TRAPPC14

TRAPPC14 (subunidad 14 del complejo de partículas de proteína de tráfico), también conocida como MAP11 (proteína asociada a microtúbulos 11), es una proteína que en los humanos está codificada por el gen TRAPPC14 . Anteriormente se la conocía con el nombre genérico C7orf43 . ^[5] C7orf43 no tiene otro alias humano, pero en ratones se puede encontrar como BC037034. ^[6]

En los humanos, MAP11 se encuentra en el brazo largo del cromosoma humano 7 (7q22.1) y está en la cadena negativa (antisentido). ^[5] Los genes ubicados alrededor de C7orf43 incluyen GAL3ST4 , LAMTOR4, GPC2 . ^[5] En los humanos, C7orf43 tiene 9 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) comunes detectados , todos los cuales se encuentran en regiones no codificantes y, por lo tanto, no afectan la secuencia de aminoácidos. ^[7]

MAP11 codifica 2 isoformas , siendo la más larga la isoforma 1 de C7orf43, que tiene 2585 pares de bases de longitud y 11 exones y 10 intrones . ^[5] La isoforma 1 de C7orf43 codifica una proteína que tiene 580 aminoácidos de longitud y solo tiene un sitio de poliadenilación. ^[5] La isoforma 2 de C7orf43 tiene 2085 pares de bases de longitud y codifica una proteína de 311 aminoácidos. Se han informado dos isoformas adicionales en varias ocasiones, que codifican proteínas con 199 y 206 aminoácidos. ^[8]

MAP11 tiene una expresión moderada generalizada con variabilidad de tejido a tejido en humanos y en especies de mamíferos . ^{[9] [10]} Se ha demostrado que el ortólogo C7orf43 del ratón se expresa de forma ubicua en el cerebro , ^[11] así como en el sistema nervioso central embrionario del ratón . ^[12]

MAP11 tiene una región promotora aguas arriba de su sitio de transcripción, como predijo Genomatix. Este promotor tiene 657 pares de bases de longitud y está ubicado en la posición 99756182 a 99756838 en la cadena negativa del cromosoma 7. ^[13] Hay varios sitios de unión de factores de transcripción ubicados en este promotor, incluidos sitios de unión para dedos de zinc y factores de transcripción similares a Kruppel . ^[14] Los 20 principales sitios de unión de transcripción según lo predicho por ElDorado de Genomatix se enumeran en la siguiente tabla.

La proteína humana MAP11 tiene un punto isoeléctrico de 8,94. MAP11 también tiene una región rica en glicina que abarca los aminoácidos 54 a 134. ^[15] El análisis utilizando la herramienta SAPS del SDSC Biology Workbench mostró que esta región rica en glicina no está conservada en términos de posiciones específicas de residuos de glicina, pero está bien conservada en el contenido general de glicina en mamíferos y reptiles , aunque no en peces óseos . ^{[16] [17]} C7orf43 no tiene carga en su mayoría, y esta distribución de carga neutral se conserva en mamíferos y reptiles, pero los peces óseos tienen al menos un grupo de carga negativa ^{[16] [17]} Se predice que C7orf43 no tiene péptido señal en sus primeros 70 residuos de aminoácidos. Sin embargo, se predice que tiene un motivo de direccionamiento vacuolar que comienza en el residuo 258 en la proteína humana. ^[18] Se ha demostrado que este motivo de orientación vacuolar se conserva en mamíferos, reptiles, aves, anfibios y peces óseos.

La proteína MAP11 no tiene parálogos en humanos. Sin embargo, se pueden encontrar ortólogos de C7orf43 altamente conservados en mamíferos, reptiles y varias especies de peces óseos . C7orf43 también se conserva en aves, aunque varias especies de aves carecen de partes del extremo N. ^[19] No se pueden encontrar ortólogos de C7orf43 fuera del reino animal . ^[19] La siguiente tabla enumera ortólogos representativos de C7orf43 en múltiples clases de animales.

C7orf43 tiene tres sitios fosforilados , Ser 517, Thr 541 y Ser 546. ^[15] Los tres sitios están relativamente bien conservados en mamíferos, reptiles, aves, anfibios y peces óseos. La proteína no tiene N-miristoilación prevista , ya que no tiene glicina N-terminal. ^[20] Sin embargo, se predice que C7orf43 tiene una N-acetilación en un residuo de serina en el extremo N-terminal. ^[21]

La estructura secundaria de C7orf43 aún no se ha determinado. Sin embargo, se predice que C7orf43 no tiene dominio transmembrana y que eventualmente será secretado de la célula. ^{[22] [23]} Un análisis utilizando la herramienta PELE de SDSC Biology Workbench predijo principalmente láminas beta y espirales aleatorias que se conservan en todos los ortólogos estrictos. ^{[17] Se han predicho motivos} de hélice alfa conservados de manera similar , uno cerca del extremo N y otro cerca del extremo C.

Si bien ningún estudio se ha centrado en la caracterización de C7orf43, varias pruebas a gran escala han revelado información relacionada con la función de C7orf43. Un estudio que utilizó espectrometría de masas de purificación por afinidad FLAG (AP-MS) para perfilar las interacciones de proteínas en la vía de señalización de Hippo identificó a C7orf43 como una de las proteínas interactuantes. ^[24] Se descubrió que C7orf43 interactuaba con la proteína similar a la angiomotina 2 (AMOTL2) , también conocida como proteína de bobina en espiral de Leman (LCCP), un regulador de la señalización de Hippo. ^{[24] [25]} También se sabe que AMOTL2 es un inhibidor de la señalización de Wnt , una vía con asociaciones conocidas con el desarrollo del cáncer , y que es un factor para la angiogénesis , un proceso esencial para el mantenimiento del tumor y la metástasis. ^[25]

Varios estudios han vinculado a C7orf43 con eventos cancerígenos. Otros estudios también han vinculado a C7orf43 con eventos cancerígenos. Un experimento de dos híbridos de levadura a gran escala identificó a C7orf43 interactuando con la proteína transmembrana 50A (TMEM50A) , también conocida como gen 9 del cáncer cervical o proteína de membrana pequeña 1 (SMP1). ^{[26] [27] [28]} Si bien se desconoce la función exacta de TMEM50A, se ha asociado con el cáncer cervical.

C7orf43 también se ha identificado como un gen diana del factor de transcripción AP-2 gamma (TFAP2C) . ^[29] Se ha demostrado que TFAP2C está involucrado en el desarrollo, la diferenciación y la oncogénesis de los tejidos mamarios. Específicamente, TFAP2C tiene un papel en el carcinoma de mama a través de su efecto regulador sobre ESR1 y ERBB2 , ambos receptores cuyas aberraciones se han asociado con carcinomas de mama. ^{[29] [30]} También se ha demostrado que TFAP2C tiene un papel oncogénico al promover la proliferación celular y el crecimiento tumoral en el neuroblastoma . ^{[31] [32]}

Por su ubicación en el brazo q del cromosoma 7, C7orf43 se ha relacionado con diversas enfermedades. Se han descrito varias enfermedades con deleciones en el brazo q del cromosoma 7, entre ellas, trastornos mieloides, entre ellos la leucemia mieloide aguda y la mielodisplasia . ^[33]

• Ubicación del genoma humano C7orf43 y página de detalles del gen C7orf43 en el navegador de genoma de la UCSC .