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Articulo de referencia

Nanobdellota

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Nanobdellota (anteriormente "Nanoarchaeota" , [ 1 ] del griego "enano o pequeño ser antiguo") es un filo de Archaea . [ 2 ] La primera especie descubierta, Nanoarchaeum equitans , fue de una chimenea hidrotermal submarina en Islandia y descrita en 2002. [ 3 ] El nombre del filo deriva de la especie Nanobdella (del griego nânos, enano; bdella, sanguijuela) aerobiophila descubierta de una fuente termal terrestre en Japón.

Descubrimiento y taxonomía

A finales de la década de 1990, se reconocieron tres grupos de arqueas: Crenarchaeota, Euryarchaeota y Korarchaeota. Estos grupos fueron designados de diversas maneras como reinos o filos. [ 4 ] [ 5 ] En 2002, Harald Huber y sus colegas de la Universidad de Ratisbona y del Instituto Max Planck de Investigación Médica descubrieron una nueva arquea en una chimenea hidrotermal submarina en Islandia. [ 6 ] La especie no pudo encajar en ninguno de los grupos conocidos, por lo que crearon un nuevo filo, "Nanoarchaeota", para la nueva especie a la que denominaron Nanoarchaeum equitans. [ 7 ]

En 2022, científicos japoneses liderados por Shingo Kato describieron una nueva especie, Nanobdella aerobiophila, descubierta en una fuente termal terrestre en Japón. Para su clasificación, crearon la familia Nanobdellaceae, el orden Nanobdellales y la clase Nanobdellia. [ 8 ] En 2023, introdujeron un nuevo filo, Nanobdellota, para la especie. [ 9 ] Según el Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas (ICNP, Código Procariota ) revisado de 2022, el nombre de un taxón no puede crearse utilizando la misma ortografía que el taxón raíz, el nombre del género, que no está válidamente publicado . Nanoarchaeota no era un nombre válidamente publicado, mientras que Nanobdella sí lo es y [ 10 ] por lo tanto, Nanobdellota se acepta como el nombre correcto del filo, y se creó un nuevo reino, Nanobdellati, en 2023. [ 11 ] [ 12 ]

Especies y diversidad

Los miembros de Nanobdellota se asocian con diferentes organismos hospedadores y condiciones ambientales. [ 13 ] A pesar de su pequeño tamaño, genoma reducido y respiración limitada, poseen características metabólicas inusuales. Por ejemplo, N. equitans tiene un sistema de comunicación intercelular complejo y altamente desarrollado. [ 14 ]

La filogenia de los Nanobdellota está anclada por su único representante cultivado, Nanoarchaeum equitans , que se agrupa en un grupo evolutivo separado de otras arqueas, [ 15 ] [ 16 ] que han sido reclasificadas recientemente. Un análisis posterior ha demostrado que N. equitans divergió tempranamente en la evolución de las arqueas, como lo indica la secuencia del ARNr 16S . Esto sugiere que ocupa una posición de ramificación profunda dentro de este grupo. [ 17 ]

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 18 ] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 19 ]

  • Clase Nanobdellia Kato et al. 2022 [ 23 ] ["Nanoarchaea" Huber et al. 2011 ; [ 24 ] "Nanoarchaeia" Vázquez-Campos et al. 2021 [ 25 ] ]
    • Orden "Tiddalikarchaeales" Vázquez-Campos et al. 2021 [ 25 ]
      • Familia "Tiddalikarchaeaceae" Vázquez-Campos et al. 2021 [ 25 ]
    • Orden "Jingweiarchaeales" Rao et al. 2023
      • Familia "Jingweiarchaeaceae" Rao et al. 2023
        • Género " Candidatus Jingweiarchaeum " Rao et al. 2023
          • " Ca. J. tengchongense" Rao et al. 2023
    • Orden "Parvarchaeales" Rinke et al. 2020 [ 26 ]
      • Familia "Parvarchaeaceae" Rinke et al. 2020 [ 26 ] ["Acidifodinimicrobiaceae" Luo et al. 2020 [ 27 ] ]
        • Género " Candidatus Rehaiarchaeum " Rao et al. 2023
          • " Ca. R. fermentans" Rao et al. 2023
        • Género " Candidatus Acidifodinimicrobium " Luo et al. 2020 [ 27 ]
          • " Ca. A. mancum" Luo et al. 2020 [ 27 ]
        • Género " Candidatus Parvarchaeum " Baker et al. 2010 [ 28 ]
          • " Ca. P. acidiphilum" Baker et al. 2010 [ 28 ]
          • " Ca. P. paracidiphilum" corrig. Panadero y col. 2010 [ 28 ]
          • " Ca. P. tengchongense" Rao et al. 2023
    • Orden Nanobdellales Kato et al. 2022 [ 23 ] [Nanoarchaeales Huber et al. 2011 [ 24 ] ]
      • Familia "Nanoarchaeaceae" Huber et al. 2011 [ 24 ]
      • Familia Nanobdellaceae Kato et al. 2022 [ 23 ] ["Nanopusillaceae" Huber et al. 2011 [ 24 ] ]
        • Género Nanobdella Kato et al. 2022 [ 23 ]
          • N. aerobiophila Kato et al. 2022 [ 23 ]
        • Género " Candidatus Nanoclepta " St. John et al. 2019 [ 29 ]
          • " Ca. N. minuta" St. John et al. 2019 [ 29 ]
        • Género " Candidatus Nanopusillus " Wurch et al. 2016 [ 30 ]
          • " Ca. N. acidilobi" Wurch et al. 2016 [ 30 ]
          • ?" Ca. N. massiliensis" Hassani et al. 2022
          • ?" Ca. N. phoceensis" Hassani et al. 2024
          • " Ca. N. stetteri" (Castelle et al. 2015) Rinke et al. 2020 [ 26 ]
    • Familia "Haiyanarchaeaceae" Rao et al. 2023
      • Género " Candidatus Haiyanarchaeum " Rao et al. 2023
        • " Ca. H. thermophilum" Rao et al. 2023
Nanoarqueo equitans

