Articulo de referencia

ADN ligasa 4

La ADN ligasa 4 o ADN ligasa IV es una enzima que en los humanos está codificada por el gen LIG4 . [ 5 ] Función La ADN ligasa 4 es una ADN ligasa dependiente de ATP que une rot...

La ADN ligasa 4 o ADN ligasa IV es una enzima que en los humanos está codificada por el gen LIG4 . [ 5 ]

Función

La ADN ligasa 4 es una ADN ligasa dependiente de ATP que une roturas de doble cadena durante la vía de unión de extremos no homólogos de reparación de roturas de doble cadena. También es esencial para la recombinación V(D)J . Lig4 forma un complejo con XRCC4 , e interactúa además con la proteína quinasa dependiente de ADN (DNA-PK) y XLF/Cernunnos , que también son necesarios para NHEJ. La estructura cristalina del complejo Lig4/XRCC4 ha sido resuelta. [ 6 ] Los defectos en este gen son la causa del síndrome LIG4 . El homólogo de levadura de Lig4 es Dnl4.

Síndrome de LIG4

En humanos, la deficiencia de la ADN ligasa 4 produce una afección clínica conocida como síndrome LIG4 . Este síndrome se caracteriza por sensibilidad celular a la radiación, retraso del crecimiento, retraso del desarrollo, microcefalia , dismorfias faciales, mayor predisposición a la leucemia, grados variables de inmunodeficiencia y disminución del número de células sanguíneas. [ 7 ] [ 8 ]

Envejecimiento de las células madre hematopoyéticas

La acumulación de daño en el ADN que conduce al agotamiento de las células madre se considera un aspecto importante del envejecimiento. [ 9 ] [ 10 ] La deficiencia de lig4 en células madre pluripotentes altera la unión de extremos no homólogos (NHEJ) y resulta en la acumulación de roturas de doble cadena de ADN y una mayor apoptosis . [ 8 ] La deficiencia de Lig4 en el ratón causa una pérdida progresiva de células madre hematopoyéticas y celularidad de la médula ósea durante el envejecimiento. [ 11 ] La sensibilidad de las células madre hematopoyéticas a la deficiencia de lig4 sugiere que la NHEJ mediada por lig4 es un determinante clave de la capacidad de las células madre para mantenerse frente al estrés fisiológico a lo largo del tiempo. [ 8 ] [ 11 ]

Interacciones

Se ha demostrado que LIG4 interactúa con XRCC4 a través de su dominio BRCT . [ 12 ] [ 6 ] Esta interacción estabiliza la proteína LIG4 en las células; las células que son deficientes en XRCC4 , como las células XR-1, tienen niveles reducidos de LIG4. [ 13 ]

