , 2804–2811. [ 20 ]
  • Simulaciones QM/MM aceleradas por múltiples GPU de código abierto con AMBER y QUICK; V. Cruzeiro; M. Manathunga; KM Merz, Jr.; AW Götz J. Chem Inf. Model 2021 , 61 , 2109–2115. [ 21 ]
  • Un campo de fuerza de segunda generación para la simulación de proteínas, ácidos nucleicos y moléculas orgánicas; WD Cornell; P. Cieplak; CI Bayly; IR Gould; KM Merz, Jr. DM Ferguson; DC Spellmeyer; T. Fox; JW Cladwell; PA Kollman J. Am. Chem. Soc. 1995 , 117 , 5179-5197. [ 22 ]
  • Modelado de iones metálicos mediante mecánica clásica; P. Li; KM Merz, Jr. Chemical Reviews , 2017 , 117 , 1564–1686. [ 23 ]
  • Cargas atómicas derivadas de métodos semiempíricos; BH Besler, KM Merz, Jr. y PA Kollman J. Comput. Chem. 1990 , 11 , 431-439. [ 24 ]
  • Simulaciones de perturbación de energía libre de la inhibición de la termolisina: predicción de la energía libre de unión de un nuevo inhibidor; KM Merz Jr. y PA Kollman J. Am. Chem. Soc. 1989 , 111 , 5649-5658. [ 25 ]
  • El programa de simulación biomolecular Amber; DA Case; TE Cheatham, III; T. Darden; H. Gohlke; R. Luo; KM Merz, Jr.; A. Onufriev; C. Simmerling; B. Wang; RJ Woods J. Comput. Chem. 2005 , 26 , 1668-1688. [ 26 ]
  • Aprovechar el poder de la aceleración de múltiples GPU en el programa de kernel computacional de interacción cuántica; M. Manathunga; C. Jin; V. Cruzeiro; Y. Miao; D. Mu; K. Arumugam; K. Keipert; SM Aktulga; KM Merz, Jr.; A. Goetz J. Chem. Computación teórica. 2021 . [ 27 ]

Referencias

  1. 1 2 3 "Kenneth Merz" . www.chemistry.msu.edu . Archivado del original el 28 de junio de 2021. Consultado el 28 de junio de 2021 .
  2. "Kenneth Merz nombrado editor jefe de la revista Journal of Chemical Information and Modeling" . acs.org. 7 de noviembre de 2013. Consultado el 27 de noviembre de 2017 .
  3. "Kenneth Merz" . merzgroup.org . Consultado el 27 de noviembre de 2017 .
  4. 1 2 3 "Editor en jefe" . pubs.acs.org . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  5. 1 2 "Kenneth M. Merz Jr. nombrado nuevo editor de la revista Journal of Chemical Information & Modeling" . cen.acs.org . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  6. "Kenneth M. Merz Jr" . Consultado el 27 de noviembre de 2017 .
  7. "Kenneth M. Merz" . msu.edu. Archivado del original el 1 de agosto de 2017. Consultado el 27 de noviembre de 2017 .
  8. 1 2 3 "Prof. Kenneth Merz - Química y Bioquímica de Georgia Tech" . chemistry.gatech.edu . Archivado del original el 28 de junio de 2021. Consultado el 28 de junio de 2021 .
  9. 1 2 3 4 "Académico de MSU - Kenneth Merz" . scholars.msu.edu . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  10. "Clase de 1977 - Escuela Secundaria Harriton" . old-friends.co . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  11. 1 2 3 4 5 "SELECTBIO - Biografía del ponente del Congreso de Química de Descubrimiento" . selectbiosciences.com . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  12. 1 2 3 "Kenneth Merz nombrado titular de la Cátedra Joseph Zichis de Química" . MSUToday - Universidad Estatal de Michigan . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  13. "Proyecto de Teoría Cuántica - Universidad de Florida" . www.qtp.ufl.edu . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  14. "El exalumno Kenneth M. Merz, Jr., gana el premio ACS 2010" . cm.utexas.edu . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  15. 1 2 "Kenneth M. Merz, Jr., Ph.D., nombrado nuevo editor jefe de la revista Journal of Chemical Information and Modeling" . Sociedad Química Estadounidense . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  16. Merz, Kenneth; LeGrand, Scott M., eds. (1994). El problema del plegamiento de proteínas y la predicción de la estructura terciaria . Birkhäuser Basel. ISBN 978-1-4684-6833-5.
