Articulo de referencia

Myoviridae

Myoviridae era una familia de bacteriófagos del orden Caudovirales . La familia Myoviridae y el orden Caudovirales han sido abolidos, yahora se utiliza el término miovirus para ...

Myoviridae era una familia de bacteriófagos del orden Caudovirales . La familia Myoviridae y el orden Caudovirales han sido abolidos, yahora se utiliza el término miovirus para referirse a la morfología de los virus de esta antigua familia. [ 1 ] Las bacterias y las arqueas sirven como huéspedes naturales. Había 625 especies en esta familia, asignadas a ocho subfamilias y 217 géneros. [ 2 ] [ 3 ]

Subdivisiones

La subfamilia Tevenvirinae (sinónimo: Tequatrovirinae ) recibe su nombre de su especie tipo, el fago T4 de Enterobacteria . Los miembros de esta subfamilia son morfológicamente indistinguibles y poseen cabezas moderadamente alargadas de aproximadamente 110 nanómetros (nm) de longitud,  colas de 114 nm con un collar, placas basales con espículas cortas y seis fibras caudales largas y curvadas. Los géneros dentro de esta subfamilia se dividen según la morfología de la cabeza: el género Tequatrovirus (nombre provisional: T4virus ) tiene una longitud de cabeza de 137  nm, mientras que los del género Schizotequatrovirus tienen una longitud de 111  nm. Dentro de los géneros, según la homología de proteínas, las especies se han dividido en varios grupos.

La subfamilia Peduovirinae presenta viriones con cabezas de 60  nm de diámetro y colas de 135 × 18  nm. Estos fagos se identifican fácilmente porque sus vainas contraídas tienden a desprenderse del núcleo de la cola. El fago P" es la especie tipo.

La subfamilia Spounavirinae está compuesta por fagos virulentos de amplio espectro que infectan a miembros de Bacillota . Poseen cabezas isométricas de 87-94  nm de diámetro y capsómeros conspicuos ,  colas estriadas de 140-219 nm de longitud y una placa basal doble. En el extremo de la cola se encuentran estructuras globulares, identificadas como espículas de la placa basal, y fibras cortas y curvadas con simetría séxtuple. Los miembros de este grupo suelen poseer genomas grandes (127-142 kb) no permutados con redundancias terminales de 3,1-20 kb. El nombre de esta subfamilia deriva de SPO más una (latín para uno).

Los halovirus HF1 y HF2 pertenecen al mismo género, pero dado que infectan arqueas en lugar de bacterias, es probable que se coloquen en un género separado una vez que se haya establecido su clasificación. [ 4 ]

Se ha propuesto un grupo enano basándose en criterios morfológicos y genómicos. Este grupo incluye los fagos Aeromonas salmonicida fago 56, Vibrio cholerae fagos 138 y CP-T1, Bdellovibrio fago φ1422 y Pectobacterium carotovorum fago ZF40. [ 5 ] Sus características compartidas incluyen una morfología de virión idéntica, caracterizada por colas contráctiles generalmente cortas, y todos tienen tamaños de genoma de aproximadamente 45 kilobases. El orden de los genes en la unidad estructural del genoma es el siguiente: terminasa—portal—cabeza—cola—placa basal—fibras de la cola.

Virología

Estructura típica de un miovirus

Los virus de la antigua familia Myoviridae no tienen envoltura y presentan geometrías de cabeza y cola (con cuello). Sus genomas son de ADN lineal de doble cadena, con una longitud aproximada de 33 a 244 kb. El genoma codifica de 40 a 415 proteínas. [ 2 ] Presenta secuencias terminales redundantes. El contenido de GC es de aproximadamente el 35 %. El genoma codifica de 200 a 300 proteínas que se transcriben en operones. Puede contener 5-hidroximetilcitosina (en lugar de timidina ).

La cola tubular presenta simetría helicoidal y tiene  un diámetro de 16 a 20 nm. Consta de un tubo central, una vaina contráctil, un collar, una placa basal, seis espinas de la cola y seis fibras largas. Es similar a la de los Tectiviridae , pero se diferencia en que la cola de un miovirus es permanente.

Las contracciones de la cola requieren ATP . Al contraerse la vaina, las subunidades de la vaina se deslizan unas sobre otras y la cola se acorta hasta alcanzar  una longitud de 10 a 15 nm.

