
La oxidación microbiana del azufre es la oxidación del azufre por microorganismos para construir sus componentes estructurales. La oxidación de compuestos inorgánicos es la estrategia utilizada principalmente por los microorganismos quimiolitotróficos para obtener energía para sobrevivir, crecer y reproducirse. Algunas formas inorgánicas de azufre reducido, principalmente sulfuro (H 2 S/HS − ) y azufre elemental (S 0 ), pueden ser oxidadas por procariotas quimiolitotróficos oxidantes de azufre , generalmente acoplados a la reducción de oxígeno (O 2 ) o nitrato (NO 3 − ). [1] [2] Los oxidadores anaeróbicos de azufre incluyen fotolitoautótrofos que obtienen su energía de la luz solar, hidrógeno del sulfuro y carbono del dióxido de carbono (CO 2 ).
La mayoría de los oxidantes de azufre son autótrofos que pueden utilizar especies de azufre reducido como donantes de electrones para la fijación de CO2. La oxidación microbiana del azufre es un vínculo importante en el ciclo biogeoquímico del azufre en entornos que albergan abundantes especies de azufre reducido y bajas concentraciones de oxígeno, como sedimentos marinos, zonas de mínimo oxígeno (OMZ) y sistemas hidrotermales. [3]
Ecología
La oxidación del sulfuro de hidrógeno ha sido considerada uno de los procesos más importantes en el medio ambiente, dado que los océanos han tenido muy poco oxígeno y altas condiciones sulfídicas durante la mayor parte de la historia de la Tierra. Los ecosistemas análogos modernos son cuencas marinas profundas, por ejemplo en el Mar Negro, cerca de la fosa de Cariaco y la cuenca de Santa Bárbara. Otras zonas del océano que experimentan condiciones anóxicas y sulfídicas periódicas son las zonas de surgencia frente a las costas de Chile y Namibia, y los respiraderos hidrotermales, que son una fuente clave de H 2 S para el océano. [4] Los microorganismos oxidantes de azufre (SOM) están restringidos a las capas superiores de sedimentos en estos entornos, donde el oxígeno y el nitrato están disponibles. El SOM puede desempeñar un papel importante pero no considerado en el secuestro de carbono , [5] ya que algunos modelos [6] y experimentos con Gammaproteobacteria [7] [8] han sugerido que la fijación de carbono dependiente de azufre en sedimentos marinos podría ser responsable de casi la mitad de la fijación total de carbono oscuro en los océanos. Además, pueden haber sido fundamentales para la evolución de los organismos eucariotas, dado que el metabolismo del azufre podría haber impulsado la formación de las asociaciones simbióticas que los sustentaron [9] (ver más abajo).
Aunque la oxidación biológica de compuestos de azufre reducido compite con reacciones químicas abióticas (por ejemplo, la oxidación mediada por hierro del sulfuro a sulfuro de hierro (FeS) o pirita (FeS 2 )), [10] las consideraciones termodinámicas y cinéticas sugieren que la oxidación biológica supera con creces la oxidación química del sulfuro en la mayoría de los entornos. [4] Los datos experimentales del fotótrofo anaeróbico Chlorobaculum tepidum indican que los microorganismos mejoran la oxidación del sulfuro en tres o más órdenes de magnitud. [4] Sin embargo, todavía se desconoce la contribución general de los microorganismos a la oxidación total del azufre en sedimentos marinos. La SOM de Alphaproteobacteria , Gammaproteobacteria y Campylobacterota explica abundancias celulares promedio de 10 8 células/m 3 en sedimentos marinos ricos en materia orgánica. [11] Teniendo en cuenta que estos organismos tienen un rango muy estrecho de hábitats, como se explica a continuación, una fracción importante de la oxidación del azufre en muchos sedimentos marinos puede explicarse por estos grupos. [12]
