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MBD1

La proteína 1 del dominio de unión a metil-CpG es una proteína que en humanos está codificada por el gen MBD1 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] La proteína codificada por MBD1 se une a secuen...

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La proteína 1 del dominio de unión a metil-CpG es una proteína que en humanos está codificada por el gen MBD1 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] La proteína codificada por MBD1 se une a secuencias metiladas en el ADN y, por lo tanto, influye en la transcripción . Se une a una variedad de secuencias metiladas y parece mediar la represión de la expresión génica. Se ha demostrado que juega un papel en la modificación de la cromatina a través de la interacción con la metiltransferasa de histona H3K9 SETDB1. H3K9me3 es una modificación represiva.

Función

La metilación del ADN es la principal modificación de los genomas eucariotas y desempeña un papel esencial en el desarrollo de los mamíferos. Las proteínas humanas MECP2, MBD1, MBD2, MBD3 y MBD4 conforman una familia de proteínas nucleares relacionadas por la presencia, en cada una de ellas, de un dominio de unión a metil-CpG (MBD). Cada una de estas proteínas, con la excepción de MBD3, es capaz de unirse específicamente al ADN metilado. MECP2, MBD1 y MBD2 también pueden reprimir la transcripción de promotores génicos metilados. Cinco variantes de transcripción de MBD1 se generan mediante empalme alternativo, dando lugar a isoformas proteicas que contienen un dominio MBD, de dos a tres dominios ricos en cisteína (CXXC) y algunas diferencias en el extremo COOH. Las cinco variantes de transcripción reprimen la transcripción de promotores metilados; además, las variantes con tres dominios CXXC también reprimen la actividad de promotores no metilados. MBD1 y MBD2 se localizan muy cerca una de la otra en el cromosoma 18q21. [ 7 ]

Interacciones

Se ha demostrado que MBD1 interactúa con ATF7IP , [ 8 ] CBX5 , [ 9 ] [ 10 ] CHAF1A [ 10 ] y SUV39H1 . [ 9 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000141644 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000024561 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Cross SH, Meehan RR, Nan X, Bird A (julio de 1997). "Un componente del represor transcripcional MeCP1 comparte un motivo con las proteínas DNA metiltransferasa y HRX". Nat Genet . 16 (3): 256–9 . doi : 10.1038/ng0797-256 . PMID 9207790. S2CID 23475072 .  
  6. ↑ Hendrich B, Abbott C, McQueen H, Chambers D, Cross S, Bird A (septiembre de 1999). "Estructura genómica y mapeo cromosómico de los genes Mbd1, Mbd2, Mbd3 y Mbd4 murinos y humanos". Mamm Genome . 10 (9): 906–12 . doi : 10.1007/s003359901112 . PMID 10441743. S2CID 819148 .  
  7. 1 2 "Entrez Gene: MBD1 proteína 1 del dominio de unión a metil-CpG" .
  8. ↑ Fujita N, Watanabe S, Ichimura T, Ohkuma Y, Chiba T, Saya H, Nakao M (abril de 2003). " MCAF media la represión transcripcional dependiente de MBD1" . Mol. Cell. Biol . 23 (8): 2834–43 . doi : 10.1128/MCB.23.8.2834-2843.2003 . PMC 152570. PMID 12665582 .  
  9. 1 2 Fujita N, Watanabe S, Ichimura T, Tsuruzoe S, Shinkai Y, Tachibana M, Chiba T, Nakao M (junio de 2003). "El dominio de unión a metil-CpG 1 (MBD1) interactúa con el complejo heterocromático Suv39h1-HP1 para la represión transcripcional basada en la metilación del ADN" . J. Biol. Chem . 278 (26): 24132–8 . doi : 10.1074/jbc.M302283200 . PMID 12711603 . 
  10. 1 2 Reese BE, Bachman KE, Baylin SB, Rountree MR (mayo de 2003). "La proteína de unión a metil-CpG MBD1 interactúa con la subunidad p150 del factor de ensamblaje de cromatina 1" . Mol . Cell. Biol . 23 (9): 3226–36 . doi : 10.1128/MCB.23.9.3226-3236.2003 . PMC 153189. PMID 12697822 .  