Características

Las células de N. equitans son esféricas con un diámetro de aproximadamente 400 nm , [ 3 ] y tienen una secuencia de ADN muy corta y compacta, con todo el genoma conteniendo solo 490.885 pares de bases . [ 16 ] Si bien tienen el código genético para llevar a cabo el procesamiento y la reparación, no pueden llevar a cabo ciertos procesos biosintéticos y metabólicos como la síntesis de lípidos, aminoácidos, cofactores o nucleótidos . [ 16 ] Debido a su maquinaria limitada, es un parásito obligado, el único conocido en las arqueas. [ 16 ] Debido a sus inusuales secuencias de ARNr monocatenario, son difíciles de detectar utilizando métodos estándar de reacción en cadena de la polimerasa . [ 31 ] Las células de N. equitans contienen una capa S normal con simetría séxtuple y una constante de red de 15  nm. [ 31 ]

Estructura del genoma

Las nanoarqueotas se caracterizan por células pequeñas de entre 100 y 400  nm de diámetro y genomas altamente simplificados de 0,491-0,606 Mbp. [ 32 ] Los genomas de las nanoarqueotas descritas muestran diferentes grados de reducción, lo cual es compatible con un estilo de vida dependiente del huésped. [ 32 ] Ciertas nanoarqueotas aún poseen genes para los sistemas CRISPR-Cas , flagelos arqueales y la vía de la gluconeogénesis . [ 32 ]

Hábitat

Las nanoarqueotas son simbiontes obligados que crecen adheridos a un huésped arqueal conocido como Ignicoccus . [ 33 ] Tanto las fuentes termales terrestres como las chimeneas hidrotermales submarinas han producido aislamientos del género Nanoarchaeum . [ 34 ] Sin embargo, hay evidencia de que las nanoarqueotas residen en una variedad de hábitats fuera de las chimeneas termales marinas. [ 13 ]   Se ha descubierto evidencia genética de miembros de Nanoarchaeota que es omnipresente en fuentes termales terrestres y hábitats hipersalinos mesófilos utilizando cebadores creados basados ​​en la secuencia del gen 16S rRNA de Nanoarchaeum equitans . [ 13 ] Además, el descubrimiento de secuencias ribosomales en muestras de agua de la zona fótica tomadas lejos de las chimeneas hidrotermales plantea la posibilidad de que Nanoarchaeota sea un grupo ubicuo y diversificado de Archaea que puede vivir en hábitats con una variedad de temperaturas y entornos geoquímicos. [ 13 ]

Metabolismo

Aunque se desconoce gran parte del metabolismo de los miembros de Nanoarchaeota, su huésped es un autótrofo que crece utilizando azufre elemental como aceptor de electrones e H₂ como donador de electrones . [ 34 ] La mayoría de los procesos metabólicos reconocidos, como la creación de monómeros como aminoácidos, nucleótidos y coenzimas , carecen de genes reconocibles en este organismo. [ 34 ]

Véase también

Referencias

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  2. ↑ Véase la página web del NCBI sobre Nanoarchaeota . Datos extraídos de los "Recursos taxonómicos del NCBI" . Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 19 de marzo de 2007 .
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  5. ↑ Tourasse, Nicolas J.; Gouy, Manolo (1999-10-01). "Considerando la variación de la tasa evolutiva entre sitios de secuencia cambia consistentemente las filogenias universales deducidas de los genes de ARNr y codificadores de proteínas" . Filogenética molecular y evolución . 13 (1): 159– 168. Bibcode : 1999MolPE..13..159T . doi : 10.1006/mpev.1999.0675 . ISSN 1055-7903 . PMID 10508549 .  
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Lecturas adicionales

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