Dado que las concentraciones máximas de oxígeno, nitrato y sulfuro suelen estar separadas en los perfiles de profundidad, muchos SOM no pueden acceder directamente a sus fuentes de hidrógeno o electrones (especies de azufre reducido) y fuentes de energía (O 2 o nitrato) al mismo tiempo. Esta limitación ha llevado a que los SOM desarrollen diferentes adaptaciones morfológicas. [12] Las grandes bacterias del azufre (LSB) de la familia Beggiatoaceae ( Gammaproteobacteria ) se han utilizado como organismos modelo para la oxidación del azufre bentónico. Se conocen como "organismos de gradiente" que son indicativos de condiciones hipóxicas (bajo oxígeno) y sulfídicas (ricas en especies de azufre reducido). Almacenan internamente grandes cantidades de nitrato y azufre elemental para superar la brecha espacial entre el oxígeno y el sulfuro. Algunas de las Beggiatoaceae son filamentosas y, por lo tanto, pueden deslizarse entre entornos óxicos/subóxicos y sulfídicos, mientras que las no móviles dependen de suspensiones de nutrientes, flujos o se adhieren a partículas más grandes. [12] Algunas bacterias marinas no móviles LSB son las únicas bacterias de vida libre conocidas que tienen dos vías de fijación de carbono: el ciclo de Calvin-Benson (utilizado por plantas y otros organismos fotosintéticos) y el ciclo inverso del ácido tricarboxílico . [13]
Otra estrategia evolutiva de la SOM es asociarse con organismos eucariotas móviles. La SOM simbiótica proporciona carbono y, en algunos casos, nitrógeno biodisponible al huésped, y obtiene a cambio un mejor acceso a los recursos y al refugio. Este estilo de vida ha evolucionado de forma independiente en ciliados , oligoquetos , nematodos , platelmintos y bivalvos que viven en sedimentos . [14] Recientemente, se descubrió un nuevo mecanismo de oxidación del azufre en bacterias filamentosas. Se denomina oxidación electrogénica del azufre (e-SOx) e implica la formación de puentes multicelulares que conectan la oxidación del sulfuro en capas de sedimentos anóxicos con la reducción del oxígeno o el nitrato en sedimentos superficiales óxicos, generando corrientes eléctricas a distancias de centímetros. Las llamadas bacterias del cable están muy extendidas en sedimentos marinos poco profundos, [15] y se cree que conducen electrones a través de estructuras dentro de un periplasma común del filamento multicelular, [16] un proceso que puede influir en el ciclo de elementos en las superficies de sedimentos acuáticos, por ejemplo, alterando la especiación del hierro. [17] Las bacterias LSB y de cable parecen estar restringidas a sedimentos no perturbados con condiciones hidrodinámicas estables, [18] mientras que las SOM simbióticas y sus huéspedes se han encontrado principalmente en sedimentos costeros permeables. [12]
Diversidad microbiana
La oxidación de compuestos de azufre reducidos la realizan exclusivamente Bacterias y Archaea . Todas las Archaea implicadas en este proceso son aerobias y pertenecen al Orden Sulfolobales , [19] [20] caracterizados por ser acidófilos ( extremófilos que requieren pH bajos para crecer) y termófilos (extremófilos que requieren altas temperaturas para crecer). Los más estudiados han sido los géneros Sulfolobus, una Archaea aerobia , y Acidianus, un anaerobio facultativo (es decir, un organismo que puede obtener energía ya sea por respiración aerobia o anaerobia).
Las bacterias oxidantes de azufre (SOB) son aeróbicas, anaeróbicas o facultativas, y la mayoría de ellas son autótrofos obligados o facultativos que pueden utilizar dióxido de carbono o compuestos orgánicos como fuente de carbono ( mixótrofos ). [3] Las SOB más abundantes y estudiadas se encuentran en la familia Thiobacilliaceae en ambientes terrestres, y en la familia Beggiatoaceae en ambientes acuáticos. [3] Las bacterias oxidantes de azufre aeróbicas son principalmente mesófilas , creciendo en rangos moderados de temperatura y pH, aunque algunas son termófilas y/o acidófilas. Fuera de estas familias, otras SOB descritas pertenecen a los géneros Acidithiobacillus , [21] Aquaspirillum , [22] Aquifex , [23] Bacillus , [24] Methylobacterium , [25] Paracoccus , Pseudomonas [22] Starkeya , [26] Thermithiobacillus , [21] y Xanthobacter . [22] Por otro lado, las bacterias del cable pertenecen a la familia Desulfobulbaceae de las Deltaproteobacteria y actualmente están representadas por dos géneros candidatos, “ Candidatus Electronema” y “ Candidatus Electrothrix ” [27] .
