Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

LSM2

La proteína LSm2, asociada al ARNsn U6 y similar a Sm, es una proteína que en humanos está codificada por el gen LSM2 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Función Se identificaron proteínas simi...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

La proteína LSm2, asociada al ARNsn U6 y similar a Sm, es una proteína que en humanos está codificada por el gen LSM2 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Función

Se identificaron proteínas similares a Sm en diversos organismos basándose en la homología de secuencia con la familia de proteínas Sm (véase SNRPD2; MIM 601061). Estas proteínas contienen el motivo de secuencia Sm, que consta de dos regiones separadas por un enlazador de longitud variable que se pliega formando un bucle. Se cree que las proteínas similares a Sm forman un heterómero estable presente en las partículas tri-snRNP, que son importantes para el empalme del pre-ARNm. [Proporcionado por OMIM] [ 7 ]

Interacciones

Se ha demostrado que LSM2 interactúa con DDX20 , [ 8 ] LSM3 , [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] LSM8 [ 9 ] [ 10 ] y LSM7 . [ 9 ] [ 10 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000204392 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000007050 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Achsel T, Brahms H, Kastner B, Bachi A, Wilm M, Lührmann R (octubre de 1999). "Un heterómero con forma de rosquilla de proteínas humanas similares a Sm se une al extremo 3' del ARNsn U6, facilitando así la formación del dúplex U4/U6 in vitro" . The EMBO Journal . 18 (20): 5789–802 . doi : 10.1093/emboj/18.20.5789 . PMC 1171645. PMID 10523320 .  
  6. ↑ Olavesen MG, Snoek M, Campbell RD (marzo de 1993). "Localización de un nuevo gen adyacente a los genes HSP70 en MHC humanos y de ratón". Immunogenetics . 37 ( 5): 394–6 . doi : 10.1007/BF00216806 . PMID 8428774. S2CID 1809207 .  
  7. 1 2 "Gen Entrez: LSM2 Homólogo de LSM2, ARN nuclear pequeño U6 asociado (S. cerevisiae)" .
  8. ↑ Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (dic. 1999). "Gemin3: una nueva proteína de la familia DEAD que interactúa con SMN, el producto del gen de la atrofia muscular espinal, y es un componente de gems" . The Journal of Cell Biology . 147 (6): 1181–94 . doi : 10.1083/jcb.147.6.1181 . PMC 2168095. PMID 10601333 .  
  9. 1 2 3 Lehner B, Sanderson CM (julio de 2004). " Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano" . Genome Research . 14 (7): 1315– 23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147. PMID 15231747 .  
  10. 1 2 3 Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (enero de 2004). "Análisis de un sistema de doble híbrido de levadura de alto rendimiento y su uso para predecir la función de las proteínas intracelulares codificadas dentro de la región MHC clase III humana". Genomics . 83 (1): 153– 67. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 . 
  11. ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (octubre de 2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .  
  12. ↑ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (septiembre de 2005). "Una red de interacción proteína-proteína humana: un recurso para anotar el proteoma" . Celúla . 122 (6): 957– 68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . 

Lecturas adicionales

  • Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (dic. 1999). "Gemin3: una nueva proteína de la familia DEAD que interactúa con SMN, el producto del gen de la atrofia muscular espinal, y es un componente de gems" . The Journal of Cell Biology . 147 (6): 1181– 94. doi : 10.1083/jcb.147.6.1181 . PMC 2168095. PMID 10601333 .  
  • Friesen WJ, Dreyfuss G (agosto de 2000). "Secuencias específicas de las proteínas Sm y similares a Sm (Lsm) median su interacción con el producto génico de la enfermedad de atrofia muscular espinal (SMN)" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (34): 26370–5 . doi : 10.1074/jbc.M003299200 . PMID 10851237 . 
  • Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R, Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (agosto de 2000). "Perfil de expresión génica en el eje hipotálamo-hipófisis-suprarrenal humano y clonación de ADNc de longitud completa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (17): 9543–8 . Bibcode : 2000PNAS...97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 . PMID 10931946 .  
  • Eystathioy T, Peebles CL, Hamel JC, Vaughn JH, Chan EK (marzo de 2002). "Autoanticuerpos contra hLSm4 y el complejo heptamérico LSm en sueros anti-Sm" . Arthritis and Rheumatism . 46 (3): 726–34 . doi : 10.1002/art.10220 . PMID 11920408 . 
  • Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (abril de 2002). "Purificación y caracterización de espliceosomas nativos adecuados para el análisis estructural tridimensional" . RNA . 8 ( 4): 426–39 . doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266. PMID 11991638 .  
  • Ingelfinger D, Arndt-Jovin DJ, Lührmann R, Achsel T (dic. 2002). "Las proteínas humanas LSm1-7 se colocalizan con las enzimas degradadoras de ARNm Dcp1/2 y Xrnl en focos citoplasmáticos distintos" . RNA . 8 ( 12): 1489– 501. doi : 10.1017/S1355838202021726 . PMC 1370355. PMID 12515382 .  
  • Xie T, Rowen L, Aguado B, Ahearn ME, Madan A, Qin S, Campbell RD, Hood L (dic. 2003). " Análisis de la región de clase III del complejo mayor de histocompatibilidad densa en genes y su comparación con el ratón" . Genome Research . 13 (12): 2621–36 . doi : 10.1101/gr.1736803 . PMC 403804. PMID 14656967 .  
  • Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (enero de 2004). "Análisis de un sistema de doble híbrido de levadura de alto rendimiento y su uso para predecir la función de las proteínas intracelulares codificadas dentro de la región MHC clase III humana". Genomics . 83 (1): 153– 67. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 . 
  • Lehner B, Sanderson CM (julio de 2004). "Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano" . Genome Research . 14 (7): 1315–23 . doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147. PMID 15231747 .  
  • Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (enero de 2005). "Perfil de inmunoafinidad de la fosforilación de tirosina en células cancerosas". Nature Biotechnology . 23 (1): 94– 101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455. S2CID 7200157 .  
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (septiembre de 2005). "Una red de interacción proteína-proteína humana: un recurso para anotar el proteoma" . Celúla . 122 (6): 957– 68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . 
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (octubre de 2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .  
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q9Y333 (proteína LSm2 similar a Sm asociada al ARNsn U6) en el PDBe-KB .