Mecanismo

LIG4 es una ligasa de ADN dependiente de ATP. LIG4 utiliza ATP para adenilarse y luego transfiere el grupo AMP al fosfato 5' de un extremo del ADN. El ataque nucleofílico del grupo hidroxilo 3' de un segundo extremo del ADN y la liberación de AMP generan el producto de ligación. La adenilación de LIG4 es estimulada por XRCC4 y XLF . [ 14 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000174405 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000049717 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. "Gen Entrez: ligasa IV LIG4, ADN, dependiente de ATP" .
  6. 1 2 Sibanda BL, Critchlow SE, Begun J, Pei XY, Jackson SP, Blundell TL, Pellegrini L (diciembre de 2001). "Estructura cristalina de un complejo Xrcc4-ADN ligasa IV". Nature Structural Biology . 8 (12): 1015– 9. doi : 10.1038/nsb725 . PMID 11702069 . S2CID 21218268 .  
  7. Rucci F, Notarangelo LD, Fazeli A, Patrizi L, Hickernell T, Paganini T, Coakley KM, Detre C, Keszei M, Walter JE, Feldman L, Cheng HL, Poliani PL, Wang JH, Balter BB, Recher M, Andersson EM, Zha S, Giliani S, Terhorst C, Alt FW, Yan CT (febrero de 2010). "La mutación homocigótica R278H de la ADN ligasa IV en ratones conduce a una inmunodeficiencia combinada grave con fugas y representa un modelo para el síndrome LIG4 humano" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 107 (7): 3024– 9. Bibcode : 2010PNAS..107.3024R . doi : 10.1073/pnas.0914865107 . PMC 2840307 . PMID 20133615 .  
  8. 1 2 3 Tilgner K, Neganova I, Moreno-Gimeno I, Al-Aama JY, Burks D, Yung S, Singhapol C, Saretzki G, Evans J, Gorbunova V, Gennery A, Przyborski S, Stojkovic M, Armstrong L, Jeggo P, Lako M (agosto de 2013). "Un modelo de iPSC humana de deficiencia de ligasa IV revela un papel importante para la reparación de DSB mediada por NHEJ en la supervivencia y estabilidad genómica de células madre pluripotentes inducidas y progenitores hematopoyéticos emergentes" . Cell Death and Differentiation . 20 (8): 1089– 100. doi : 10.1038/cdd.2013.44 . PMC 3705601. PMID 23722522 .  
  9. Rossi DJ, Bryder D, Seita J, Nussenzweig A, Hoeijmakers J, Weissman IL (junio de 2007). "Las deficiencias en la reparación del daño del ADN limitan la función de las células madre hematopoyéticas con la edad". Nature . 447 (7145): 725–9 . Bibcode : 2007Natur.447..725R . doi : 10.1038/ nature05862 . PMID 17554309. S2CID 4416445 .  
  10. Bernstein H, Payne CM, Bernstein C, Garewal H, Dvorak K (2008). «Capítulo 1: Cáncer y envejecimiento como consecuencias del daño no reparado del ADN» . En Kimura H, Suzuki A (eds.). Nuevas investigaciones sobre daños en el ADN . Nueva York: Nova Science Publishers, Inc. pp. 1–47 . ISBN  978-1-60456-581-2Archivado del original el 25/10/2014 . Consultado el 20/05/2015 .
  11. 1 2 Nijnik A, Woodbine L, Marchetti C, Dawson S, Lambe T, Liu C, Rodrigues NP, Crockford TL, Cabuy E, Vindigni A, Enver T, Bell JI, Slijepcevic P, Goodnow CC, Jeggo PA, Cornall RJ (junio de 2007). "La reparación del ADN es limitante para las células madre hematopoyéticas durante el envejecimiento". Nature . 447 ( 7145): 686– 90. Bibcode : 2007Natur.447..686N . doi : 10.1038/nature05875 . PMID 17554302. S2CID 4332976 .  
  12. Deshpande RA, Wilson TE (octubre de 2007). "Modos de interacción entre las proteínas Nej1, Lif1 y Dnl4 de levadura y comparación con XLF, XRCC4 y Lig4 humanas" . Reparación del ADN . 6 (10): 1507–16 . doi : 10.1016/j.dnarep.2007.04.014 . PMC 2064958. PMID 17567543 .  
  13. Bryans M, Valenzano MC, Stamato TD (enero de 1999). "Ausencia de la proteína ADN ligasa IV en células XR-1: evidencia de estabilización por XRCC4". Mutation Research . 433 (1): 53–8 . doi : 10.1016/s0921-8777(98)00063-9 . PMID 10047779 . 
  14. Mahaney BL, Hammel M, Meek K, Tainer JA, Lees-Miller SP (febrero de 2013). "XRCC4 y XLF forman largos filamentos proteicos helicoidales adecuados para la protección y alineación de los extremos del ADN para facilitar la reparación de roturas de doble cadena del ADN" . Biochemistry and Cell Biology . 91 (1): 31– 41. doi : 10.1139/bcb-2012-0058 . PMC 3725335. PMID 23442139 .  

