Lambdavirus

El alcance del género ha cambiado significativamente en su evolución. Originalmente un grupo de todos los llamados fagos lambdoides (sinónimos virus tipo Lambda , fagos tipo Lambda , grupo de fagos Lambda ), su alcance se ha reducido significativamente.

• HK022 y HK97 fueron abolidos en 1995, pero readmitidos en 2004 en este género. En 2017 se convirtieron en el género Hk97virus . ^{[ 8 ]} En 2018, HK022 fue trasladado a Hendrixvirus mediante un cambio de nombre del género. En 2019, HK022 fue trasladado a su propio género, Shamshuipovirus . ^{[ 9 ]}
• PA2 fue abolido en una fecha desconocida y readmitido en 2016 en el género Tl2011virus . En 2018 fue trasladado a Oslovirus mediante un cambio de nombre del género. ^{[ 10 ]}
• Los genes phiD328 y phi80 no aparecen en ninguna parte de la taxonomía ICTV de 2024.

Dada la historia anterior, el documento más reciente que define el límite del género es el documento de 2017 que creó Hk97virus . Desafortunadamente, el documento no aborda específicamente los criterios de inclusión para Lambdavirus , solo la evidencia de que su nuevo género es monofilético y razonablemente similar entre sí. La única parte que muestra la similitud entre los miembros de Lambdavirus fue en la figura 2, un análisis BLASTN de Gegenees usando una ventana de 100 pb y un deslizamiento de 50 pb. La similitud de Gegenees más baja entre los miembros del grupo fue del 62,5 %. ^{[ 11 ]} La directriz general del Subcomité de Virus Bacterianos y Arqueales del ICTV en 2017 fue del 50 % de similitud de nucleótidos. ^{[ 12 ]}

El término fago lambdoide sigue siendo de uso común. Originalmente consistía en una definición operativa de "fagos que pueden recombinarse con lambda y formar un fago recombinante funcional". El término se amplió ligeramente en la era genómica para referirse a fagos que tienen un orden de genes funcionales suficientemente similar y al menos alguna región de homología, de modo que, si hipotéticamente se recombinaran con lambda, formarían un fago funcional con todos los genes necesarios. ^{[ 13 ]} La posibilidad de recombinación no implica necesariamente un ancestro común reciente, y el carácter aparentemente recombinante de P22 agrava el problema. ^{[ 14 ]} Entre los fagos que se han denominado lambdoides se incluyen miembros tan diversos como Lederbergvirus P22 , Byrnievirus HK97 , Salmonella phage ES18, Salmonella phage Gifsy-2 y Traversvirus tv933W . ^{[ 15 ]}