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Articulo de referencia

LRRC23

La proteína 23 que contiene repeticiones ricas en leucina es una proteína que en humanos está codificada por el gen LRRC23 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Función Se desconoce la función de...

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La proteína 23 que contiene repeticiones ricas en leucina es una proteína que en humanos está codificada por el gen LRRC23 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Función

Se desconoce la función de LRRC23. Pertenece a la familia de proteínas con repeticiones ricas en leucina , conocidas por participar en interacciones proteína-proteína . La evidencia experimental sugiere que LRRC23 interactúa con la proteína CD28 en una vía relacionada con el sistema inmunitario y el desarrollo de células T reguladoras que controlan enfermedades autoinmunes espontáneas. [ 8 ]

Secuencia de proteínas

LRRC23 abarca 343 residuos y contiene dos variantes de secuencias repetidas internamente. Detectada y alineada por RADAR, [ 9 ] la repetición más abundante es la rica en leucina, que se repite 9 veces en las bases 89-287. La otra secuencia repetida aparece dos veces en las bases 3-36. La salida del programa RADAR, que se muestra a continuación, resume la composición y la ubicación de todas las repeticiones y las alinea para compararlas entre sí.

El genoma humano produce tres variantes conocidas de LRRC23. [ 7 ] La variante de empalme más grande, la variante 3, contiene 8 exones . Las variantes 1 y 2 utilizan exones iniciales alternativos, y la variante 2 excluye el séptimo exón, lo que le da un total de siete exones que componen el ARNm.

Estructura de las proteínas

Aunque se desconoce la estructura real de LRRC23, la comparación con las estructuras cristalinas de varias proteínas similares, como 2OMW A (valor e 1,00e-17), revela una estructura típica de otras proteínas con repeticiones ricas en leucina. Las láminas beta y las hélices alternadas crean una cadena peptídica en espiral que forma un arco, con las láminas beta ocupando la superficie cóncava. [ 10 ]

La estructura alineada de 2OMW_A con LRRC23 abarca los aminoácidos 72-272 de la proteína LRRC23. Las asparaginas conservadas se resaltan en amarillo, lo que muestra la regularidad del espaciado y la estructura repetitiva en su interior. Este modelo se generó utilizando el software Cn3D proporcionado por NCBI .

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000010626 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000030125 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Tzachanis D, Berezovskaya A, Nadler LM, Boussiotis VA (febrero de 2002). "El bloqueo de B7/CD28 en cultivos de reacción linfocitaria mixta da como resultado la generación de macrófagos activados alternativamente, que suprimen las respuestas de las células T" . Blood . 99 (4): 1465–73 . doi : 10.1182/blood.V99.4.1465 . PMID 11830501 . 
  6. ↑ Chang TT, Kuchroo VK, Sharpe AH (febrero de 2002). "Función de la vía B7-CD28/CTLA-4 en las enfermedades autoinmunes". Vías de transducción de señales en la autoinmunidad . Direcciones actuales en autoinmunidad. Vol. 5. págs. 113-130 . doi : 10.1159/000060550 . ISBN   3-8055-7308-1. PMID 11826754 . 
  7. 1 2 "Gen Entrez: LRRC23 que contiene repeticiones ricas en leucina 23" .
  8. ↑ Salomon B, Lenschow DJ, Rhee L, Ashourian N, Singh B, Sharpe A, Bluestone JA (abril de 2000). "La coestimulación B7/CD28 es esencial para la homeostasis de las células T inmunorreguladoras CD4+CD25+ que controlan la diabetes autoinmune" . Immunity . 12 (4): 431–40 . doi : 10.1016/S1074-7613(00)80195-8 . PMID 10795741 . 
  9. ↑ RADAR: Laboratorio Europeo de Biología Molecular - Instituto Europeo de Bioinformática (EMBLE-EBI) Programa Radar:
  10. ↑ Estructura de NCBI CBlast https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cblast/cblast.cgi?client=entrez&query_gi=206725447&hit=149242643&hsp=1&output=html&pagenum=1&epp=20&sort=evalue&view=graphic&subset=allmmdb

Lecturas adicionales

  • Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 . 
  • Ansari-Lari MA, Muzny DM, Lu J, Lu F, Lilley CE, Spanos S, Malley T, Gibbs RA (abril de 1996). "Un grupo rico en genes entre los genes CD4 y triosafosfato isomerasa en el cromosoma humano 12p13" . Genome Research . 6 (4): 314–26 . doi : 10.1101/gr.6.4.314 . PMID 8723724 . 
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (septiembre de 1996). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Genome Research . 6 (9): 791–806 . doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 . 
  • Ansari-Lari MA, Shen Y, Muzny DM, Lee W, Gibbs RA (marzo de 1997). "Secuenciación a gran escala en el cromosoma humano 12p13: determinación experimental y computacional de la estructura genética" . Genome Research . 7 (3): 268–80 . doi : 10.1101/gr.7.3.268 . PMID 9074930 . 
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y en el extremo 5'". Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 . 
  • Tasheva ES, An K, Boyle DL, Conrad GW (2006). "Expresión y localización de la proteína B7 rica en leucina en tejidos oculares humanos". Molecular Vision . 11 : 452–60 . PMID 16030496 .