La museómica es el estudio de datos genómicos obtenidos de muestras de ADN antiguo (aDNA) y ADN histórico (hDNA) en colecciones de museos . [ 1 ] [ 2 ] Las primeras investigaciones en esta área se centraron en secuencias cortas de ADN de genes mitocondriales , pero la secuenciación de genomas completos se ha vuelto posible. [ 1 ] Los métodos de secuenciación de próxima generación (NGS) y de secuenciación de alto rendimiento (HTS) se pueden aplicar al análisis de conjuntos de datos genéticos extraídos de materiales de colecciones. [ 3 ] Estas técnicas se han descrito como una "tercera revolución en la tecnología de secuenciación". [ 4 ] Al igual que la datación por radiocarbono , las técnicas de museómica son una tecnología transformadora. Los resultados están revisando y, a veces, refutando teorías previamente aceptadas sobre una amplia variedad de temas, como la domesticación del caballo . [ 5 ] [ 6 ]
Las colecciones de los museos contienen recursos únicos, como especímenes de historia natural , que pueden utilizarse para exámenes a escala genómica de especies, su evolución y sus respuestas al cambio ambiental. El ADN antiguo proporciona una ventana única al cambio genético a lo largo del tiempo. Permite a los científicos estudiar directamente los procesos evolutivos y ecológicos, comparando poblaciones antiguas y modernas, identificando poblaciones distintas y revelando patrones de cambio como extinciones y migraciones . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] La investigación puede utilizarse para identificar poblaciones aisladas e informar las prioridades de conservación. [ 2 ]
Sin embargo, los especímenes de museo pueden estar mal conservados y son susceptibles a la degradación [ 7 ] y la contaminación. [ 2 ] [ 10 ] Los análisis genómicos enfrentan desafíos considerables como resultado del ADN altamente degradado típico de los especímenes de museo. El ADN de tales muestras a menudo está sujeto a daño de nucleótidos post mortem, como la desaminación hidrolítica de residuos de citosina (C) a uracilo (U). La amplificación por PCR de plantillas dañadas puede sustituir aún más los uracilos por timina (T), completando una ruta de sustitución de C a T. Tales errores tienden a ocurrir hacia los extremos de las moléculas, se acumulan con el tiempo y pueden ser significativos en especímenes de un siglo de antigüedad o más. Se necesitan técnicas genómicas y estadísticas robustas para detectar y evitar rigurosamente errores e incertidumbres de genotipado cuando se realizan análisis basados en colecciones de museo. [ 7 ] Los métodos óptimos para trabajar con hDNA y aDNA pueden diferir como resultado de las diferencias en su historial de degradación del ADN. [ 1 ]
La museomics también implica el muestreo destructivo, la eliminación irreversible de partes de especímenes a veces raros para obtener ADN. [ 11 ] Esto puede ser controvertido para los curadores y el personal de colecciones, [ 1 ] ya que implica una variedad de cuestiones éticas relacionadas con el manejo y la destrucción de objetos, las prácticas de adquisición y repatriación coloniales, y las implicaciones sociales y políticas actuales de la investigación. Los museos, las universidades y las revistas están desarrollando cada vez más declaraciones de ética, mejores prácticas y directrices para este tipo de trabajo. [ 12 ] [ 13 ]
Véase también
Referencias
- 1 2 3 4 Raxworthy, Christopher J.; Smith, Brian Tilston (noviembre de 2021). "Extracción de ADN histórico de los museos: avances y desafíos en la museomics" ( PDF) . Trends in Ecology & Evolution . 36 (11): 1049– 1060. Bibcode : 2021TEcoE..36.1049R . doi : 10.1016/j.tree.2021.07.009 . PMID 34456066. S2CID 239687836. Recuperado el 27 de junio de 2022 .
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