Articulo de referencia

Dinámica de colisiones de múltiples partículas

La dinámica de colisión de múltiples partículas (MPC), también conocida como dinámica de rotación estocástica (SRD), [ 1 ] es una técnica de simulación a mesoescala basada en pa...

La dinámica de colisión de múltiples partículas (MPC), también conocida como dinámica de rotación estocástica (SRD), [ 1 ] es una técnica de simulación a mesoescala basada en partículas para fluidos complejos que incorpora completamente las fluctuaciones térmicas y las interacciones hidrodinámicas. [ 2 ] El acoplamiento de las partículas incrustadas al disolvente de grano grueso se logra mediante dinámica molecular . [ 3 ]

Método de simulación

El solvente se modela como un conjunto denorte{\displaystyle N}partículas puntuales de masametro{\displaystyle m}con coordenadas continuasri{\displaystyle {\vec {r}}_{i}}y velocidadesvi{\displaystyle {\vec {v}}_{i}}La simulación consta de etapas de transmisión y colisión.

Durante el paso de transmisión, las coordenadas de las partículas se actualizan de acuerdo con

ri(t+δtMETROPAGdo)=ri(t)+vi(t)δtMETROPAGdo{\displaystyle {\vec {r}}_{i}(t+\delta t_{\mathrm {MPC} })={\vec {r}}_{i}(t)+{\vec {v}}_{i}(t)\delta t_{\mathrm {MPC} }}

dóndeδtMETROPAGdo{\displaystyle \delta t_{\mathrm {MPC} }}es un paso de tiempo de simulación elegido que suele ser mucho mayor que un paso de tiempo de dinámica molecular.

Después del paso de flujo, las interacciones entre las partículas del disolvente se modelan en el paso de colisión. Las partículas se clasifican en celdas de colisión con un tamaño laterala{\displaystyle a}Las velocidades de las partículas dentro de cada celda se actualizan según la regla de colisión.

vivdoMETROS+R^(vivdoMETROS){\displaystyle {\vec {v}}_{i}\rightarrow {\vec {v}}_{\mathrm {CMS} }+{\hat {\mathbf {R} }}({\vec {v}}_{i}-{\vec {v}}_{\mathrm {CMS} })}

dóndevdoMETROS{\displaystyle {\vec {v}}_{\mathrm {CMS} }}es la velocidad del centro de masa de las partículas en la celda de colisión yR^{\displaystyle {\hat {\mathbf {R} }}}es una matriz de rotación . En dos dimensiones,R^{\displaystyle {\hat {\mathbf {R} }}}realiza una rotación en un ángulo+α{\displaystyle +\alpha }oα{\displaystyle -\alpha }con probabilidad1/2{\displaystyle 1/2}En tres dimensiones, la rotación se realiza mediante un ángulo.α{\displaystyle \alpha }alrededor de un eje de rotación aleatorio. Se aplica la misma rotación a todas las partículas dentro de una celda de colisión determinada, pero la dirección (eje) de rotación es estadísticamente independiente tanto entre todas las celdas como para una celda determinada en el tiempo.

Si la estructura de la cuadrícula de colisión definida por las posiciones de las celdas de colisión es fija, se viola la invariancia galileana . Esta se restablece con la introducción de un desplazamiento aleatorio de la cuadrícula de colisión. [ 4 ]

Las expresiones explícitas para el coeficiente de difusión y la viscosidad derivadas a partir de las relaciones de Green-Kubo concuerdan excelentemente con las simulaciones. [ 5 ] [ 6 ]

Parámetros de simulación

El conjunto de parámetros para la simulación del disolvente es:

  • masa de partículas de disolventemetro{\displaystyle m}
  • número promedio de partículas de disolvente por caja de colisiónnortes{\displaystyle n_{s}}
  • Tamaño de la caja de colisión laterala{\displaystyle a}
  • ángulo de rotación estocásticoα{\displaystyle \alpha }
  • kT (energía)
  • paso de tiempoδtMETROPAGdo{\displaystyle \delta t_{\mathrm {MPC} }}

Los parámetros de simulación definen las propiedades del disolvente, [ 1 ] tales como

dónded{\displaystyle d}es la dimensionalidad del sistema.

