extremo N

El extremo N (también conocido como extremo amino , _extremo NH₂ o extremo amina ) es el inicio de una proteína o polipéptido , y se refiere al grupo amino libre (-NH₂ ₎ ubicado en el extremo del polipéptido. Dentro de un péptido, el grupo amino se une al grupo carboxilo de otro aminoácido, formando una cadena. Esto deja un grupo carboxilo libre en un extremo del péptido, llamado extremo C , y un grupo amino libre en el otro extremo, llamado extremo N. Por convención, las secuencias de péptidos se escriben de extremo N a extremo C, de izquierda a derecha (en sistemas de escritura LTR ). ^{[ 1 ]} Esto correlaciona la dirección de traducción con la dirección del texto, ya que cuando una proteína se traduce a partir del ARN mensajero , se crea desde el extremo N hasta el extremo C, a medida que se agregan aminoácidos al extremo carboxilo de la proteína.

Cada aminoácido posee un grupo amino y un grupo carboxilo . Los aminoácidos se unen entre sí mediante enlaces peptídicos que se forman a través de una reacción de deshidratación. Esta reacción une el grupo carboxilo de un aminoácido con el grupo amino del siguiente, de forma cabeza-cola, para formar una ^cadena polipeptídica . La cadena tiene dos extremos: un grupo amino, el extremo N, y un grupo carboxilo libre, el extremo C. ^{[ 2} ]

Cuando una proteína se traduce a partir del ARN mensajero , se crea desde el extremo N-terminal hasta el extremo C-terminal. El extremo amino de un aminoácido (en un ARNt cargado ), durante la etapa de elongación de la traducción, se une al extremo carboxilo de la cadena en crecimiento. Dado que el codón de inicio del código genético codifica el aminoácido metionina , la mayoría de las secuencias de proteínas comienzan con metionina (o, en bacterias, mitocondrias y cloroplastos , con la versión modificada N -formilmetionina , fMet). Sin embargo, algunas proteínas se modifican postraduccionalmente , por ejemplo, mediante la escisión de un precursor proteico , y por lo tanto pueden tener diferentes aminoácidos en su extremo N-terminal.

Los extremos N-terminales de las proteínas pueden modificarse cotraduccionalmente o postraduccionalmente. Las modificaciones incluyen la eliminación de la metionina iniciadora (iMet) por aminopeptidasas , la unión de pequeños grupos químicos como acetilo , propionilo y metilo , y la adición de anclajes de membrana, como los grupos palmitoilo y miristoilo ^{[ 3 ].}

• extremo C
• TopFIND , una base de datos científica que abarca las proteasas , la especificidad de su sitio de escisión, los sustratos, los inhibidores y los extremos proteicos que se originan a partir de su actividad.