Lecturas adicionales

  • Wei YF, Robins P, Carter K, Caldecott K, Pappin DJ, Yu GL, Wang RP, Shell BK, Nash RA, Schär P (junio de 1995). "Clonación molecular y expresión de ADNc humanos que codifican una nueva ADN ligasa IV y ADN ligasa III, una enzima activa en la reparación y recombinación del ADN" . Biología Molecular y Celular . 15 (6): 3206–16 . doi : 10.1128/mcb.15.6.3206 . PMC 230553. PMID 7760816 .  
  • Robins P, Lindahl T (septiembre de 1996). "ADN ligasa IV de núcleos de células HeLa" . The Journal of Biological Chemistry . 271 (39): 24257– 61. doi : 10.1074/jbc.271.39.24257 . PMID 8798671 . 
  • Grawunder U, Wilm M, Wu X, Kulesza P, Wilson TE, Mann M, Lieber MR (julio de 1997). " Actividad de la ADN ligasa IV estimulada por la formación de complejos con la proteína XRCC4 en células de mamíferos" . Nature . 388 (6641): 492–5 . doi : 10.1038/41358 . PMID 9242410. S2CID 4349909 .  
  • Critchlow SE, Bowater RP, Jackson SP (agosto de 1997). "La proteína XRCC4 de reparación de roturas de doble cadena del ADN de mamíferos interactúa con la ADN ligasa IV" . Current Biology . 7 (8): 588– 98. Bibcode : 1997CBio....7..588C . doi : 10.1016/S0960-9822(06)00258-2 . PMID 9259561 . 
  • Grawunder U, Zimmer D, Lieber MR (julio de 1998). "La ADN ligasa IV se une a XRCC4 a través de un motivo ubicado entre sus dominios BRCT en lugar de dentro de ellos" . Current Biology . 8 (15): 873– 6. Bibcode : 1998CBio....8..873G . doi : 10.1016/S0960-9822(07)00349-1 . PMID 9705934 . 
  • Grawunder U, Zimmer D, Fugmann S, Schwarz K, Lieber MR (octubre de 1998). "La ADN ligasa IV es esencial para la recombinación V(D)J y la reparación de roturas de doble cadena de ADN en linfocitos precursores humanos" . Molecular Cell . 2 (4): 477–84 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)80147-1 . PMID 9809069 . 
  • Riballo E, Critchlow SE, Teo SH, Doherty AJ, Priestley A, Broughton B, Kysela B, Beamish H, Plowman N, Arlett CF, Lehmann AR, Jackson SP, Jeggo PA (julio de 1999). "Identificación de un defecto en la ADN ligasa IV en un paciente con leucemia radiosensible" . Current Biology . 9 (13): 699– 702. Bibcode : 1999CBio....9..699R . doi : 10.1016/S0960-9822(99)80311-X . PMID 10395545 . 
  • Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (diciembre de 1999). "Especificidades de sustrato e identificación de sustratos putativos de miembros de la familia de quinasas ATM" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (53): 37538–43 . doi : 10.1074/jbc.274.53.37538 . PMID 10608806 . 
  • Nick McElhinny SA, Snowden CM, McCarville J, Ramsden DA (mayo de 2000). "Ku recluta el complejo XRCC4-ligasa IV a los extremos del ADN" . Biología Molecular y Celular . 20 (9): 2996–3003 . doi : 10.1128/MCB.20.9.2996-3003.2000 . PMC 85565. PMID 10757784 .  
  • Chen L, Trujillo K, Sung P, Tomkinson AE (agosto de 2000). "Interacciones del complejo ADN ligasa IV-XRCC4 con los extremos del ADN y la proteína quinasa dependiente del ADN" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (34): 26196–205 . doi : 10.1074/jbc.M000491200 . PMID 10854421 . 
  • Lee KJ, Huang J, Takeda Y, Dynan WS (noviembre de 2000). "La ADN ligasa IV y XRCC4 forman un tetrámero mixto estable que funciona sinérgicamente con otros factores de reparación en un sistema de unión de extremos libre de células" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (44): 34787–96 . doi : 10.1074/jbc.M004011200 . PMID 10945980 . 
  • Riballo E, Doherty AJ, Dai Y, Stiff T, Oettinger MA, Jeggo PA, Kysela B (agosto de 2001). "Impacto celular y bioquímico de una mutación en la ADN ligasa IV que confiere radiosensibilidad clínica" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (33): 31124–32 . doi : 10.1074/jbc.M103866200 . PMID 11349135 . 
  • Sibanda BL, Critchlow SE, Begun J, Pei XY, Jackson SP, Blundell TL, Pellegrini L (diciembre de 2001). "Estructura cristalina de un complejo Xrcc4-ADN ligasa IV". Nature Structural Biology . 8 (12): 1015– 9. doi : 10.1038/nsb725 . PMID 11702069. S2CID 21218268 .  
  • O'Driscoll M, Cerosaletti KM, Girard PM, Dai Y, Stumm M, Kysela B, Hirsch B, Gennery A, Palmer SE, Seidel J, Gatti RA, Varon R, Oettinger MA, Neitzel H, Jeggo PA, Concannon P (diciembre de 2001). "Mutaciones de la ADN ligasa IV identificadas en pacientes que presentan retraso en el desarrollo e inmunodeficiencia" . Célula molecular . 8 ( 6): 1175–85.doi : 10.1016/S1097-2765(01) 00408-7 . PMID 11779494 . 
  • Kuschel B, Auranen A, McBride S, Novik KL, Antoniou A, Lipscombe JM, Day NE, Easton DF, Ponder BA, Pharoah PD, Dunning A (junio de 2002). "Variantes en genes de reparación de roturas de doble cadena de ADN y susceptibilidad al cáncer de mama" . Human Molecular Genetics . 11 (12): 1399–407 . doi : 10.1093/hmg/11.12.1399 . PMID 12023982 . 
  • Mahajan KN, Nick McElhinny SA, Mitchell BS, Ramsden DA (julio de 2002). "Asociación de la ADN polimerasa mu (pol mu) con Ku y la ligasa IV: función de pol mu en la reparación de roturas de doble cadena por unión de extremos" . Biología Molecular y Celular . 22 (14): 5194–202 . doi : 10.1128/MCB.22.14.5194-5202.2002 . PMC 139779. PMID 12077346 .  
  • Roth DB (julio de 2002). "Mecanismos de amplificación de la linfomagénesis" . Molecular Cell . 10 (1): 1– 2. doi : 10.1016/S1097-2765(02)00573-7 . PMID 12150897 . 
  • Smogorzewska A, Karlseder J , Holtgreve-Grez H, Jauch A, de Lange T (octubre de 2002). "NHEJ dependiente de la ADN ligasa IV de telómeros de mamíferos desprotegidos en G1 y G2" (PDF) . Current Biology . 12 (19): 1635–44 . Bibcode : 2002CBio...12.1635S . doi : 10.1016/S0960-9822(02)01179-X . PMID 12361565. S2CID 17749937. Archivado del original (PDF) el 8 de mayo de 2021. Recuperado el 19 de agosto de 2019 .  
  • Roddam PL, Rollinson S, O'Driscoll M, Jeggo PA, Jack A, Morgan GJ (diciembre de 2002). "Las variantes genéticas de la ligasa IV de ADN NHEJ pueden afectar el riesgo de desarrollar mieloma múltiple, un tumor caracterizado por una recombinación de cambio de clase aberrante" . Journal of Medical Genetics . 39 (12): 900– 5. doi : 10.1136/jmg.39.12.900 . PMC 1757220. PMID 12471202 .  
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