Metafenómica

La metafenómica ^{[ 1 ]} es el estudio del fenoma de plantas u otros organismos mediante metaanálisis . Su objetivo principal es establecer las relaciones dosis-respuesta de una amplia gama de rasgos fenotípicos para un gran conjunto de factores ambientales abióticos .

Una forma popular de estudiar el efecto del ambiente en las plantas es realizar experimentos donde subgrupos de individuos de una especie de interés se exponen a diferentes niveles de un factor ambiental (por ejemplo, luz, CO₂ ₎ , mientras que todos los demás factores son similares. Estos estudios han aportado mucha información sobre cómo responden las plantas al ambiente , pero puede resultar difícil integrarlos mediante un metaanálisis clásico . Una de las razones es que los rasgos fenotípicos suelen responder al ambiente de forma no lineal. En lugar de evaluar la diferencia entre plantas cultivadas con "bajo CO₂ _" y "alto CO₂ _" , sería mejor derivar curvas de dosis-respuesta que tengan en cuenta los niveles de CO₂ a los que _se realizaron los experimentos. La metafenómica utiliza un método para calcular curvas de dosis-respuesta a partir de diversos experimentos y es aplicable a cualquier rasgo fenotípico y a muchas variables ambientales.

El núcleo del método utilizado en metafenómica consiste en escalar todos los datos fenotípicos de una especie o genotipo determinado , en todos los niveles de la variable ambiental de interés (por ejemplo, CO₂ ₎ , al valor que tienen en un valor de referencia de dicha variable (por ejemplo, una concentración de CO₂ _de 400 ppm). De esta forma, se elimina la variación inherente entre especies o genotipos en el rasgo de interés, ya que para todos los experimentos y especies, el valor escalado a 400 ppm será 1,0. Posteriormente, se pueden derivar curvas generales de dosis-respuesta ajustando ecuaciones matemáticas a los datos. ^{[ 2 ]}

Los resultados generalmente son una familia de curvas donde se comparan las curvas de dosis-respuesta para un rasgo fenotípico para una gama de diferentes variables ambientales, ^{[ 3 ]} o donde se analizan muchos rasgos fenotípicos diferentes para su respuesta a un factor ambiental. ^{[ 4 ] [ 5 ]} Esto proporciona una visión general simple y cuantitativa de las muchas formas en que las plantas u otros organismos responden a su entorno.