MAVID

MAVID es un programa de alineación de secuencias múltiples adecuado para la alineación de un gran número de secuencias de ADN. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Las secuencias pueden ser pequeños genomas mitocondriales o grandes regiones genómicas de hasta megabases de longitud. La última versión es la 2.0.4.

El programa puede utilizarse a través del servidor web MAVID o como un programa independiente que puede instalarse junto con el código fuente.

Entrada/Salida

Este programa acepta secuencias en formato FASTA .

El formato de salida incluye: formato FASTA , Clustal , PHYLIP .

Referencias

↑ Dewey, Colin N. (2007), "Alineación de múltiples genomas completos con Mercator y MAVID", en Bergman, Nicholas H. (ed.), Genómica comparativa , Métodos en biología molecular, vol. 395, Humana Press, pp. 221–235 , doi : 10.1007/978-1-59745-514-5_14 , ISBN 978-1-58829-693-1PMID 17993677
↑ Bray, Nicolas; Pachter, Lior (2003-07-01). "Servidor de alineación múltiple MAVID" . Nucleic Acids Research . 31 (13): 3525– 3526. doi : 10.1093/nar/gkg623 . ISSN 0305-1048 . PMC 169029. PMID 12824358 .

Bray, N.; Pachter, L. (2004), "MAVID: Alineación ancestral restringida de múltiples secuencias", Genome Research , 14 (4): 693– 699, arXiv : q-bio/0311018 , doi : 10.1101/gr.1960404 , PMC 383315 , PMID 15060012 .

Enlaces externos

Servidor web MAVID

[1] Dewey, Colin N. (2007), "Alineación de múltiples genomas completos con Mercator y MAVID", en Bergman, Nicholas H. (ed.), Genómica comparativa , Métodos en biología molecular, vol. 395, Humana Press, pp. 221–235 , doi : 10.1007/978-1-59745-514-5_14 , ISBN 978-1-58829-693-1PMID 17993677

[2] Bray, Nicolas; Pachter, Lior (2003-07-01). "Servidor de alineación múltiple MAVID" . Nucleic Acids Research . 31 (13): 3525– 3526. doi : 10.1093/nar/gkg623 . ISSN 0305-1048 . PMC 169029. PMID 12824358 .

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