Articulo de referencia

Maleato isomerasa

En enzimología , una maleato isomerasa ( EC 5.2.1.1), o maleato cis-tran isomerasa, es un miembro de la superfamilia de las racemasas Asp/Glu descubiertas en bacterias. Es respo...

En enzimología , una maleato isomerasa ( EC 5.2.1.1), o maleato cis-tran isomerasa, es un miembro de la superfamilia de las racemasas Asp/Glu descubiertas en bacterias. Es responsable de catalizar la isomerización cis-trans del doble enlace C2-C3 en el maleato para producir fumarato , [1] que es un intermediario crítico en el ciclo del ácido cítrico . [2] La presencia de un mercaptano exógeno es necesaria para que se produzca la catálisis. [3]

Ilustración de la isomerización global catalizada por la maleato isomerasa

La maleato isomerasa participa en el metabolismo del butanoato y del nicotinato y la nicotinamida . [4] Es una enzima esencial para el último paso de la vía de degradación metabólica del ácido nicotínico . Recientemente, la maleato isomerasa ha sido un objetivo industrial para la degradación de los desechos del tabaco. [5] [6] También ha recibido atención por su participación en la producción de ácido aspártico y ácido maleico . [7] [8] [9]

La maleato isomerasa ha sido utilizada por múltiples especies de bacterias, incluidas Pseudomonas fluorescens , [3] Alcaligenes faecalis , [10] Bacillus stearothermophilus , [11] Serratia marcescens [8] , Pseudomonas putida [12] y Nocardia farcinica . [1] [5] La enzima tiene un peso molecular de 74.000 y un número de recambio de 1.800 moles por mol de proteína por minuto. [3]

Estructura

De manera análoga a otros miembros de la racemasa Asp/Glu, la maleato isomerasa está formada por dos protómeros idénticos , con una superficie de dimerización plana. [13] [14] Cada protómero de la maleato isomerasa tiene dos dominios conectados por una simetría pseudo-doble, y cada dominio contribuye con una cisteína catalítica, que es crucial para la actividad de la isomerasa en el sitio activo. [5] El experimento muestra que la sustitución de cualquiera de las cisteínas por serina reduce significativamente la velocidad de reacción de la enzima. [1]

Además de las cisteínas catalíticas, algunos otros residuos en el sitio activo son importantes para el reconocimiento del sustrato y ayudan a estabilizar los intermediarios de reacción. [5] [1] Por ejemplo, la maleato isomerasa de Pseudomonas putida S16 utiliza Asn17 y Asn169 para formar enlaces de hidrógeno con el grupo carboxilato del maleato distal a Cys82. [5] Tyr139 forma enlaces de hidrógeno con el grupo carboxilato del maleato proximal a Cys82. [5] Pro14 y Val84 realizan interacciones de van der Waals con los átomos de carbono C2 y C3 del maleato. [5]

Mecanismo

Se considera que el mecanismo de la maleato isomerasa es similar al de otros miembros de la racemasa Asp/Glu, aunque no se ha comprendido completamente. Un mecanismo de reacción propuesto para la maleato isomerasa de Nocardia farcinia es el siguiente. [1] [9] En el sitio activo de la maleato isomerasa, Cys76 se desprotona primero para actuar más fácilmente como nucleófilo. [1] El átomo de azufre de la Cys76 desprotonada luego lleva a cabo un ataque nucleofílico directo al átomo C2 del maleato, uniéndose covalentemente al átomo C2. [9] [1] Al mismo tiempo, el protón tiol de Cys194 se transfiere al átomo C3 del maleato para formar un intermediario succinil-cisteína. [9] [1] Luego, el enlace simple C2–C3 recién formado se rota, con el enlace Cys76S–C2 disociado y el átomo C3 del maleato desprotonado por Cys194, formándose así fumarato con regeneración de un Cys194 neutro. [9] [1] En ciertos tipos de bacterias, el maleato parece estar completamente enterrado dentro de la cavidad de la maleato isomerasa y no se puede ver en la superficie de la enzima. [5]

Un mecanismo de reacción propuesto de la maleato isomerasa (C1, C2, C3, C4 son los cuatro átomos de carbono del maleato de arriba a abajo)

