nanoHUB.org es un portal de ciencia e ingeniería que comprende recursos aportados por la comunidad y orientado a la educación, la creación de redes profesionales y herramientas de simulación interactivas para la nanotecnología . [ 1 ] Financiado por la Fundación Nacional de Ciencias de los Estados Unidos (NSF), es un producto de la Red para la Nanotecnología Computacional (NCN). La NCN apoya los esfuerzos de investigación en nanoelectrónica ; nanomateriales ; sistemas nanoelectromecánicos (NEMS); nanofluídica ; nanomedicina , nanobiología ; y nanofotónica .
Historia
La Red de Nanotecnología Computacional se estableció en 2002 [ 2 ] para crear un recurso para la nanociencia y la nanotecnología a través de servicios en línea para la investigación, la educación y la colaboración profesional. Inicialmente una iniciativa multiuniversitaria de ocho instituciones miembros, entre ellas la Universidad de Purdue , la Universidad de California en Berkeley , la Universidad de Illinois en Urbana-Champaign , el Instituto Tecnológico de Massachusetts , el Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley Molecular Foundry , la Universidad Estatal de Norfolk , la Universidad Northwestern y la Universidad de Texas en El Paso , NCN ahora opera completamente en Purdue.
La Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU. (NSF) otorgó subvenciones por un valor aproximado de 14 millones de dólares entre 2002 y 2010, con Mark S. Lundstrom como investigador principal . [ 3 ] Desde 2007, la NSF ha concedido subvenciones continuas con Gerhard Klimeck como investigador principal y Alejandro Strachan como coinvestigador principal , con una financiación total superior a los 20 millones de dólares. [ 4 ]
Recursos
El portal web de NCN es nanoHUB.org y es una instancia de un hub HUBzero . Ofrece herramientas de simulación, materiales de cursos, conferencias, seminarios, tutoriales, grupos de usuarios y reuniones en línea. [ 5 ] [ 6 ] Las herramientas de simulación interactivas son accesibles desde navegadores web y se ejecutan a través de una red de computación distribuida en la Universidad de Purdue , así como TeraGrid y Open Science Grid . Estos recursos son proporcionados por cientos de miembros colaboradores de la comunidad de nanociencia. [ 7 ]
Tipos de recursos principales: [ 8 ]
- Herramientas de simulación interactivas para la nanotecnología y campos relacionados.
- Planes de estudio para educadores
- Noticias y eventos sobre nanotecnología
- Conferencias, podcasts y materiales de aprendizaje en múltiples formatos.
- seminarios en línea
- Talleres en línea
- Grupos de usuarios
- Salas de reuniones grupales en línea
- Espacios de trabajo virtuales de Linux que facilitan el desarrollo de herramientas dentro de una máquina Linux en el navegador.
Herramientas de simulación
nanoHUB ofrece herramientas de simulación en el navegador orientadas a la enseñanza de la nanotecnología, la ingeniería eléctrica, la ciencia de los materiales, la química y los semiconductores. Las simulaciones de nanoHUB están disponibles para los usuarios como herramientas independientes y como parte de planes de estudio estructurados que incluyen numerosas herramientas. Los usuarios pueden desarrollar y contribuir con sus propias herramientas para su implementación en tiempo real.
Algunos ejemplos de herramientas son: [ 9 ]
- SCHRED
- calcula las funciones de onda de la envolvente y las energías de los estados ligados correspondientes en una estructura típica de metal-óxido-semiconductor (MOS) o semiconductor-óxido-semiconductor (SOS) y una estructura típica de SOI resolviendo de forma autoconsistente la ecuación de Poisson unidimensional (1D) y la ecuación de Schrödinger 1D .
- Laboratorio de puntos cuánticos
- Calcula los estados propios de una partícula en una caja de diversas formas, incluyendo cúpulas y pirámides.
- Herramienta Monte Carlo masiva
- Calcula los valores globales de la velocidad de deriva de los electrones , la energía media de los electrones y la movilidad de los electrones para campos eléctricos aplicados en una dirección cristalográfica arbitraria tanto en materiales de la columna 4 (Si y Ge) como en materiales III-V (GaAs, SiC y GaN).
- Visor de cristales
- Esta herramienta ayuda a visualizar diversos tipos de redes de Bravais , planos e índices de Miller necesarios para muchos cursos de ciencia de materiales, electrónica y química. Además, permite visualizar sistemas macroscópicos de diferentes materiales (silicio, InAs, GaAs, diamante, grafeno, buckybola ).
- Laboratorio de Estructura de Bandas
- Calcula y visualiza las estructuras de bandas de semiconductores masivos, películas delgadas y nanocables para diversos materiales, orientaciones de crecimiento y condiciones de deformación. A partir de las estructuras de bandas calculadas, también se pueden obtener parámetros físicos como la banda prohibida y la masa efectiva .
