La proteína similar a Sm asociada al ARNmn U6 LSm5 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen LSM5 . [5] [6] [7]
Las proteínas similares a Sm se identificaron en una variedad de organismos basándose en la homología de secuencia con la familia de proteínas Sm (ver SNRPD2; MIM 601061). Las proteínas similares a Sm contienen el motivo de secuencia Sm , que consiste en 2 regiones separadas por un enlazador de longitud variable que se pliega como un bucle. Se cree que las proteínas similares a Sm forman un heterómero estable presente en partículas tri-snRNP, que son importantes para el empalme del pre-ARNm . [suministrado por OMIM] [7]
Referencias
- ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000106355 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000091625 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Salgado-Garrido J, Bragado-Nilsson E, Kandels-Lewis S, Seraphin B (agosto de 1999). "Las proteínas Sm y similares a Sm se ensamblan en dos complejos relacionados de origen evolutivo profundo". EMBO J . 18 (12): 3451–62. doi :10.1093/emboj/18.12.3451. PMC 1171424 . PMID 10369684.
- ^ Ingelfinger D, Arndt-Jovin DJ, Luhrmann R, Achsel T (enero de 2003). "Las proteínas humanas LSm1-7 se colocalizan con las enzimas degradadoras de ARNm Dcp1/2 y Xrnl en focos citoplasmáticos distintos". ARN . 8 (12): 1489–501. doi :10.1017/S1355838202021726. PMC 1370355 . PMID 12515382.
- ^ ab "Gen Entrez: homólogo LSM5 de LSM5, ARN nuclear pequeño U6 asociado (S. cerevisiae)".
Lectura adicional
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Hacia un mapa a escala del proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928 . PMID 15489334.
- Lehner B, Sanderson CM (2004). "Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano". Genome Res . 14 (7): 1315–23. doi :10.1101/gr.2122004. PMC 442147 . PMID 15231747.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa". Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID: 14702039.
- Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR, et al. (2003). "Cromosoma humano 7: secuencia de ADN y biología". Science . 300 (5620): 767–72. Bibcode :2003Sci...300..767S. doi :10.1126/science.1083423. PMC 2882961 . PMID 12690205.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
- Eystathioy T, Peebles CL, Hamel JC, et al. (2002). "Autoanticuerpo contra hLSm4 y el complejo LSm heptamérico en sueros anti-Sm". Arthritis Rheum . 46 (3): 726–34. doi : 10.1002/art.10220 . PMID 11920408.
- Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, et al. (2001). "Panel de interacción proteína-proteína utilizando ADNc de longitud completa de ratón". Genome Res . 11 (10): 1758–65. doi :10.1101/gr.180101. PMC 311163 . PMID 11591653.
- Friesen WJ, Dreyfuss G (2000). "Las secuencias específicas de las proteínas Sm y similares a Sm (Lsm) median su interacción con el producto génico de la enfermedad de atrofia muscular espinal (SMN)". J. Biol. Chem . 275 (34): 26370–5. doi : 10.1074/jbc.M003299200 . PMID 10851237.
- Achsel T, Brahms H, Kastner B, et al. (1999). "Un heterómero con forma de rosquilla de proteínas humanas similares a Sm se une al extremo 3' del ARNm pequeño U6, lo que facilita la formación del dúplex U4/U6 in vitro". EMBO J . 18 (20): 5789–802. doi :10.1093/emboj/18.20.5789. PMC 1171645 . PMID 10523320.