Articulo de referencia

Metanosarcinales

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Methanosarcinales es un orden de Archaea en la clase Methanomicrobia , filo Methanobacteriota . [ 1 ] El orden Methanosarcinales contiene linajes metanogénicos y metanotróficos , aunque estos últimos hasta ahora no tienen representantes de cultivo puro. [ 2 ] Los linajes metanotróficos del orden Methanosarcinales se abreviaron inicialmente como ANME ( metanotrofos anaeróbicos ) para distinguirlos de las bacterias metanotróficas aerobias. Actualmente, esos linajes reciben sus propios nombres, tales como Ca. Methanoperedens, Ca. Methanocomedens (ANME-2a), Ca. Methanomarinus (ANME-2b), Ca. Methanogaster (ANME-2c), Ca. Methanovorans (ANME-3). [ 3 ] El orden contiene una arquea con uno de los genomas más grandes, Methanosarcina acetivorans C2A, con un tamaño de genoma de 5,75 Mbp. [ 4 ]

Los organismos incluidos en este orden se pueden encontrar en agua dulce, agua salada, sedimentos ricos en sal, digestores anaeróbicos y sistemas digestivos de animales. El orden consta de especies mesófilas o moderadamente termófilas, neutrófilas o alcalófilas, algunas de las cuales pueden crecer en altas concentraciones de sal (géneros Methanohalobium , Methanohalophilus y Methanosalsum ). [ 5 ] [ 6 ] La mayoría de las especies del orden se aislaron o detectaron en sedimentos marinos y de agua dulce, y en suelos, con solo unos pocos linajes especializados adaptados al tracto digestivo de los animales: los géneros Methanimicrococcus , Methanolapillus y Ca. Methanofrustulum, que se pueden encontrar en termitas/cucarachas, milpiés y rumiantes, respectivamente. [ 7 ] [ 8 ]

La mayoría de las células tienen paredes celulares que carecen de peptidoglicano y pseudomureína , con una presencia notable de metanocondroitina en el género Methanosarcina . [ 9 ] Al igual que todos los demás metanógenos, los representantes de Methanosarcinales son estrictamente anaeróbicos y utilizan la vía de la metanogénesis como única vía para la producción de ATP . Sin embargo, además de los sustratos H₂ /CO₂ comunes entre otros metanógenos , Methanosarcinales se caracteriza por la capacidad de utilizar acetato (metanogénesis aceticlástica), compuestos metilados como metanol o metilaminas (metanogénesis metilotrófica), o incluso compuestos aromáticos metoxilados (metanogénesis metoxidotrófica). [ 10 ] [ 11 ]

Filogenia

El orden Methanosarcinales contiene las siguientes familias (los géneros que componen cada familia se enumeran debajo de la familia correspondiente):

Methanosarcinaceae Balch y Wolfe 1981

  • Metanimicrococcus corrig. Sprenger et al. 2000
  • Methanococcoides Sowers y Ferry 1985
  • Metanohalobium Zhilina y Zavarzin 1988
  • Methanohalophilus Paterek y Smith 1988
  • Metanolobus König y Stetter 1983
  • Metanometilovorans Lomans et al. 2004
  • Metanosalsum Boone y Baker 2002
  • Metanosarcina Kluyver y van Niel 1936