Una opción típica para la normalización esa=1,kT=1,metro=1{\displaystyle a=1,\;kT=1,\;m=1}Para reproducir un comportamiento similar al de un fluido, los parámetros restantes pueden fijarse comoα=130o,nortes=10,δtMETROPAGdo[0,01;0.1]{\displaystyle \alpha =130^{o},\;n_{s}=10,\;\delta t_{\mathrm {MPC} }\in [0.01;0.1]}. [ 7 ]

Aplicaciones

MPC se ha convertido en una herramienta notable en las simulaciones de muchos sistemas de materia blanda, incluyendo

Referencias

  1. 1 2 Gompper, G.; Ihle, T.; Kroll, DM; Winkler, RG (2009). "Dinámica de colisión de múltiples partículas: un enfoque de simulación a mesoescala basado en partículas para la hidrodinámica de fluidos complejos". Enfoques avanzados de simulación por computadora para las ciencias de la materia blanda III . Vol.  221. págs. 1–87 . arXiv : 0808.2157 . Bibcode : 2009acsa.book....1G . doi : 10.1007/978-3-540-87706-6_1 . ISBN  978-3-540-87705-9. S2CID 8433369 . 
  2. Malevanets, Anatoly; Kapral, Raymond (1999). "Modelo mesoscópico para la dinámica del disolvente". The Journal of Chemical Physics . 110 (17): 8605– 8613. Bibcode : 1999JChPh.110.8605M . doi : 10.1063/1.478857 .
  3. 1 2 Malevanets, Anatoly; Kapral, Raymond (2000). "Dinámica molecular del soluto en un disolvente de mesoescala" . The Journal of Chemical Physics . 112 (16): 7260– 7269. Bibcode : 2000JChPh.112.7260M . doi : 10.1063/1.481289 . S2CID 73679245 . 
  4. Ihle, T.; Kroll, DM (2003). "Dinámica de rotación estocástica. I. Formalismo, invariancia galileana y relaciones de Green-Kubo" . Physical Review E. 67 ( 6) 066705. Bibcode : 2003PhRvE..67f6705I . doi : 10.1103/PhysRevE.67.066705 . PMID 16241378 . 
  5. Ihle, T.; Tüzel, E.; Kroll, DM (2004). "Resummed Green-Kubo relations for a fluctuating fluid-particle model". Physical Review E . 70 (3) 035701. arXiv : cond-mat/0404305 . Bibcode : 2004PhRvE..70c5701I . doi : 10.1103/PhysRevE.70.035701 . PMID 15524580 . S2CID 11272882 .  
  6. Ihle, T.; Tüzel, E.; Kroll, DM (2005). "Cálculo de equilibrio de coeficientes de transporte para un modelo fluido-partícula". Physical Review E . 72 (4) 046707. arXiv : cond-mat/0505434 . Bibcode : 2005PhRvE..72d6707I . doi : 10.1103/PhysRevE.72.046707 . PMID 16383567 . S2CID 14413944 .  
  7. ^ Tesis doctoral de J. Elgeti "Dinámica de espermatozoides y cilios", Universität zu Köln (2006)
  8. Padding, JT; Louis, AA (2004). "Fluctuaciones hidrodinámicas y brownianas en suspensiones sedimentantes". Physical Review Letters . 93 (22) 220601. arXiv : cond-mat/0409133 . Bibcode : 2004PhRvL..93v0601P . doi : 10.1103/PhysRevLett.93.220601 . PMID 15601076 . S2CID 119504730 .  
  9. Hecht, Martin; Harting, Jens; Bier, Markus; Reinshagen, Jörg; Herrmann, Hans J. (2006). "Viscosidad de corte de coloides arcillosos en simulaciones por computadora y experimentos". Physical Review E . 74 (2) 021403. arXiv : cond-mat/0601413 . Bibcode : 2006PhRvE..74b1403H . doi : 10.1103/PhysRevE.74.021403 . PMID 17025421 . S2CID 19998245 .  
  10. Mussawisade, K.; Ripoll, M.; Winkler, RG; Gompper, G. (2005). "Dinámica de polímeros en un disolvente mesoscópico basado en partículas" (PDF) . The Journal of Chemical Physics . 123 (14): 144905. Bibcode : 2005JChPh.123n4905M . doi : 10.1063/1.2041527 . PMID 16238422 . 
  11. Ripoll, M.; Winkler, RG; Gompper, G. (2007). "Análisis hidrodinámico de polímeros en estrella en flujo de cizallamiento". The European Physical Journal E . 23 (4): 349– 354. Bibcode : 2007EPJE...23..349R . doi : 10.1140/epje/i2006-10220-0 . PMID 17712520 . S2CID 36780360 .  
  12. Noguchi, Hiroshi; Gompper, Gerhard (2005). "Dinámica de vesículas fluidas en flujo de cizallamiento: Efecto de la viscosidad de la membrana y fluctuaciones térmicas" (PDF) . Physical Review E. 72 ( 1) 011901. Bibcode : 2005PhRvE..72a1901N . doi : 10.1103/PhysRevE.72.011901 . PMID 16089995 . 
  13. K.-W. Lee y Marco G. Mazza (2015). "Dinámica de rotación estocástica para cristales líquidos nemáticos". Journal of Chemical Physics . 142 (16): 164110. arXiv : 1502.03293 . Bibcode : 2015JChPh.142p4110L . doi : 10.1063/1.4919310 . PMID 25933755 . S2CID 36839435 .  
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