Ciclo vital

Ciclo de reproducción del bacteriófago Pseudomonas PAK_P3, del género Nankokuvirus.
Micrografía de una sección delgada de plástico de una célula de Salmonella con cápsides del fago SPN3US alineadas en la membrana celular. Barra de escala: 2000 Å. Crédito: J. Bernard Heymann et  al. (2020) [ 6 ]

Al unirse a una célula huésped, el virus utiliza su vaina contráctil como una jeringa, perforando la pared celular con su tubo central e inyectando el material genético en el huésped. El ADN inyectado toma el control de los mecanismos de transcripción y traducción de la célula huésped y comienza a fabricar nuevos virus. La replicación sigue el modelo de transposición replicativa. La transcripción dirigida por ADN es el método de transcripción. La traducción se produce por desplazamiento del marco de lectura ribosómico -1 . El virus sale de la célula huésped por lisis , y las proteínas holina / endolisina / spanina . Las bacterias y las arqueas sirven como huéspedes naturales. La vía de transmisión es la difusión pasiva . [ 2 ]

Aunque los miovirus son en general líticos , ya que carecen de los genes necesarios para volverse lisogénicos , se conocen varias especies de clima templado .

Aplicaciones

La mayoría de los Myoviridae son fagos líticos en lugar de templados. Por lo tanto, algunos investigadores han estudiado su uso como terapia para enfermedades bacterianas en humanos y otros animales. [ 7 ]

Taxonomía

Se reconocen las siguientes ocho subfamilias: [ 3 ]

Además, los siguientes géneros no están asignados a una subfamilia: [ 3 ]

Referencias

  1. ^ Turner D, Shkoporov AN, Lood C, Millard AD, Dutilh BE, Alfenas-Zerbini P, van Zyl LJ, Aziz RK, Oksanen HM, Poranen MM, Kropinski AM, Barylski J, Brister JR, Chanisvili N, Edwards RA, Enault F, Gillis A, Knezevic P, Krupovic M, Kurtböke I, Kushkina A, Lavigne R, Lehman S, Lobocka M, Moraru C, Moreno Switt A, Morozova V, Nakavuma J, Reyes Muñoz A, Rūmnieks J, Sarkar BL, Sullivan MB, Uchiyama J, Wittmann J, Yigang T, Adriaenssens EM (enero de 2023). "Abolición de los taxones basados ​​en la morfología y cambio a nombres de especies binomiales: actualización taxonómica de 2022 del subcomité de virus bacterianos del ICTV" . Archives of Virology . 168 (2): 74. doi : 10.1007/s00705-022-05694-2 . PMC 9868039. PMID 36683075 .  
  2. 1 2 3 "Zona Viral" . ExPASy . Consultado el 1 de julio de 2015 .
  3. 1 2 3 "Taxonomía de virus: publicación de 2020" . Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV). Marzo de 2021. Consultado el 11 de mayo de 2021 .
  4. Tang, SL; Nuttall, S; Dyall-Smith, M (2004). "Halovirus HF1 y HF2: evidencia de un evento de recombinación reciente y de gran magnitud" . J Bacteriol . 186 (9): 2810– 2817. doi : 10.1128/JB.186.9.2810-2817.2004 . PMC 387818. PMID 15090523 .  
  5. Comeau, AM; Tremblay, D; Moineau, S; Rattei, T; Kushkina, AI; Tovkach, FI; Krisch, HM; Ackermann, HW (2012). "La morfología de los fagos recapitula la filogenia: la genómica comparativa de un nuevo grupo de miovirus" . PLOS ONE . 7 (7) e40102. Bibcode : 2012PLoSO...740102C . doi : 10.1371/journal.pone.0040102 . PMC 3391216. PMID 22792219 .  
  6. J. Bernard Heymann, Bing Wang, William W. Newcomb, Weimin Wu, Dennis C. Winkler, Naiqian Cheng, Erin R. Reilly, Ru-Ching Hsia, Julie A. Thomas, Alasdair C. Steven: La cápside moteada del fago gigante de Salmonella SPN3US, un probable intermedio de maduración con una envoltura interna novedosa. En: Viruses 2020, 12(9). Número especial Fagos gigantes o jumbo , 910. doi:10.3390/v12090910 .
  7. Capparelli, Rosanna; et al. (agosto de 2007). "Terapia experimental con fagos contra Staphylococcus aureus en ratones" . Antimicrobial Agents and Chemotherapy . 51 (8): 2765– 2773. doi : 10.1128/AAC.01513-06 . PMC 1932491. PMID 17517843 .   
  • Viralzone : Myoviridae
  • ICTV
  • Genomas completos de Myoviridae