MethBase es una base de datos de datos de metilación de ADN derivados de datos de secuenciación de próxima generación . [ 1 ] MethBase proporciona una visualización de experimentos de secuenciación de bisulfito y de secuenciación de bisulfito de representación reducida disponibles públicamente a través del Navegador Genómico UCSC . El contenido de MethBase incluye niveles de metilación con resolución de sitio CpG único para cada sitio CpG en el genoma de interés, anotación de regiones de hipometilación frecuentemente asociadas con promotores de genes y anotación de metilación específica de alelo asociada con impronta genómica .
Véase también
Referencias
- 1 2 Song, Qiang; Decato Benjamin E; Hong Elizabeth; Zhou Meng; Fang Fang; Qu Jianghan; Garvin Tyler; Kessler Michael; Zhou Jun; Smith Andrew D (dic. 2013). "Una base de datos de metiloma de referencia y una canalización de análisis para facilitar la epigenómica integrativa y comparativa" . PLOS ONE . 8 (12) e81148. Bibcode : 2013PLoSO...881148S . doi : 10.1371/journal.pone.0081148 . PMC 3855694. PMID 24324667 .
Enlaces externos
- http://smithlabresearch.org/software/methbase
- bases de datos genéticas
- Epigenética
- ADN
- secuenciación de ADN
- Esbozos de bases de datos biológicas