El software de espectrometría de masas se utiliza para la adquisición, el análisis o la representación de datos en espectrometría de masas .
Software de proteómica
En la espectrometría de masas de proteínas, se utilizan experimentos de espectrometría de masas en tándem (también conocida como MS/MS o MS² ) para la identificación de proteínas y péptidos . Los algoritmos de identificación de péptidos se dividen en dos grandes categorías: búsqueda en bases de datos y búsqueda de novo . La primera se realiza sobre una base de datos que contiene todas las secuencias de aminoácidos que se supone que están presentes en la muestra analizada. En cambio, la segunda infiere secuencias de péptidos sin necesidad de conocer datos genómicos .
Algoritmos de búsqueda en bases de datos
Algoritmos de secuenciación de novo
Los algoritmos de secuenciación de péptidos de novo se basan, en general, en el enfoque propuesto en Bartels et al. (1990). [ 27 ]
Algoritmos de búsqueda por homología
cuantificación de péptidos mediante MS/MS
Otro software
Véase también
- Formato de datos de espectrometría de masas : para obtener una lista de visores de datos de espectrometría de masas y convertidores de formato.
- Lista de software de predicción de estructura de proteínas
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Enlaces externos
- Software de espectrometría de masas
- Proteómica
- Listados de software bioinformático