Las SOB anaeróbicas (AnSOB) son principalmente autótrofos fotosintéticos neutrófilos/mesófilos , que obtienen energía de la luz solar pero utilizan compuestos de azufre reducidos en lugar de agua como donantes de hidrógeno o electrones para la fotosíntesis . Las AnSOB incluyen algunas bacterias de azufre púrpura (Chromatiaceae) [ 28] como Allochromatium [29] y bacterias de azufre verde (Chlorobiaceae), así como las bacterias púrpuras sin azufre (Rhodospirillaceae) [30] y algunas cianobacterias . [3] Las cianobacterias AnSOB solo pueden oxidar sulfuro a azufre elemental y se han identificado como Oscillatoria , Lyngbya , Aphanotece, Microcoleus y Phormidium . [31] [32] Algunos AnSOB, como los anaerobios facultativos Thiobacillus spp. y Thermothrix sp., son quimiolitoautótrofos , lo que significa que obtienen energía de la oxidación de especies de azufre reducido, que luego se utiliza para fijar CO 2 . Otros, como algunas bacterias verdes filamentosas deslizantes (Chloroflexaceae), son mixótrofos. De todos los SOB, el único grupo que oxida directamente el sulfuro a sulfato en abundancia de oxígeno sin acumular azufre elemental son los Thiobacilli . Los otros grupos acumulan azufre elemental, que pueden oxidar a sulfato cuando el sulfuro es limitado o agotado. [3]
Bioquímica

Hay dos vías descritas para la oxidación microbiana del sulfuro:
- La vía de la sulfuro:quinona oxidorreductasa (SQR), muy extendida en las bacterias verdes del azufre, implica la formación de compuestos intermedios como el sulfito (SO 3 2- ) y el adenosín 5'-fosfosulfato (APS), [33] que se sabe que tienen un intercambio significativo de isótopos de oxígeno . [34] El paso catalizado por la SQR también puede estar mediado por una flavocitocromo c-sulfuro deshidrogenasa (FCSD) unida a la membrana. [35]
- La vía Sox, [36] o vía Kelly-Friedrich establecida en Alphaproteobacteria Paracoccus spp., mediada por el complejo multienzimático oxidante de tiosulfato (TOMES), en el que el sulfuro o el azufre elemental forman un complejo con la enzima SoxY y permanecen unidos a ella hasta su conversión final a sulfato . [37] [38] [39]
De manera similar, se han identificado dos vías para la oxidación del sulfito (SO 3 2- ):
- La vía rDsr, utilizada por algunos microorganismos de la clorobiota (bacterias verdes del azufre), Alpha , Beta y Gammaproteobacteria , en la que el sulfuro se oxida a sulfito mediante una operación inversa de la vía de reducción disimilatoria del sulfito (Dsr). El sulfito generado por rDsr es luego oxidado a sulfato por otras enzimas. [40]
- La oxidación directa del sulfito a sulfato por un tipo de enzima mononuclear del molibdeno conocida como sulfito oxidorreductasa. Se reconocen tres grupos diferentes de estas enzimas (las familias de la xantina oxidasa, la sulfito oxidasa (SO) y la dimetil sulfóxido reductasa), y están presentes en los tres dominios de la vida. [41]
Por otra parte, existen al menos tres vías para la oxidación del tiosulfato (S 2 O 3 2- ):
- La vía Sox antes mencionada, a través de la cual ambos átomos de azufre en el tiosulfato se oxidan a sulfato sin la formación de ningún intermedio libre. [37] [38] [39]
- La oxidación del tiosulfato (S 2 O 3 2- ) a través de la formación del intermedio tetrationato (S 4 O 6 2- ), que está presente en varias Gamma y Betaproteobacteria quimiolitotróficas obligadas , así como en Alphaproteobacteria quimiolitotróficas facultativas . [42]
- La vía de oxidación ramificada del tiosulfato, un mecanismo en el que se forman glóbulos insolubles en agua de azufre intermedio durante la oxidación del tiosulfato y el sulfuro. Está presente en todas las bacterias fotolitotróficas verdes y púrpuras anoxigénicas del azufre, y en las cepas de vida libre y simbióticas de ciertas bacterias quimiolitotróficas del azufre. [43]
En cualquiera de estas vías, el oxígeno es el aceptor de electrones preferido , pero en entornos con oxígeno limitado se utilizan en su lugar nitrato , formas oxidadas de hierro e incluso materia orgánica. [44]
Las cianobacterias normalmente realizan la fotosíntesis oxigénica utilizando agua como donador de electrones. Sin embargo, en presencia de sulfuro, la fotosíntesis oxigénica se inhibe y algunas cianobacterias pueden realizar la fotosíntesis anoxigénica mediante la oxidación del sulfuro a tiosulfato −utilizando el Fotosistema I con sulfito− como un posible compuesto intermedio de azufre. [45] [46]
Oxidación de sulfuro
