Lou Xin Zhang

Louxin Zhang es un biólogo computacional y matemático canadiense. Es profesor en el Departamento de Matemáticas de la Universidad Nacional de Singapur . ^{[ 1 ]}

Sus intereses de investigación incluyen la biología computacional, la bioinformática y las matemáticas discretas. Su trabajo ha examinado temas en la teoría de semigrupos combinatorios , así como enfoques matemáticos para árboles filogenéticos y redes filogenéticas . Zhang también ha contribuido a la investigación sobre semillas espaciadas utilizadas en métodos de comparación de secuencias dentro de la bioinformática. ^{[ 2 ]}

Louxin Zhang creció en Luoyang, Henan, China . Completó sus estudios de pregrado y maestría en matemáticas en la Universidad de Lanzhou . Posteriormente se trasladó a Canadá para realizar estudios de doctorado en informática en la Universidad de Waterloo . Zhang obtuvo su doctorado en informática por la Universidad de Waterloo con una tesis titulada "Emulaciones e incrustaciones de mallas de árboles e hipercubos de camarillas".

Tras completar su investigación postdoctoral bajo la dirección de Ming Li , Zhang inició su carrera de investigación independiente en 1996 en el Instituto de Ciencias de Sistemas , ahora parte del Instituto de Investigación de Infocomunicaciones. En 1997, recibió una beca postdoctoral Lee Kuan Yew de tres años. ^{[ 3 ]}

Durante su trayectoria investigadora, Zhang ha trabajado en temas de informática teórica y biología computacional. Sus estudios han introducido la aplicación de técnicas de reescritura de cadenas al problema de la palabra y al problema de la conjugación en monoides especiales . ^{[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]} También ha llevado a cabo investigaciones sobre árboles filogenéticos y redes filogenéticas, incluyendo trabajos sobre el método de descomposición de componentes de árboles desarrollado con colaboradores. ^{[ 7 ]}

El trabajo de Zhang también ha examinado modelos evolutivos que involucran pérdida de genes , duplicación de genes y clasificación incompleta de linajes. La técnica se ha utilizado para estudiar problemas relacionados con la contención de árboles, el conteo exacto y asintótico de redes de nodos hijos de árboles y métodos para inferir filogenias mínimas. Su investigación también ha abordado semillas espaciadas para la comparación de secuencias y métodos para reconstruir secuencias genómicas ancestrales. ^{[ 8 ]}

Zhang es autor y coautor de numerosas publicaciones en los campos de la biología computacional, la filogenética y el diseño de algoritmos. Entre sus trabajos más destacados se incluyen:

• Zhang L. 1991. Conjugación en monoides especiales. Journal of Algebra 143: 487-497.
• Zhang, Louxin (noviembre de 2011). "De árboles genéticos a árboles de especies II: inferencia de árboles de especies minimizando eventos de coalescencia profunda" . IEEE /ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics . 8 (6): 1685– 1691. Bibcode : 2011ITCBB...8.1685Z . doi : 10.1109/TCBB.2011.83 . ISSN 1557-9964 . PMID 21576759. S2CID 226872 .   
• Zheng, Yu; Zhang, Louxin (17 de agosto de 2017). "Reconciliación con árboles genéticos no binarios: una revisión" . Journal of the ACM . 64 (4): 24:1–24:28. doi : 10.1145/3088512 . ISSN 0004-5411 . S2CID 7715566 .  
• Gunawan, Andreas DM; DasGupta, Bhaskar; Zhang, Louxin (2017-02-01). "Un teorema de descomposición y dos algoritmos para redes visibles mediante reticulación" . Information and Computation . 252 : 161–175 . doi : 10.1016/j.ic.2016.11.001 . ISSN 0890-5401 . 
• Zhang, Louxin; Abhari, Niloufar; Colijn, Caroline; Wu, Yufeng (2023-01-03). "Un método rápido y escalable para inferir redes filogenéticas a partir de árboles mediante la alineación de cadenas de taxones de linaje". arXiv : 2301.00992 [ q-bio.PE ].