Hispanopedia WikiEl precursor de microARN miR-29 , o pre-miARN, es una pequeña molécula de ARN con forma de horquilla o bucle de tallo . Cada brazo de la horquilla puede procesarse en un miembro de una familia estrechamente relacionada de ARN cortos no codificantes que participan en la regulación de la expresión génica . [ 1 ] Los productos procesados, o "maduros", de la molécula precursora se conocen como microARN (miARN) y se han predicho o confirmado en una amplia gama de especies ( véase 'MIPF0000009' en miRBase: la base de datos de microARN ).
Procesamiento de miRNA
Los miRNA animales se transcriben primero como una molécula de miRNA primaria. Este "pri-miRNA" puede contener una o más horquillas precursoras, que son liberadas del pri-miRNA por la enzima nuclear Drosha . La horquilla precursora de aproximadamente 70 nucleótidos se exporta del núcleo y posteriormente es procesada por la enzima Dicer para dar lugar a un miRNA maduro que tiene, en promedio, 22 nucleótidos de longitud. Cualquiera de los brazos del precursor puede generar un ARN maduro, aunque en la mayoría de los casos se procesa preferentemente el brazo 3' (3p) o el 5' (5p) y se incorpora al complejo de silenciamiento inducido por ARN (RISC). Para el precursor de miR-29, el brazo 3' del ARN precursor produce el producto predominante (miR-29 o miR-29-3p), aunque el brazo 5' (miR-29* o miR-29-5p) también ha sido verificado experimentalmente.
La familia miR-29
Muchos genomas de mamíferos codifican cuatro precursores de miR-29 estrechamente relacionados que se transcriben en dos unidades transcripcionales. Por ejemplo, los miR-29a y miR-29b-1 humanos se procesan a partir de un intrón de un transcrito largo no codificante pri-miRNA (lnc-pri-miRNA) LOC646329 del cromosoma 7. Los miR-29b-2 (idénticos en secuencia a miR-29b-1) y miR-29c se cotranscriben a partir del cromosoma 1. Los tres miRNA maduros principales procesados a partir de estos precursores se conocen como has-miR-29a, has-miR-29b y has-miR-29c.
El análisis de supervivencia en tres conjuntos de datos independientes muestra que has-miR-29c está asociado con la supervivencia en el cáncer de mama. [ 2 ]
Dianas de miR-29
Se cree que los productos maduros ejercen funciones reguladoras al unirse con complementariedad parcial a los elementos de reconocimiento de microARN (MRE) en la región 3′ no traducida (3′ UTR) de los transcritos diana. La evidencia experimental sugiere que las posibles dianas de los productos maduros de miR-29 incluyen las siguientes:
- La proteína de diferenciación de células de leucemia mieloide (MCL1), [ 3 ] un miembro antiapoptótico de la familia de proteínas Bcl-2 .
- El oncogén TCL1A (leucemia/linfoma de células T 1) , [ 4 ] se ha encontrado alterado en muchas leucemias de células T , pero también en neoplasias malignas de células B desreguladas.
- Las ADN metiltransferasas DNMT3A y DNMT3B , que con frecuencia se encuentran sobreexpresadas en el cáncer de pulmón . [ 5 ]
- La proteína homóloga de dedo de zinc 36 (ZFP36), [ 6 ] también conocida como tristetraprolina (TTP), es un gen antiinflamatorio y anticancerígeno. [ 7 ]
- El factor 4 asociado al receptor del factor de necrosis tumoral (TRAF4) fue identificado como un objetivo de miR-29 en las células B y como un regulador de la señalización de CD40.
Recientemente, en un intento por identificar objetivos a nivel global utilizando el enfoque de proteómica cuantitativa SILAC , se identificaron VDAC1 y VDAC2 como objetivos de miR-29a en células HEK293T . [ 8 ]
Referencias
- ↑ Ambros V (dic. 2001). "microARN: pequeños reguladores con gran potencial" . Cell . 107 (7): 823–6 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . PMID 11779458 .
- ↑ Lánczky, András; Nagy, Ádám; Bottai, Giulia; Munkácsy, Gyöngyi; Szabó, András; Santarpia, Líbero; Győrffy, Balázs (1 de diciembre de 2016). "miRpower: una herramienta web para validar miARN asociados a la supervivencia utilizando datos de expresión de 2178 pacientes con cáncer de mama". Investigación y tratamiento del cáncer de mama . 160 (3): 439– 446. doi : 10.1007/s10549-016-4013-7 . ISSN 1573-7217 . PMID 27744485 . S2CID 11165696 .
- ↑ Mott JL, Kobayashi S, Bronk SF, Gores GJ (septiembre de 2007). "mir-29 regula la expresión de la proteína Mcl-1 y la apoptosis" . Oncogene . 26 ( 42): 6133–40 . doi : 10.1038/sj.onc.1210436 . PMC 2432524. PMID 17404574 .
- ^ Pekarsky Y, Santanam U, Cimmino A, Palamarchuk A, Efanov A, Maximov V, Volinia S, Alder H, Liu CG, Rassenti L, Calin GA, Hagan JP, Kipps T, Croce CM (diciembre de 2006). "La expresión de Tcl1 en la leucemia linfocítica crónica está regulada por miR-29 y miR-181" (PDF) . Investigación del cáncer . 66 (24): 11590– 3. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-06-3613 . PMID 17178851 .
- ↑ Fabbri M, Garzon R, Cimmino A, Liu Z, Zanesi N, Callegari E, Liu S, Alder H, Costinean S, Fernandez-Cymering C, Volinia S, Guler G, Morrison CD, Chan KK, Marcucci G, Calin GA, Huebner K, Croce CM (octubre de 2007). "La familia de microARN-29 revierte la metilación aberrante en el cáncer de pulmón al dirigirse a las ADN metiltransferasas 3A y 3B" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (40): 15805–10 . doi : 10.1073/pnas.0707628104 . PMC 2000384. PMID 17890317 .
- ↑ Gebeshuber CA, Zatloukal K, Martinez J (abril de 2009). "miR-29a suprime la tristetraprolina, que es un regulador de la polaridad epitelial y la metástasis" . EMBO Reports . 10 (4): 400–5 . doi : 10.1038/embor.2009.9 . PMC 2672883. PMID 19247375 .
- ↑ Sanduja S, Blanco FF, Dixon DA (2011). "Los roles de las proteínas TTP y BRF en la degradación regulada del ARNm" . Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA . 2 (1): 42– 57. doi : 10.1002/wrna.28 . PMC 3030256. PMID 21278925 .
- ↑ Bargaje R, Gupta S, Sarkeshik A, Park R, Xu T, Sarkar M, Halimani M, Roy SS, Yates J, Pillai B (2012). " Identificación de nuevos objetivos para miR-29a mediante proteómica de miRNA" . PLOS ONE . 7 (8) e43243. doi : 10.1371/journal.pone.0043243 . PMC 3428309. PMID 22952654 .
Enlaces externos
- Página del precursor de microARN mir-29 en Rfam
- MIPF0000009
- MicroARN
