Mathieu Daniel Blanchette es biólogo computacional y director de la Escuela de Ciencias de la Computación de la Universidad McGill . Su investigación se centra en el desarrollo de nuevos algoritmos para la detección de regiones funcionales en secuencias de ADN . [ 1 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]
Educación
Blanchette estudió matemáticas e informática a nivel de licenciatura (1997), antes de estudiar informática a nivel de maestría (1998), ambas en la Université de Montréal . Obtuvo su doctorado en la Universidad de Washington en 2002, bajo la supervisión de Martin Tompa. [ 2 ] [ 11 ] Su tesis, titulada Algorithms for phylogenetic footprinting , [ 2 ] presentó el primer algoritmo razonable para la filogenia del orden de los genes y profundizó en el phylogenetic footprinting . [ 12 ] Posteriormente, trabajó como investigador postdoctoral en el Center for Biomolecular Science and Engineering de la Universidad de California, Santa Cruz , trabajando con David Haussler . [ 11 ] [ 12 ]
Investigación
Blanchette se convirtió en profesor asociado de la Facultad de Informática de la Universidad McGill en 2002. Su investigación [ 1 ] [ 4 ] [ 5 ] se centra en el desarrollo de métodos computacionales para detectar regiones funcionales en secuencias de ADN. Su trabajo postdoctoral desarrolló algoritmos para reconstruir genomas ancestrales de mamíferos. Su trabajo reciente continúa esta línea, particularmente en lo que respecta al desarrollo de algoritmos para inferir la regulación génica. [ 3 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]
Premios y distinciones
Blanchette recibió el Premio Overton de la ISCB en 2006, en reconocimiento a sus "contribuciones fundamentales y muy citadas en varias áreas de la bioinformática". [ 12 ] Recibió una beca de investigación Sloan en 2007. [ 16 ]
Blanchette ha formado parte del Consejo Editorial de la revista Genome Research y, desde 2014, forma parte del Consejo Editorial de la revista Algorithms for Molecular Biology . [ 11 ] [ 17 ]
Referencias
- 1 2 3 Publicaciones de Mathieu Blanchette indexadas por Google Académico
- 1 2 3 Blanchette, Mathieu Daniel (2002). Algoritmos para la huella filogenética (tesis doctoral). Universidad de Washington. ProQuest 305515226 .
- 1 2 "Mathieu Blanchette - Profesor asistente, Escuela de Ciencias de la Computación, Universidad McGill" . Consultado el 2 de marzo de 2014 .
- 1 2 Mathieu Blanchette en el servidor de bibliografía DBLP
- 1 2 Publicaciones de Blanchette, Mathieu indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (Se requiere suscripción)
- ↑ Blanchette, M.; Kent, WJ; Riemer, C.; Elnitski, L.; Smit, AF; Roskin, KM; Baertsch, R.; Rosenbloom, K.; Clawson, H.; Green, ED; Haussler, D.; Miller, W. (2004). " Alineación de múltiples secuencias genómicas con el alineador de conjuntos de bloques enhebrados" . Genome Research . 14 (4): 708– 715. doi : 10.1101/gr.1933104 . PMC 383317. PMID 15060014 .
- ↑ Thomas, JW; Touchman, JW; Blakesley, RW; Bouffard, GG; Beckstrom-Sternberg, SM; Margulies, EH; Blanchette, M; Siepel, AC; Thomas, PJ; McDowell, JC; Maskeri, B; Hansen, NF; Schwartz, MS; Weber, RJ; Kent, WJ; Karolchik, D; Bruen, TC; Bevan, R; Cutler, DJ; Schwartz, S; Elnitski, L; Idol, JR; Prasad, AB; Lee-Lin, SQ; Maduro, VV; Summers, TJ; Portnoy, ME; Dietrich, NL; Akhter, N; et al. (2003). "Análisis comparativos de secuencias multiespecie de regiones genómicas específicas" . Nature . 424 (6950): 788– 93. Bibcode : 2003Natur.424..788T . doi : 10.1038/nature01858 . PMID 12917688 . S2CID 2419233 .
- ↑ Blanchette, M; Tompa, M (2002). "Descubrimiento de elementos reguladores mediante un método computacional para el análisis filogenético de huellas" . Genome Research . 12 (5): 739– 48. doi : 10.1101/gr.6902 . PMC 186562. PMID 11997340 .
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- 1 2 3 "CompleteCV-2015" (PDF) . Consultado el 26 de abril de 2021 .
- 1 2 3 4 Maisel, M. (2006). "ISCB homenajea a Michael S. Waterman y Mathieu Blanchette" . PLOS Computational Biology . 2 (8): e105. Bibcode : 2006PLSCB...2..105M . doi : 10.1371/journal.pcbi.0020105 . PMC 1526462 .

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- ↑ Blanchette, M (2012). "Aprovechamiento de genomas ancestrales de mamíferos para la predicción de sitios de unión de factores de transcripción humanos" . BMC Bioinformatics . 13 (Supl. 19): S2. doi : 10.1186/1471-2105-13-S19-S2 . PMC 3526440. PMID 23281809 .

- ↑ Chen, X; Blanchette, M (2007). "Predicción de módulos cis-reguladores específicos de tejido mediante redes bayesianas y árboles de regresión" . BMC Bioinformatics . 8 (Supl. 10): S2. doi : 10.1186/1471-2105-8-S10-S2 . PMC 2230503. PMID 18269696 .

- ↑ "McGill recibe cuatro becas Sloan" . www.mcgill.ca . Consultado el 2 de marzo de 2014 .
- ↑ "Algoritmos para biología molecular - Comité editorial" . www.almob.org . Consultado el 2 de marzo de 2014 .
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