Methanotrichaceae Akinyemi et al. 2021

  • Methanothrix Huser et al. 1983

Methermicoccaceae Cheng et al. 2007

  • Methermicoccus Cheng et al. 2007

Véase también

Referencias

  1. "Orden: Methanosarcinales" . lpsn.dsmz.de. Consultado el 7 de septiembre de 2024 .
  2. Chadwick, Grayson L.; Skennerton, Connor T.; Laso-Pérez, Rafael; Leu, Andy O.; Speth, Daan R.; Yu, Hang; Morgan-Lang, Connor; Hatzenpichler, Roland; Goudeau, Danielle; Malmstrom, Rex; Brazelton, William J.; Woyke, Tanja; Hallam, Steven J.; Tyson, Gene W.; Wegener, Gunter (2022-01-05). "La genómica comparativa revela mecanismos de transferencia de electrones y sintróficos que diferencian arqueas metanotróficas y metanogénicas" . PLOS Biology . 20 (1) e3001508. doi : 10.1371/journal.pbio.3001508 . ISSN 1545-7885 . PMC 9012536 . PMID 34986141 .   
  3. Wegener, Gunter; Laso-Pérez, Rafael; Orphan, Victoria J.; Boetius, Antje (2022-09-08). "Degradación anaeróbica de alcanos por arqueas marinas". Annual Review of Microbiology . 76 (1): 553– 577. doi : 10.1146/annurev-micro-111021-045911 . hdl : 10261/351814 . ISSN 0066-4227 . 
  4. Saini, Jasleen; Deere, Thomas M.; Chanderban, Melissa; McIntosh, Gary J.; Lessner, Daniel J. (marzo de 2023). "Methanosarcina acetivorans" . Trends in Microbiology . 31 (3): 320– 321. doi : 10.1016/j.tim.2022.10.001 . PMID 36280520 . 
  5. Oren, Aharon (2014-08-08). "Taxonomía de las arqueas halófilas: estado actual y desafíos futuros". Extremophiles . 18 (5): 825– 834. doi : 10.1007/s00792-014-0654-9 . ISSN 1431-0651 . PMID 25102811 .  
  6. Oren, Aharon (2014), "La familia Methanosarcinaceae", Los procariotas , Berlín, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, pp. 259–281 , doi : 10.1007/978-3-642-38954-2_408 , ISBN  978-3-642-38953-5
  7. Protasov, Evgenii; Reeh, Hanna; Liu, Pengfei; Poehlein, Anja; Platt, Katja; Heimerl, Thomas; Hervé, Vincent; Daniel, Rolf; Brune, Andreas (2024-08-06). "Reducción del genoma en Methanosarcinales nuevos, obligados reductores de metilo aislados de intestinos de artrópodos ( Methanolapillus gen. nov. y Methanimicrococcus )" . FEMS Microbiology Ecology . 100 (9). doi : 10.1093/femsec/fiae111 . ISSN 1574-6941 . PMC 11362671. PMID 39108084 .   
  8. Thomas, Courtney M.; Desmond-Le Quéméner, Elie; Gribaldo, Simonetta; Borrel, Guillaume (2022-06-10). "Factores que dan forma a la abundancia y diversidad del arqueoma intestinal en todo el reino animal" . Nature Communications . 13 (1): 3358. Bibcode : 2022NatCo..13.3358T . doi : 10.1038/ s41467-022-31038-4 . ISSN 2041-1723 . PMC 9187648. PMID 35688919 .   
  9. Klingl, Andreas (25-11-2014). "Capa S y membrana citoplasmática: excepciones a la pared celular arqueal típica con énfasis en las membranas dobles" . Frontiers in Microbiology . 5 : 624. doi : 10.3389/fmicb.2014.00624 . ISSN 1664-302X . PMC 4243693. PMID 25505452 .   
  10. Mand, Thomas D.; Metcalf, William W. (2019-11-20). "Conservación de energía y función de la hidrogenasa en arqueas metanogénicas, en particular el género Methanosarcina " . Microbiology and Molecular Biology Reviews . 83 (4). doi : 10.1128 / mmbr.00020-19 . ISSN 1092-2172 . PMC 6759668. PMID 31533962 .   
  11. Kurth, Julia M.; Op den Camp, Huub JM; Welte, Cornelia U. (2020-06-15). "Varias maneras, un objetivo: metanogénesis a partir de sustratos no convencionales" . Microbiología Aplicada y Biotecnología . 104 (16): 6839– 6854. doi : 10.1007/ s00253-020-10724-7 . ISSN 0175-7598 . PMC 7374477. PMID 32542472 .   
  12. "El LTP" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  13. "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  14. "Notas de la versión LTP_06_2022" (PDF) . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  15. "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  16. "ar53_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  17. "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .

Lecturas adicionales

Revistas científicas

  • Cavalier-Smith, T (2002). "El origen neomurano de las arqueobacterias, la raíz negibacteriana del árbol universal y la megaclasificación bacteriana" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 52 (Pt 1): 7–76 . doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 . 
  • Cavalier-Smith, T (1986). "Los reinos de los organismos". Nature . 324 ( 6096): 416– 417. Bibcode : 1986Natur.324..416C . doi : 10.1038/324416a0 . PMID 2431320. S2CID 5242667 .  

Libros científicos

  • Boone DR; Whitman WB; Koga Y (2001). «Orden III. Methanosarcinales ord. nov.». . En República Dominicana Boone; RW Castenholz (eds.). Manual de bacteriología sistemática de Bergey Volumen 1: Las arqueas y las bacterias fototróficas y profundamente ramificadas (2ª  ed.). Nueva York: Springer Verlag . págs.169 .​ ISBN  978-0-387-98771-2.
  • Grant WD; Kamekura M; McGenity TJ; Ventosa A (2001). "Clase III. Halobacteria class. nov." . En DR Boone; RW Castenholz (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volumen 1: The Archaea and the deeper branching and phototrophic Bacteria (2.ª  ed.). Nueva York: Springer Verlag. pp. 169 . ISBN  978-0-387-98771-2.
  • Garrity GM; Bell JA; Lilburn TG (2004). "Esquema taxonómico de los procariotas". Manual de bacteriología sistemática de Bergey, versión 4.0 (2.ª  ed.). Nueva York: Springer Verlag. doi : 10.1007/bergeysoutline200310 (inactivo el 12 de julio de 2025).{{cite book}}: CS1 maint: DOI inactivo desde julio de 2025 ( enlace ) Versión 5.0 .