- Kit de herramientas de simulación de nanomateriales
- Utiliza dinámica molecular para simular materiales a escala atómica.
- Cálculos DFT con Quantum ESPRESSO
- Utiliza la teoría del funcional de la densidad para simular la estructura electrónica de los materiales.
Infraestructura
Kit de herramientas Rappture
El conjunto de herramientas Rappture (Rapid APPlication infrastrucTURE) proporciona la infraestructura básica para el desarrollo de una amplia gama de aplicaciones científicas, lo que permite a los científicos centrarse en su algoritmo principal. Lo hace de forma independiente del lenguaje, por lo que se puede acceder a Rappture desde diversos entornos de programación, como C/C++, Fortran y Python. Para usar Rappture, el desarrollador describe todas las entradas y salidas del simulador, y Rappture genera automáticamente una interfaz gráfica de usuario (GUI) para la herramienta. [ 10 ]
Cuadernos Jupyter
Para complementar las herramientas GUI de Rappture existentes dentro de nanoHUB, los cuadernos Jupyter basados en navegador más recientes también están disponibles en nanoHUB, desde 2017. Jupyter en nanoHUB ofrece nuevas posibilidades utilizando el software científico existente, y más notablemente todas las herramientas de Rappture, dentro de nanoHUB con los cuadernos de código intercalado (por ejemplo, Python , texto y multimedia).
Espacios de trabajo
Un espacio de trabajo es un escritorio Linux en el navegador que proporciona acceso al conjunto de herramientas Rappture de NCN, junto con los recursos computacionales disponibles en las redes NCN, Open Science Grid y TeraGrid. Estos recursos se pueden usar para realizar investigaciones o como área de desarrollo para nuevas herramientas de simulación. Se puede cargar código, compilarlo, probarlo y depurarlo. Una vez que el código se ha probado y funciona correctamente en un espacio de trabajo, se puede implementar como una herramienta en producción en nanoHUB.
Un usuario puede utilizar las herramientas habituales de Linux para transferir datos desde y hacia un espacio de trabajo. Por ejemplo, el comando `sftp yourlogin@sftp.nanohub.org` establecerá una conexión con un recurso compartido de archivos de nanoHUB. Los usuarios también pueden utilizar la compatibilidad integrada con WebDAV en los sistemas operativos Windows, Macintosh y Linux para acceder a sus archivos de nanoHUB desde su ordenador local.
Middleware
El servidor web utiliza un demonio para reenviar dinámicamente las conexiones VNC entrantes al host de ejecución donde se está ejecutando una sesión de aplicación. En lugar de usar el enrutador de puertos para establecer un canal independiente para importar o exportar archivos, utiliza VNC para activar una acción en el navegador que reenvía la transferencia de archivos a través del servidor web principal de nanoHUB. La principal ventaja de integrar estas capacidades en el servidor web es que limita el punto de acceso a nanoHUB a una sola dirección: www.nanohub.org. Esto simplifica el modelo de seguridad y reduce la cantidad de certificados de seguridad independientes que gestionar.
Una desventaja de centralizar la mayor parte de la comunicación a través del servidor web es la falta de escalabilidad cuando los usuarios individuales transfieren demasiados datos. Para evitar la saturación de la red, el servidor web puede replicarse y agruparse en un único servidor mediante la selección de DNS round-robin.
Los servidores de ejecución de backend que admiten Maxwell pueden operar con sistemas Unix convencionales , máquinas virtuales Xen y una forma de virtualización basada en OpenVZ . Para cada sistema, se inicia previamente un servidor VNC para cada sesión. Cuando se utiliza OpenVZ, dicho servidor VNC se inicia dentro de un contenedor virtual. Los procesos que se ejecutan en ese contenedor no pueden ver otros procesos en el sistema físico, ni la carga de CPU impuesta por otros usuarios, ni dominar los recursos de la máquina física, ni establecer conexiones de red salientes. Al anular selectivamente las restricciones impuestas por OpenVZ, es posible sintetizar un entorno completamente privado para cada sesión de aplicación que el usuario puede utilizar de forma remota. [ 11 ]
Uso
La mayoría de los usuarios provienen de instituciones académicas que utilizan nanoHUB como parte de sus actividades de investigación y docencia. También hay usuarios de laboratorios nacionales y de la industria privada. Como recurso científico, nanoHUB fue citado cientos de veces en la literatura científica, alcanzando su punto máximo en 2009. [ 12 ] [ 13 ] Aproximadamente el sesenta por ciento de las citas provienen de autores no afiliados a la NCN. Más de 200 de las citas se refieren a la investigación en nanotecnología, y más de 150 de ellas citan el uso concreto del recurso. Veinte citas profundizan en el uso de nanoHUB en la educación y más de 30 se refieren a nanoHUB como un ejemplo de ciberinfraestructura nacional.