La oxidación del sulfuro puede ocurrir en condiciones aeróbicas o anaeróbicas. Las bacterias aeróbicas oxidantes de sulfuro usualmente oxidan sulfuro a sulfato y son quimiolitoautótrofos obligados o facultativos. Estos últimos pueden crecer como heterótrofos , obteniendo carbono de fuentes orgánicas, o como autótrofos, usando sulfuro como donante de electrones (fuente de energía) para la fijación de CO 2 . [3] La oxidación del sulfuro puede ocurrir aeróbicamente por dos mecanismos diferentes: fosforilación a nivel de sustrato , que depende del monofosfato de adenosina (AMP), y fosforilación oxidativa independiente del AMP, [47] que ha sido detectada en varios Thiobacilli ( T. denitrificans , T. thioparus, T. novellus y T. neapolitanus ), así como en Acidithiobacillus ferrooxidans . [48] La arqueona Acidianus ambivalens parece poseer una vía dependiente de ADP y una independiente de ADP para la oxidación de sulfuro. [49] De manera similar, ambos mecanismos operan en el quimioautótrofo Thiobacillus denitrificans , [50] que puede oxidar sulfuro a sulfato anaeróbicamente usando nitrato como aceptor terminal de electrones [51] que se reduce a dinitrógeno (N 2 ). [52] Se identificaron otras dos cepas anaeróbicas que pueden realizar un proceso similar como similares a Thiomicrospira denitrificans y Arcobacter . [53]
Entre los SOB heterótrofos se incluyen especies de Beggiatoa que pueden crecer mixotróficamente, utilizando sulfuro para obtener energía (metabolismo autótrofo) o para eliminar peróxido de hidrógeno formado metabólicamente en ausencia de catalasa (metabolismo heterótrofo). [54] Otros organismos, como la bacteria Sphaerotilus natans [55] y la levadura Alternaria [56] son capaces de oxidar sulfuro a azufre elemental por medio de la vía rDsr. [57]
Oxidación del azufre elemental
Algunas bacterias y arqueas pueden oxidar aeróbicamente el azufre elemental a ácido sulfúrico . [3] Acidithiobacillus ferrooxidans y Thiobacillus thioparus pueden oxidar el azufre a sulfito por medio de una enzima oxigenasa, aunque se cree que también se podría utilizar una oxidasa como mecanismo de ahorro de energía. [58] Para la oxidación anaeróbica del azufre elemental, se cree que la vía Sox juega un papel importante, aunque esto aún no se entiende completamente. [39] Thiobacillus denitrificans utiliza formas oxidadas en nitrógeno como fuente de energía y aceptor terminal de electrones en lugar de oxígeno. [59]
Oxidación de tiosulfato y tetrationato
La mayoría de las bacterias autótrofas quimiosintéticas que pueden oxidar azufre elemental a sulfato también son capaces de oxidar tiosulfato a sulfato como fuente de poder reductor para la asimilación de dióxido de carbono. Sin embargo, los mecanismos que utilizan pueden variar, ya que algunas de ellas, como las bacterias fotosintéticas púrpuras, acumulan transitoriamente azufre elemental extracelular durante la oxidación de tetrationato antes de oxidarlo a sulfato, mientras que las bacterias verdes del azufre no lo hacen. [3] Se ha propuesto una reacción de oxidación directa ( T. versutus [60] ), así como otras que involucran sulfito ( T. denitrificans ) y tetrationato ( A. ferrooxidans , A. thiooxidans y Acidiphilum acidophilum [61] ) como compuestos intermedios. Algunas bacterias mixotróficas solo oxidan tiosulfato a tetrationato. [3]
El mecanismo de oxidación bacteriana del tetrationato aún no está claro y puede implicar una desproporción de azufre , durante la cual se producen tanto sulfuro como sulfato a partir de especies de azufre reducidas, y reacciones de hidrólisis. [3]
Fraccionamiento de isótopos
El fraccionamiento de isótopos de azufre y oxígeno durante la oxidación microbiana de sulfuro (MSO) se ha estudiado para evaluar su potencial como un proxy para diferenciarlo de la oxidación abiótica de azufre . [62] Los isótopos ligeros de los elementos que se encuentran más comúnmente en moléculas orgánicas, como 12 C, 16 O, 1 H, 14 N y 32 S, forman enlaces que se rompen ligeramente más fácilmente que los enlaces entre los isótopos pesados correspondientes, 13 C, 18 O, 2 H, 15 N y 34 S. Debido a que hay un menor costo energético asociado con el uso de isótopos ligeros, los procesos enzimáticos generalmente discriminan contra los isótopos pesados y, como consecuencia, se esperan fraccionamientos biológicos de isótopos entre los reactantes y los productos. Un efecto isotópico cinético normal es aquel en el que los productos se agotan en el isótopo pesado con respecto a los reactantes (baja relación isótopo pesado a isótopo ligero), y aunque este no siempre es el caso, el estudio de los fraccionamientos isotópicos entre procesos enzimáticos puede permitir rastrear la fuente del producto.