  17. Merz, Kenneth M. Jr; Ringe, Dagmar; Reynolds, Charles H., eds. (2010). Drug Design: Structure- and Ligand-Based Approaches . Cambridge: Cambridge University Press. doi : 10.1017/CBO9780511730412 . ISBN 978-0-521-88723-6.
  18. "El exalumno Kenneth M. Merz, Jr., gana el premio ACS 2010" . cm.utexas.edu . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  19. "Ceremonia de graduación 2011" . washcoll.livewhale.net . Archivado del original el 28 de junio de 2021. Consultado el 28 de junio de 2021 .
  20. Merz, Kenneth (2014-06-06). "Uso de enfoques de mecánica cuántica para estudiar sistemas biológicos" . Accounts of Chemical Research . 47 (9): 2804– 2811. doi : 10.1021/ar5001023 . PMC 4165465. PMID 25099338 .  
  21. "Simulaciones QM/MM aceleradas por múltiples GPU de código abierto con AMBER y QUICK" . natsci.msu.edu . Archivado del original el 28 de junio de 2021. Consultado el 28 de junio de 2021 .
  22. Ferguson, David (enero de 1995). "Un campo de fuerza de segunda generación para la simulación de proteínas, ácidos nucleicos y moléculas orgánicas" . Journal of the American Chemical Society .
  23. Li, Pengfei; Merz, Kenneth (2017-01-03). "Modelado de iones metálicos mediante mecánica clásica" . Chemical Reviews . 117 (3): 1564– 1686. doi : 10.1021/acs.chemrev.6b00440 . PMC 5312828. PMID 28045509 .  
  24. Besler, Brent H.; Merz, Kenneth M.; Kollman, Peter A. (1990). "Cargas atómicas derivadas de métodos semiempíricos" . Journal of Computational Chemistry . 11 (4): 431– 439. doi : 10.1002/jcc.540110404 . ISSN 1096-987X . S2CID 98010849 .  
  25. Merz, Kenneth M.; Kollman, Peter A. (1989-07-01). "Simulaciones de perturbación de energía libre de la inhibición de la termolisina: predicción de la energía libre de unión de un nuevo inhibidor" . Journal of the American Chemical Society . 111 (15): 5649– 5658. doi : 10.1021/ja00197a022 . ISSN 0002-7863 . 
  26. Case, David A.; Cheatham, Thomas E.; Darden, Tom; Gohlke, Holger; Luo, Ray; Merz, Kenneth M.; Onufriev, Alexey; Simmerling, Carlos; Wang, Bing; Woods, Robert J. (2005). "Los programas de simulación biomolecular Amber" . Journal of Computational Chemistry . 26 (16): 1668– 1688. doi : 10.1002/jcc.20290 . ISSN 0192-8651 . PMC 1989667. PMID 16200636 .   
  27. ^ Manathunga, Madushanka; Jin, Chi; Cruzeiro, Vinicius; Miao, Yipu; Mu, Dawei; Arumugam, Kamesh; Keipert, Kristopher; Aktulga, Hasan Metin; Kenneth M. Merz, hijo; Goetz, Andreas (10 de febrero de 2021). "Aprovechamiento del poder de la aceleración de múltiples GPU en el programa de kernel computacional de interacción cuántica" . doi : 10.26434/chemrxiv.13769209.v1 .{{cite journal}}: Para citar una revista se requiere |journal=( ayuda )
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