Relevancia industrial

La maleato isomerasa se puede utilizar para producir ácido fumárico, un material fundamental para las reacciones de polimerización y esterificación , a partir de la isomerización del ácido maleico. [7] El ácido maleico se produce a partir del anhídrido maleico . [7]

El ácido maleico también se puede convertir en ácido fumárico mediante isomerización cis - trans térmica o catalítica . [15] [16] Sin embargo, estos métodos de conversión se producen a altas temperaturas que provocan la formación de subproductos a partir de los ácidos maleico y fumárico, como resultado, los rendimientos están por debajo de los rendimientos de equilibrio. [17] Este problema fue la principal motivación para la estrategia enzimática alternativa con maleato isomerasa que facilitaría la isomerización sin subproductos. [7]

Se sabe que, incluso a temperaturas moderadas, la maleato isomerasa natural es inestable. [18] Por esa razón, se diseñan y aplican maleato isomerasas termoestables. [7] Por ejemplo, se utilizaron maleato isomerasas termoestables derivadas de Bacillus stearothermophilus, Bacillus brevis y Bacillus sporothermodurans para mejorar el proceso. [7] [17] En un estudio que utilizó Pseudomonas alcaligenes XD-1, la tasa de conversión de ácido maleico en ácido fumárico podría alcanzar un 95%. [19] [20] [7]

