Articulo de referencia

Mycolicibacter

{{Cite journal|last1=Gupta|first1=Radhey S.|last2=Lo|first2=Brian|last3=Son|first3=Jeen|date=2018-02-13|title=Phylogenomics and Comparative Genomic Studies Robustly Support Divi...

Mycolicibacter es un género de bacterias grampositivas con forma de bastón pertenecientes a la familia Mycobacteriaceae del orden Mycobacteriales . [ 1 ]

En 2018, Gupta et al. delimitaron los miembros del género Mycolicibacter, separándolos del género Mycobacterium, basándose en evidencia de diversos árboles filogenéticos construidos a partir de secuencias genómicas conservadas, análisis genómicos comparativos y valores promedio de identidad de aminoácidos. [ 1 ] Además de este género, el estudio propuso la división de Mycobacterium en un total de cinco géneros distintos, lo que generó cierta resistencia en parte de la comunidad científica. Esta resistencia se fundamentó en que Mycobacterium contiene algunas especies clínicamente relevantes y que los cambios de nombre podrían causar confusión entre los médicos y otros investigadores. [ 3 ]

En 2020, Yamada et al. analizaron las propiedades morfológicas fundamentales de los nuevos géneros, incluyendo el diámetro celular, la longitud celular, el perímetro celular, la circularidad celular y la relación de aspecto, y determinaron que existían diferencias significativas entre los cinco géneros, apoyando así la nueva división. [ 4 ]

El nombre Mycolicibacter deriva del sustantivo latino acidum mycolicum (que significa ácido micólico) y del sustantivo latino bacter (que significa bastón). Juntos, el nombre se refiere a un género de bacterias con forma de bastón que contienen ácido micólico. [ 1 ]

Características bioquímicas y firmas moleculares

Fuente: [ 1 ]

Las bacterias del género Mycolicibacter son de crecimiento lento (tardan más de siete días en formar colonias) y no cromogénicas (no producen pigmento). Algunas especies crecen a un ritmo intermedio, tardando entre 5 y 15 días en formar colonias. Si bien la mayoría de las bacterias del género Mycolicibacter no son patógenas, algunas especies se han aislado de animales y pacientes humanos. Presentan un mayor contenido de G+C (entre 66,3 y 70,3  mol%) y genomas relativamente cortos, de entre 3,87 y 5,11 Mbp.

Los análisis de secuencias genómicas de Mycolicibacter identificaron 26 indels característicos conservados (CSIs) que son específicos de este género en proteínas como la sintetasa de péptidos no ribosomales , la hidrolasa de nucleósidos, el regulador transcripcional de la familia TetR, la proteína de inanición de carbono A, la ADN polimerasa propensa a errores, la amidohidrolasa , la proteína de la familia de la carboximunconolactona descarboxilasa, la policétido ciclasa, la proteína de la familia AveC de la espirociclasa, la proteína TobH, la ligasa de UDP-N-acetilmuramato-L-alanina , la proteína que contiene el dominio DUF2236, la subunidad de la cobaltoquelatasa CobN, la hidrolasa alfa/beta , el transportador de potasio Kef, una proteína de membrana , la proteína que contiene el dominio DUF222, el transportador MFS, la proteína que contiene el dominio de la adenilato/guanilato ciclasa, la proteína que contiene el dominio DUF2029 y proteínas hipotéticas. [ 1 ] Estos CSI proporcionan un método molecular fiable para identificar y distinguir a los miembros de Mycolicibacter de otros géneros de la familia Mycobacteriaceae . Además, se identificaron 15 proteínas de firma conservadas (CSP) únicas que son específicas de la mayoría o de todos los miembros de este género.

Filogenia

La filogenia de Mycolicibacter se basa en el análisis del genoma completo. [ 1 ] [ a ]

Notas

  1. Mycolicibacter paraterrae y " Mycolicibacter virginiensis " no están incluidos en este árbol filogenético.

Referencias

  1. 1 2 3 4 5 6 7 Gupta, Radhey S.; Lo, Brian; Son, Jeen (2018-02-13). "Los estudios filogenómicos y genómicos comparativos respaldan sólidamente la división del género Mycobacterium en un género Mycobacterium enmendado y cuatro nuevos géneros" . Frontiers in Microbiology . 9 : 67. doi : 10.3389/fmicb.2018.00067 . ISSN 1664-302X . PMC 5819568. PMID 29497402 .   
  2. Euzéby JP, Parte AC. " Mycolicibacter " . Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 26 de junio de 2022 .
  3. ^ Tortolí, Enrico; Brown-Elliott, Barbara A.; Chalmers, James D.; Cirillo, Daniela M.; Daley, Charles L.; Emler, Stefan; Floto, R. Andrés; García, María J.; Hoefsloot, Wouter; Koh, Won-Jung; Lange, Christoph (1 de julio de 2019). «Misma carne, diferente salsa: ignora los nuevos nombres de las micobacterias» . Revista respiratoria europea . 54 (1). doi : 10.1183/13993003.00795-2019 . ISSN 0903-1936 . PMID 31296783 . S2CID 195893005 .   
  4. ^ Yamada, Hiroyuki; Chikamatsu, Kinuyo; Aono, Akio; Murata, Kazuyoshi; Miyazaki, Naoyuki; Kayama, Yoko; Bhatt, Apoorva; Fujiwara, Nagatoshi; Maeda, Shinji; Mitarai, Satoshi (2020). "Las morfologías celulares fundamentales examinadas con Cryo-TEM de las especies de los cinco géneros novedosos se correlacionan sólidamente con la nueva clasificación en la familia Mycobacteriaceae " . Fronteras en Microbiología . 11 562395.doi : 10.3389/ fmicb.2020.562395 . ISSN 1664-302X . PMC 7701246 . PMID 33304323 .