nanoHUB-U
La iniciativa de cursos en línea nanoHUB-U [ 14 ] se desarrolló para permitir a los estudiantes estudiar un tema en un marco de cinco semanas, aproximadamente equivalente a una clase de 1 crédito. No se otorgan créditos: los cuestionarios y exámenes son sencillos y están diseñados para ayudar al aprendizaje en lugar de realizar pruebas rigurosas de habilidades adquiridas. Con el espíritu de una universidad de investigación, los cursos nanoHUB-U buscan incorporar nuevos avances y conocimientos de la investigación al plan de estudios; además, la simulación (a menudo de nanoHUB) está ampliamente incluida en los cursos. Se hace todo lo posible para presentar los cursos de manera que sean accesibles para estudiantes de posgrado principiantes con una variedad de diferentes antecedentes y con un número mínimo de prerrequisitos. El curso ideal de nanoHUB-U es accesible para cualquier estudiante con un título de pregrado en ingeniería o ciencias físicas. Los cursos incluyen nanoelectrónica, materiales a nanoescala y caracterización a nanoescala. Los cursos nanoHUB-U ahora forman parte de edX .
Véase también
Referencias
- ↑ Sebastien Goasguen; Krishna Madhavan; David Wolinsky; Renato Figueiredo; Jaime Frey; Alain Roy; Paul Ruth; Dongyan Xu (2008). «Estrategias de integración y despliegue de middleware para ciberinfraestructuras». Avances en computación en malla y ubicua . Notas de clase en ciencias de la computación . Vol. 5036. págs. 187–198 . doi : 10.1007/978-3-540-68083-3_20 . ISBN 978-3-540-68081-9.
- ↑ Gerhard Klimeck ; Michael McLennan; Sean P. Brophy; George B. Adams III; Mark S. Lundstrom (septiembre-octubre de 2008). "nanoHUB.org: Promoviendo la educación y la investigación en nanotecnología" . Computing in Science & Engineering . 10 (5). IEEE Computer Society: 17–23 . Bibcode : 2008CSE....10e..17K . doi : 10.1109/MCSE.2008.120 . S2CID 2020684 .
- ↑ "Red para la Nanotecnología Computacional" . Resumen del premio n .° 0228390. Fundación Nacional de Ciencias. 10 de septiembre de 2002. Consultado el 19 de septiembre de 2011 .
- ↑ "Red para la Plataforma Cibernética de Nanotecnología Computacional" . Resumen del premio n.° 1227110. Fundación Nacional de Ciencias. 20 de noviembre de 2012. Consultado el 6 de febrero de 2019 .
- ↑ "nanoHUB.org" . Consultado el 8 de octubre de 2014 .
- ↑ "El mundo virtual es un signo del futuro para científicos e ingenieros" . Comunicado de prensa . Science Daily. 18 de julio de 2008. Consultado el 19 de septiembre de 2011 .
- ↑ "Colaboradores" . Sitio web oficial de nanoHUB.org . Consultado el 19 de septiembre de 2011 .
- ↑ Diana G. Oblinger (agosto de 2007). "nanoHUB" (PDF) . Documento ELI 7. Iniciativa de Aprendizaje Educause . Archivado del original (PDF) el 5 de octubre de 2011. Recuperado el 19 de septiembre de 2011 .
- ↑ "nanoFORGE: Herramientas disponibles" . Sitio web de nanoHUB . Consultado el 19 de septiembre de 2011 .
- ↑ "infraestructura:rappture" . Consultado el 8 de octubre de 2014 .
- ↑ Sebastien Goasguen (2007). «Arquitectura de cuadrícula para comunidades científicas». Entornos de resolución de problemas basados en cuadrícula . IFIP, Federación Internacional para el Procesamiento de la Información. Vol. 239. Federación Internacional para el Procesamiento de la Información. pág. 397. doi : 10.1007/978-0-387-73659-4_23 . ISBN 978-0-387-73658-7. S2CID 35004767 .
- ↑ "Citas" . Sitio web nanoHUB.org . Consultado el 19 de septiembre de 2011 .
- ↑ James R. Bottum; James F. Davis; Peter M. Siegel; Brad Wheeler y Diana G. Oblinger (julio-agosto de 2008). «Ciberinfraestructura: en sintonía con el futuro» . Educause Review . Vol. 43, n.º 4. Archivado del original el 7 de septiembre de 2008. Consultado el 19 de septiembre de 2011 .
- ↑ "Grupo: NanoHUB-U" .
Lecturas adicionales
- Revista EDUCAUSE, vol. 42, n.º 6 - nanoHUB: Comunidad y colaboración
- Publicaciones relacionadas con HUBzero
- Recursos federales para la excelencia educativa
- IBM.com: nanoHUB hace bien el trabajo de computación remota.
- Alan Henry (28 de agosto de 2007). "Científicos se conectan en nanoHUB" . Appscout . Archivado del original el 16 de julio de 2011.
Enlaces externos
- Sitio web oficial
- Ciberinfraestructura
- instituciones de nanotecnología