Fraccionamiento de isótopos de oxígeno
La formación de sulfato en condiciones aeróbicas implica la incorporación de cuatro átomos de oxígeno del agua, y cuando se combina con la reducción disimilatoria de nitrato (DNR) -la vía de reducción preferencial en condiciones anóxicas- puede tener una contribución de átomos de oxígeno del nitrato también. El valor de δ 18 O del sulfato recién formado depende, por lo tanto, del valor de δ 18 O del agua, el fraccionamiento isotópico asociado con la incorporación de átomos de oxígeno del agua al sulfato y un intercambio potencial de átomos de oxígeno entre los intermediarios de azufre y nitrógeno y el agua. [63] Se ha encontrado que el MSO produce pequeños fraccionamientos en 18 O en comparación con el agua (~5‰). Dada la muy pequeña fracción de 18 O que usualmente acompaña al MSO, las disminuciones relativamente mayores de 18 O del sulfato producido por el MSO acoplado a la DNR (-1.8 a -8.5 ‰) sugieren un efecto isotópico cinético en la incorporación de oxígeno del agua al sulfato y el papel del nitrato como una fuente alternativa potencial de oxígeno ligero. [63] Se ha encontrado que las fracciones de oxígeno producidas por la desproporción de azufre a partir del azufre elemental son mayores, con valores reportados de 8 a 18.4‰, lo que sugiere un efecto isotópico cinético en las vías involucradas en la oxidación del azufre elemental a sulfato, aunque se necesitan más estudios para determinar cuáles son los pasos y condiciones específicos que favorecen esta fracción. La siguiente tabla resume las fraccionaciones reportadas de isótopos de oxígeno a partir del MSO en diferentes organismos y condiciones.
Fraccionamiento de isótopos de azufre
La MSO aeróbica genera empobrecimientos en el 34 S del sulfato que se han encontrado que son tan pequeños como -1,5‰ y tan grandes como -18‰. Para la mayoría de los microorganismos y condiciones de oxidación, solo pequeños fraccionamientos acompañan la oxidación aeróbica o anaeróbica de sulfuro, azufre elemental, tiosulfato y sulfito a azufre elemental o sulfato. La oxidación fototrófica de sulfuro a tiosulfato en condiciones anóxicas también genera fraccionamientos insignificantes. Aunque el cambio en los isótopos de azufre suele ser pequeño durante la MSO, la MSO oxida formas reducidas de azufre que suelen estar empobrecidas en 34 S en comparación con el sulfato del agua de mar. Por lo tanto, la MSO a gran escala también puede cambiar significativamente los isótopos de azufre de un yacimiento. Se ha propuesto que el fraccionamiento promedio global de isótopos S observado es de alrededor de -50‰ en lugar del valor predicho teóricamente de -70‰ debido a la MSO. [69]
En los quimiolitotrofos Thiobacillus denitrificans y Sulfurimonas denitrificans , el MSO acoplado a DNR tiene el efecto de inducir las vías SQR y Sox, respectivamente. En ambos casos, se ha medido un pequeño fraccionamiento en el 34 S del sulfato, inferior a -4,3‰. El agotamiento de sulfato en 34 S a partir de MSO podría usarse para rastrear procesos de oxidación de sulfuro en el medio ambiente, aunque no permite una discriminación entre las vías SQR y Sox. [63] El agotamiento producido por MSO acoplado a DNR es similar a un agotamiento de hasta -5‰ estimado para el 34 S en el sulfuro producido a partir de rDsr. [70] [71] Por el contrario, la desproporción en condiciones anaeróbicas genera sulfato enriquecido en 34 S hasta 9‰ y ~34‰ a partir de sulfuro y azufre elemental, respectivamente. Sin embargo, el efecto isotópico de la desproporción está limitado por las tasas de reducción de sulfato y MSO. [72] Al igual que el fraccionamiento de isótopos de oxígeno, los fraccionamientos más grandes en sulfato a partir de la desproporción de azufre elemental apuntan a un paso clave o vía crítica para inducir este gran efecto isotópico cinético. La siguiente tabla resume los fraccionamientos informados de isótopos de azufre a partir de MSO en diferentes organismos y condiciones.
Véase también
- Fraccionamiento de isótopos
- Metabolismo microbiano
- Metabolismo del azufre
- Microorganismos reductores de sulfato
- Reducción disimilatoria de sulfatos
- Reducción disimilatoria de nitratos
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