LRRIQ3

LRRIQ3 (repeticiones ricas en leucina y motivo IQ que contiene 3), también conocida como LRRC44, es una proteína que en los humanos está codificada por el gen LRRIQ3 . ^[5] Se expresa predominantemente en los testículos y está vinculada a una serie de enfermedades. ^[6]

LRRIQ3 se encuentra en la cadena negativa del extremo del brazo corto del cromosoma humano 1 en 1p31.1. ^[7]

Hay un total de 7 exones en la secuencia putativa de LRRIQ3. ^[7]

LRRIQ3 se expresa en dos isoformas principales que producen proteínas de 624 y 464 aminoácidos respectivamente. ^[7] Se expresa en niveles bajos en tejidos humanos y de rata parda, ^{[8] [9]} con los niveles de expresión más altos en el tejido de los testículos . Hay niveles de expresión relativamente altos en las células T , el epidídimo , el riñón y varias glándulas. ^[10]

La isoforma 1 de la proteína humana LRRIQ3 consta de 624 aminoácidos y tiene un peso molecular de 73,7 kDa. El punto isoeléctrico de LRRIQ3 es 9,73, lo que sugiere que LRRIQ3 es básico a un pH fisiológico normal (~7,4). ^[11] Además, existe una fuerte evidencia de que LRRIQ3 humano se localiza en la membrana plasmática a partir de la tinción de anticuerpos. ^[12] LRRIQ3 es rico en residuos de lisina , con un total de 82 lisinas. También es ligeramente bajo en glicinas . ^[13]

En total, hay 4 dominios conservados dentro de LRRIQ3: 3 repeticiones ricas en leucina y 1 motivo de unión a calmodulina IQ . ^[13] Las repeticiones ricas en leucina suelen estar involucradas en interacciones proteína-proteína y forman un pliegue de herradura α/β característico. ^{[14] [15]} Un motivo IQ proporciona un sitio de unión para la calmodulina (CaM) o proteínas similares a CaM. ^[16]

Se predice que LRRIQ3 tiene una estructura mayoritariamente alfa - helicoidal , incluido un dominio C-terminal alfa-helicoidal largo . También se predice que funciona como un monómero . ^{[17] [18] [19] [20]}

Se predice que LRRIQ3 experimentará muchas modificaciones postraduccionales . Estas incluyen O-GlcNAcilación , SUMOilación , ubiquitinación y fosforilación . ^{[22] [23]} Se predice que LRRIQ3 tiene 4 sitios de SUMOilación bien conservados y 1 sitio de ubiquitinación bien conservado. ^[22] Una representación de estas modificaciones postraduccionales se muestra en la figura a continuación.

Existe evidencia de que LRRIQ3 interactúa con varias proteínas a partir de ensayos de dos híbridos y cromatografía de afinidad . Las proteínas con las que interactúa LRRIQ3 incluyen LYN , NCK2 , GNB4 y ABL1 . ^{[25] [26]} Estas proteínas están asociadas con la señalización celular , la reorganización del citoesqueleto y la diferenciación celular , así como otras. ^{[27] [28] [29] [30]}

No existen parálogos para LRRIQ3 en humanos. ^[6] Sin embargo, hay varios ortólogos , según lo informado por BLAST , algunos de los cuales se enumeran a continuación. ^[31] La cantidad de años desde la divergencia de la proteína humana, que se enumera en "millones de años (MYA)" a continuación, se calculó utilizando TimeTree . ^[32]

El LRRIQ3 está vinculado a varios tipos de cáncer. Los experimentos de secuenciación de ARN han demostrado que el LRRIQ3 está severamente regulado a la baja (cambios de Log ₂ entre -3,4 y -4,2) en varios estados patológicos, incluidos el cáncer de páncreas, el cáncer colorrectal y el cáncer de mama. ^{[33] [34] [35]}