Microgenomas

Los Microgenomatota o Microgenomates son un supergrupo propuesto de filos bacterianos candidatos en la Radiación de Filos Candidatos .

Los organismos del grupo Microgenomates nunca se han cultivado en un laboratorio; solo se han detectado en el medio ambiente mediante secuenciación genética.

El grupo Microgenomates fue descubierto originalmente a partir de secuencias recuperadas de la fuente termal " Obsidian Pool " del Parque Nacional de Yellowstone y se denominó OP11 . ^[²^]

El grupo se dividió más tarde en los filos bacterianos adicionales Absconditabacteria (SR1) y Parcubacteria (OD1) ^{[ 3 ]} y luego en más de 11 filos bacterianos más , ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} incluyendo Curtisbacteria , Daviesbacteria , Levybacteria , Gottesmanbacteria , Woesebacteria , Amesbacteria , Shapirobacteria , Roizmanbacteria , Beckwithbacteria , Collierbacteria , Pacebacteria .

Filogenia

Taxonomía

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) ^{[ 9 ]} y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). ^{[ 10 ]}

Clado " Radiación de filos candidatos "

Filo Minisyncoccota Nakajima et al. 2025
- Clúster del clado "Microgenomates"
  - Clase "Microgenomatia" Herrmann et al. 2019
    - Género " Candidatus Microgenomatus " Rinke et al. 2013
      - Especie " Ca. Microgenomatus auricola" Rinke et al. 2013
    - Orden "Roizmanbacterales" [UBA1406]
      - Familia "Laneganaceae" Pallen, Rodriguez-R & Alikhan 2022 [GWC2-37-13]
        Género " Roizmanbacterium " Geesink et al. 2020
    - Orden "Chazhemtobacteriales" (sic) Pallen, Rodriguez-R & Alikhan 2022 [UBA1400]
      - Familia "Chazhemtonibacteriaceae" Kadnikov et al. 2020 corrig. Oren & Garrity 2022
        Género " Candidatus Chazhemtonibacterium " Kadnikov et al. Corrección 2020. Oren y Garrity 2022
        Especie " Ca. Chazhemtonibacterium aquaticum" Kadnikov et al. 2020 corrig. Oren & Garrity 2022

Referencias

↑ Oren, Aharon; Göker, Markus (9 de mayo de 2023). "Lista Candidatus. Listas de nombres de filos Candidatus procariotas" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 73 (5). doi : 10.1099/ijsem.0.005821 .
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[1] Oren, Aharon; Göker, Markus (9 de mayo de 2023). "Lista Candidatus. Listas de nombres de filos Candidatus procariotas" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 73 (5). doi : 10.1099/ijsem.0.005821 .

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[3] Harris, J. Kirk; Kelley, Scott T.; Pace, Norman R. (febrero de 2004). "Nueva perspectiva sobre la división filogenética bacteriana no cultivada OP11" . Microbiología aplicada y ambiental . 70 (2): 845– 849. Bibcode : 2004ApEnM..70..845H . doi : 10.1128/AEM.70.2.845-849.2004 . ISSN 0099-2240 . PMC 348892. PMID 14766563 .

[4] Brown, Christopher T.; Hug, Laura A.; Thomas, Brian C.; Sharon, Itai; Castelle, Cindy J.; Singh, Andrea; Wilkins, Michael J.; Wrighton, Kelly C.; Williams, Kenneth H.; Banfield, Jillian F. (julio de 2015). " Biología inusual en un grupo que comprende más del 15 % del dominio Bacteria" . Nature . 523 (7559): 208–211 . Bibcode : 2015Natur.523..208B . doi : 10.1038 / nature14486 . ISSN 1476-4687 . OSTI 1512215. PMID 26083755. S2CID 4397558 .

[5] Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Hug, Laura A.; Sharon, Itai; Castelle, Cindy J.; Probst, Alexander J.; Thomas, Brian C.; Singh, Andrea; Wilkins, Michael J.; Karaoz, Ulas; Brodie, Eoin L. (diciembre de 2016). "Miles de genomas microbianos arrojan luz sobre procesos biogeoquímicos interconectados en un sistema acuífero" . Nature Communications . 7 (1) 13219. Bibcode : 2016NatCo...713219A . doi : 10.1038 / ncomms13219 . ISSN 2041-1723 . PMC 5079060. PMID 27774985 .

[about-6] "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .

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[LPSN-9] Microgenomatia en LPSN ; Freese, HM; Meier-Kolthoff, JP; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, AO; Göker, M. (29 de octubre de 2025). "TYGS y LPSN en 2025: un recurso global de datos biológicos básicos para la clasificación y nomenclatura basadas en el genoma de procariotas dentro de la Diversidad Digital de DSMZ". Nucleic Acids Research . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .

[NCBI-10] Schoch CL; et al. "Grupo Microgenomates" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2025 .

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