Lipothrixviridae

Lipothrixviridae es una familia de virus del orden Ligamenvirales . Las arqueas termófilas del filo Thermoproteota sirven como huéspedes naturales. ^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]}

Los siguientes géneros y especies se asignan a la familia: ^{[ 2 ]}

• Virus alfalipotrix
• Virus betalipotrix
• Deltalipotrixvirus

La familia consta de tres géneros: Alphalipothrixvirus , Betalipothrixvirus y Deltalipothrixvirus . Captovirus solía estar en esta familia como el género Gammalipothrixvirus, pero ahora es el único género en la familia Ungulaviridae . ^{[ 6 ] [ 7 ]} Se clasifican en géneros según sus propiedades genómicas y la diversidad de sus apéndices terminales, que participan en el reconocimiento de la célula huésped. El género propuesto originalmente, Alphalipothrixvirus , fue renombrado Alphatristromavirus y trasladado a la familia Tristromaviridae . ^{[ 8 ] [ 9 ]} En 2020, el género Alphalipothrixvirus fue recreado para la clasificación del virus filamentoso Sulfolobus 1 ^{[ 10 ]} y el virus filamentoso Sulfolobales Beppu 2. ^{[ 11 ]}

En el género Gammalipothrixvirus se encuentran estructuras en forma de garra en ambos extremos del virión. ^{[ 12 ]}

Los miembros de la familia Lipothrixviridae comparten características estructurales y genómicas con virus de la familia Rudiviridae , que incluye virus con forma de varilla sin envoltura. Los virus de ambas familias poseen genomas de ADN bicatenario lineal y comparten hasta nueve genes. Además, las partículas filamentosas de rudivirus y lipotrixvirus están formadas por proteínas de la cápside mayor homólogas y estructuralmente similares. Debido a estas propiedades compartidas, los virus de ambas familias se clasifican en el orden Ligamenvirales . ^{[ 13 ]}

Los miembros de los Ligamenvirales están estructuralmente relacionados con los virus de la familia Tristromaviridae que, al igual que los lipotrixvirus, están envueltos y codifican dos proteínas de la cápside principales parálogas con el mismo plegamiento que las de los ligamenvirus. ^{[ 14 ]} Debido a estas similitudes estructurales, se propuso unificar el orden Ligamenvirales y la familia Tristromaviridae dentro de una clase 'Tokiviricetes' (toki significa 'hilo' en georgiano y viricetes es un sufijo oficial para una clase de virus). ^{[ 14 ]}

Los virus son filamentosos y están envueltos. La cápside varía considerablemente en longitud (410–1950 nanómetros [nm]) y tiene  un diámetro de 24–38 nm. La envoltura tiene una estructura de bicapa e incluye lípidos de tetraéteres de difitanilo. ^{[ 1 ] [ 12 ]} La cápside es alargada con un núcleo de nucleocápside helicoidal. En los extremos del virión hay protuberancias en forma de garra. ^{[ 12 ]}

Hay dos proteínas de la cápside principales (MCP1 y MCP2). MCP1 y MCP2 forman un heterodímero que se enrolla alrededor del genoma de ADN bicatenario lineal, transformándolo en la forma A. La interacción entre el genoma y las MCP conduce a la condensación del genoma en la superhélice del virión. ^{[ 10 ] [ 15 ] [ 16 ]} Los genomas son lineales, de hasta 40 kb de longitud. ^{[ 1 ]}

La replicación viral es citoplasmática. La entrada en la célula huésped se logra mediante adsorción a la misma. Se descubrió que el virus filamentoso Acidianus 1 se une a apéndices celulares similares a pili. La transcripción se realiza mediante una plantilla de ADN. Las arqueas son el huésped natural. Las vías de transmisión son por difusión pasiva. ^{[ 1 ]}

Se ha estudiado el ensamblaje y la liberación de viriones en el caso del virus filamentoso Sulfolobus islandicus (SIFV). Los viriones se ensamblan dentro de la célula. La unión de los dímeros de la proteína principal de la cápside al genoma de ADN bicatenario lineal conduce al ensamblaje de nucleocápsides, que posteriormente se envuelven intracelularmente mediante un mecanismo desconocido. ^{[ 17 ]} Es probable que todos los lipotrixvirus sean virus líticos. En el caso de los betalipotrixvirus y deltalipotrixvirus, los viriones se liberan a través de portales piramidales, denominados pirámides asociadas al virus (VAP). Las VAP del SIFV tienen una base hexagonal (es decir, están construidas a partir de seis facetas triangulares). ^{[ 17 ]}

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• Viralzone : Lipothrixviridae