Referencias

  1. ^ abcdefghi Fisch F, Fleites CM, Delenne M, Baudendistel N, Hauer B, Turkenburg JP, Hart S, Bruce NC, Grogan G (agosto de 2010). "Un intermediario covalente similar a la succinilcisteína en la transformación catalizada por enzimas de maleato a fumarato por la maleato isomerasa". Journal of the American Chemical Society . 132 (33): 11455–7. doi :10.1021/ja1053576. PMID  20677745.
  2. ^ Tanaka K, Kobayashi K, Ogasawara N (septiembre de 2003). "El sistema de dos componentes YufLM de Bacillus subtilis regula la expresión de los transportadores de malato MaeN (YufR) e YflS, y es esencial para la utilización de malato en un medio mínimo". Microbiología . 149 (Pt 9): 2317–29. doi : 10.1099/mic.0.26257-0 . PMID  12949159.
  3. ^ abc Scher W, Jakoby WB (abril de 1969). "Maleato isomerasa". Revista de química biológica . 244 (7): 1878–82. doi : 10.1016/S0021-9258(18)91762-X . PMID  5780844.
  4. ^ Behrman EJ, Stanier RY (octubre de 1957). "La oxidación bacteriana del ácido nicotínico". The Journal of Biological Chemistry . 228 (2): 923–45. doi : 10.1016/S0021-9258(18)70671-6 . PMID  13475371.
  5. ^ abcdefgh Chen D, Tang H, Lv Y, Zhang Z, Shen K, Lin K, Zhao YL, Wu G, Xu P (marzo de 2013). "Estudios estructurales y computacionales de la maleato isomerasa de Pseudomonas putida S16 revelan un movimiento respiratorio que envuelve el sustrato en su interior". Microbiología molecular . 87 (6): 1237–44. doi : 10.1111/mmi.12163 . PMID  23347155. S2CID  13313674.
  6. ^ Tang H, Yao Y, Wang L, Yu H, Ren Y, Wu G, Xu P (2012). "Análisis genómico de Pseudomonas putida: los genes en una isla del genoma son cruciales para la degradación de la nicotina". Scientific Reports . 2 : 377. doi :10.1038/srep00377. PMC 3332521 . PMID  22530095. 
  7. ^ abcdefg Roa Engel CA, Straathof AJ, Zijlmans TW, van Gulik WM, van der Wielen LA (marzo de 2008). "Producción de ácido fumárico por fermentación". Microbiología y Biotecnología Aplicadas . 78 (3): 379–89. doi :10.1007/s00253-007-1341-x. PMC 2243254 . PMID  18214471. 
  8. ^ ab Hatakeyama K, Goto M, Kobayashi M, Terasawa M, Yukawa H (julio de 2000). "Análisis de la sensibilidad a la oxidación de la isomerasa cis-trans de maleato de Serratia marcescens". Biociencia, biotecnología y bioquímica . 64 (7): 1477–85. doi :10.1271/bbb.64.1477. PMID  10945267.
  9. ^ abcde Dokainish HM, Ion BF, Gauld JW (junio de 2014). "Investigaciones computacionales sobre el mecanismo catalítico de la maleato isomerasa: el papel de los residuos de cisteína del sitio activo". Química física Química Física . 16 (24): 12462–74. doi :10.1039/c4cp01342e. PMID  24827730.
  10. ^ Hatakeyama K, Asai Y, Uchida Y, Kobayashi M, Terasawa M, Yukawa H (octubre de 1997). "Clonación de genes y caracterización de maleato cis-trans isomerasa de Alcaligenes faecalis". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 239 (1): 74–9. doi :10.1006/bbrc.1997.7430. PMID  9345272.
  11. ^ Hatakeyama K, Goto M, Uchida Y, Kobayashi M, Terasawa M, Yukawa H (marzo de 2000). "Análisis molecular de la isomerasa cis-trans de maleato de bacterias termófilas". Biociencia, biotecnología y bioquímica . 64 (3): 569–76. doi :10.1271/bbb.64.569. PMID  10803955. S2CID  43798064.
  12. ^ Jiménez JI, Canales A, Jiménez-Barbero J, Ginalski K, Rychlewski L, García JL, Díaz E (agosto de 2008). "Descifrando los determinantes genéticos para la degradación aeróbica del ácido nicotínico: el grupo nic de Pseudomonas putida KT2440". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (32): 11329–34. doi : 10.1073/pnas.0802273105 . PMC 2516282 . PMID  18678916. 
  13. ^ Ruzheinikov SN, Taal MA, Sedelnikova SE, Baker PJ, Rice DW (noviembre de 2005). "Cambios conformacionales inducidos por sustrato en la glutamato racemasa de Bacillus subtilis y sus implicaciones para el descubrimiento de fármacos". Estructura . 13 (11): 1707–13. doi : 10.1016/j.str.2005.07.024 . PMID  16271894.
  14. ^ Ohtaki A, Nakano Y, Iizuka R, Arakawa T, Yamada K, Odaka M, Yohda M (marzo de 2008). "Estructura de la aspartato racemasa complejada con un análogo de sustrato dual, ácido cítrico, e implicaciones para el mecanismo de reacción". Proteins . 70 (4): 1167–74. doi :10.1002/prot.21528. PMID  17847084. S2CID  38854552.
  15. ^ Lohbeck K, Haferkorn H, Fuhrmann W, Fedtke N (2000). Enciclopedia de química industrial de Ullmann . Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA. doi :10.1002/14356007.a16_053. ISBN 978-3-527-30673-2.
  16. ^ Otsuka K (enero de 1961). "Isomerización de ácido maleico a ácido fumárico mediante isomerasa cis-trans". Química agrícola y biológica . 25 (9): 726–730. doi : 10.1271/bbb1961.25.726 .
  17. ^ ab Goto M, Nara T, Tokumaru I, Fugono N, Uchida Y, Terasawa M (febrero de 1997). "Método de producción de ácido fumárico". {{cite journal}}: Requiere citar revista |journal=( ayuda )
  18. ^ Takamura Y, Takamura T, Soejima M, Uemura T (enero de 1969). "Estudios sobre la síntesis inducida de maleato cis-trans isomerasa por malonato: Parte III. Purificación y propiedades de maleato cis-trans isomerasa inducida por malonato". Revista de química agrícola y biológica . 33 (5): 718–728. doi :10.1080/00021369.1969.10859369.
  19. ^ Nakajima-Kambe, Toshiaki; Nozue, Takehiro; Mukouyama, Masaharu; Nakahara, Tadaatsu (enero de 1997). "Bioconversión de ácido maleico en ácido fumárico por la cepa XD-1 de Pseudomonas alcaligenes". Revista de Fermentación y Bioingeniería . 84 (2): 165–168. doi :10.1016/S0922-338X(97)82549-4.
  20. ^ Ichikawa, Sosaku; Iino, Tomoko; Sato, Seigo; Nakahara, Tadaatsu; Mukataka, Sukekuni (enero de 2003). "Mejora de la tasa de producción y el rendimiento de ácido fumárico a partir de ácido maleico mediante tratamiento térmico de la cepa XD-1 de Pseudomonas alcaligenes". Revista de Ingeniería Bioquímica . 13 (1): 7–13. doi :10.1016/S1369-703X(02)00080-3.
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