Virus Kupe

El virus Kupe es una especie de virus del género Orthonairovirus . ^{[ 2 ]}

El virus fue aislado de garrapatas agrupadas ( Amblyomma gemma y Rhipicephalus pulchellus ) recolectadas de pieles de ganado en Nairobi , Kenia , en octubre de 1999. ^{[ 3 ]} La palabra 'Kupe' es garrapata en suajili .

El genoma está compuesto por una sola hebra de ARN de sentido negativo en tres partes: pequeña (S), mediana (M0) y grande (L).

El segmento L de ARN tiene una longitud de 12 330 nucleótidos (nt) y codifica un marco de lectura abierto (ORF) de 4050 aminoácidos. Presenta regiones no codificantes: la región 5′ de 40 nt y la región 3′ de 137 nt. Este marco de lectura abierto codifica varios módulos, incluyendo una ARN polimerasa dependiente de ARN. Probablemente se fragmenta postraduccionalmente en varias proteínas, pero esto aún no se ha demostrado.

El segmento M del ARN tiene una longitud de 4818 nucleótidos y contiene un marco de lectura abierto flanqueado por regiones no codificantes 5' y 3' de 47 y 121 nucleótidos, respectivamente. El ORF codifica una proteína de 1549 aminoácidos con 8 sitios potenciales de glicosilación N-ligada. Contiene un sitio potencial único de N-glicosilación en las regiones de glicoproteína Gn y Gc, en los aminoácidos 612 y 1514, respectivamente.

El segmento S tiene 1694 nucleótidos y codifica un marco de lectura abierto (ORF) de 483 aminoácidos. Las regiones no codificantes 5′ y 3′ tienen una longitud de 49 nucleótidos y 193 nucleótidos, respectivamente.