Lecturas adicionales

  • Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de la caperuza de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 . 
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y en el extremo 5'". Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 . 
  • Hendrich B, Bird A (1998). "Identificación y caracterización de una familia de proteínas de unión a metil-CpG de mamíferos" . Mol . Cell. Biol . 18 (11): 6538– 47. doi : 10.1128/MCB.18.11.6538 . PMC 109239. PMID 9774669 .  
  • Ueba T, Kaspar B, Zhao X, Gage FH (1999). "Represión del factor de crecimiento de fibroblastos humanos 2 por un nuevo factor de transcripción" . J. Biol. Chem . 274 (15): 10382–7 . doi : 10.1074/jbc.274.15.10382 . PMID 10187827 . 
  • Fujita N, Takebayashi S, Okumura K, Kudo S, Chiba T, Saya H, Nakao M (1999). "Silenciamiento transcripcional mediado por metilación en eucromatina por isoformas de la proteína de unión a metil-CpG MBD1" . Mol . Cell. Biol . 19 (9): 6415–26 . doi : 10.1128/MCB.19.9.6415 . PMC 84611. PMID 10454587 .  
  • Ohki I, Shimotake N, Fujita N, Nakao M, Shirakawa M (2000). "Estructura en solución del dominio de unión a metil-CpG del represor transcripcional dependiente de metilación MBD1" . EMBO J. 18 ( 23): 6653–61 . doi : 10.1093/emboj/ 18.23.6653 . PMC 1171728. PMID 10581239 .  
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  • Fujita N, Shimotake N, Ohki I, Chiba T, Saya H, Shirakawa M, Nakao M (2000). "Mecanismo de regulación transcripcional por la proteína de unión a metil-CpG MBD1" . Mol . Cell. Biol . 20 (14): 5107–18 . doi : 10.1128/MCB.20.14.5107-5118.2000 . PMC 85960. PMID 10866667 .  
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  • Reese BE, Bachman KE, Baylin SB, Rountree MR (2003). "La proteína de unión a metil-CpG MBD1 interactúa con la subunidad p150 del factor de ensamblaje de cromatina 1" . Mol. Cell. Biol . 23 (9 ) : 3226–36 . doi : 10.1128/MCB.23.9.3226-3236.2003 . PMC 153189. PMID 12697822 .  
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  • Carney RM, Wolpert CM, Ravan SA, Shahbazian M, Ashley-Koch A, Cuccaro ML, Vance JM, Pericak-Vance MA (2003). "Identificación de mutaciones de MeCP2 en una serie de mujeres con trastorno autista". Pediatr. Neurol . 28 (3): 205– 11. doi : 10.1016/S0887-8994(02)00624-0 . PMID 12770674 . 
  • Georgel PT, Horowitz-Scherer RA, Adkins N, Woodcock CL, Wade PA, Hansen JC (2003). "Compactación de la cromatina por MeCP2 humano. Ensamblaje de nuevas estructuras secundarias de cromatina en ausencia de metilación del ADN" . J. Biol. Chem . 278 (34): 32181–8 . doi : 10.1074/jbc.M305308200 . PMID 12788925 . 
  • Watanabe S, Ichimura T, Fujita N, Tsuruzoe S, Ohki I, Shirakawa M, Kawasuji M, Nakao M (2004). "El dominio 1 de unión al ADN metilado y la metilpurina-ADN glicosilasa vinculan la represión transcripcional y la reparación del ADN en la cromatina" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 100 (22): 12859–64 . doi : 10.1073/pnas.2131819100 . PMC 240709. PMID 14555760 .  
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