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Articulo de referencia

Centro de Bioinformática de los Países Bajos

El Centro de Bioinformática de los Países Bajos o NBIC [ 1 ] (2003–2013) fue una organización neerlandesa, financiada por el gobierno, que coordinó todo el trabajo académico sob...

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El Centro de Bioinformática de los Países Bajos o NBIC [ 1 ] (2003–2013) fue una organización neerlandesa, financiada por el gobierno, que coordinó todo el trabajo académico sobre bioinformática en los Países Bajos . [ 2 ] NBIC constaba de programas para investigación (BioRange), para educación (BioWise) y para apoyo (BioAssist). Los socios de NBIC son todas las universidades y hospitales universitarios neerlandeses , y algunas entidades comerciales. La oficina central de NBIC estaba ubicada en el Centro de Informática Molecular y Biomolecular (CMBI) en el Centro Médico de la Universidad de Radboud de Nijmegen .

Historia

En 2003 se lanzó NBIC [ 3 ] como una organización sin fines de lucro , para fortalecer y organizar la investigación bioinformática en los Países Bajos . NBIC es uno de los cuatro centros de tecnología facilitadora que fueron iniciados por la Iniciativa de Genómica de los Países Bajos (NGI) [ 4 ] para mejorar la investigación basada en genómica en los Países Bajos. Los otros tres centros de tecnología son: el Centro de Proteómica de los Países Bajos (NPC), [ 5 ] el Centro de Metabolómica de los Países Bajos (NMC) [ 6 ] y el Consorcio de Biología de Sistemas de los Países Bajos (NCSB). [ 7 ] La ​​mayoría de los servicios se trasladaron al Centro Tecnológico de Ciencias de la Vida de los Países Bajos en 2015. [ 8 ]

Fondos

El Centro de Bioinformática de los Países Bajos fue financiado por el gobierno neerlandés a través de la Iniciativa de Genómica de los Países Bajos (NGI) [ 9 ] y el programa BSIK [ 10 ] (infraestructuras del conocimiento).

Apoyo

El departamento de soporte de NBIC, BioAssist, está formado por grupos de trabajo que reúnen a expertos en los distintos campos de la bioinformática. Juntos, identifican problemas comunes en su campo y se proponen resolverlos de forma colaborativa. BioAssist también cuenta con un grupo, BioInformatics Research Support (BRS), [ 11 ] [ 12 ] que ayuda a profesionales biológicos y médicos con proyectos bioinformáticos de corta duración.

Educación

La sección educativa de NBIC, BioWise, organiza cursos y capacitaciones en diferentes niveles. Ofrecen capacitación de sensibilización en escuelas, [ 13 ] colaboran con los distintos programas de educación en bioinformática de las universidades de los Países Bajos y organizan capacitaciones para estudiantes de doctorado . Además, se organizan capacitaciones y conferencias especializadas, tanto a nivel nacional como con otros socios internacionales, como el Instituto Suizo de Bioinformática .

Logros

Organización de la investigación bioinformática

NBIC se asoció con universidades de ciencias aplicadas (UAS) holandesas en la red LOBIN. En julio de 2011, cuatro UAS se habían unido. [ 14 ]

Software de bioinformática

Una amplia variedad de software bioinformático ha sido creado por personas involucradas en NBIC. [ 15 ] NBIC también alojaba un servicio para coordinar el desarrollo de software (servidor Trac con versiones de software y documentación de proyectos). [ 16 ] Muchas herramientas también están disponibles a través del propio servidor abierto Galaxy de NBIC . [ 17 ]

Se han dado los primeros pasos para incluir entidades comerciales, entre otras, a través de la Plataforma de Usuarios Industriales de Bioinformática (BIUP). La BIUP, aunque todavía se encontraba en su fase inicial a mediados de 2011, ya había atraído a socios como DSM .

Construcción de comunidad

Gran parte de los esfuerzos del NBIC se centran en desarrollar nuevas comunidades de bioinformática o fortalecer las existentes. Por ejemplo, el NBIC organizó la Conferencia de la Comunidad Galaxy de 2011. [ 18 ] La Plataforma de Bioinformática para Proteómica de los Países Bajos (NBPP, por sus siglas en inglés) es una iniciativa conjunta del Centro de Bioinformática de los Países Bajos (NBIC) y el Centro de Proteómica de los Países Bajos (NPC).

La reunión inaugural de la Organización Global para el Aprendizaje, la Educación y la Capacitación en Bioinformática (GOBLET) se celebró en NBIC en noviembre de 2012. [ 19 ]

Referencias

  1. ↑ Sitio web de NBIC
  2. ^ van Gelder, Celia WG; Hooft, Rob WW; van Rijswijk, Merlijn N.; van den Berg, Linda; Kok, Rubén G.; Reinders, Marcel; Mons, Barend; Heringa, Jaap (15 de septiembre de 2017). "Bioinformática en los Países Bajos: el valor de una comunidad nacional" . Sesiones informativas en Bioinformática . 20 (2): 375– 383. doi : 10.1093/bib/bbx087 . PMC 6433734 . PMID 28968694 .  
  3. ↑ Información de la Iniciativa de Genómica de los Países Bajos sobre NBIC
  4. ↑ Resumen de los Centros de Genómica de NGI
  5. ↑ Sitio web del Centro de Proteómica de los Países Bajos
  6. ↑ Sitio web del Centro de Metabolómica de los Países Bajos
  7. ↑ "Sitio web del Consorcio Neerlandés de Biología de Sistemas" . Archivado del original el 25 de enero de 2012. Consultado el 27 de febrero de 2012 .
  8. ↑ "NBIC: Las actividades de BioAssist se transfieren al programa de datos DTL" . www.nbic.nl. Consultado el 2 de marzo de 2018 .
  9. ↑ Sitio web de la Iniciativa de Genómica de los Países Bajos
  10. ↑ Sitio web BSIK: Subvenciones besluit Investeringen Kennisinfrastructuur
  11. ↑ "Instalación de Ómicas de Biociencias" . 23 de noviembre de 2012.
  12. ↑ "NBIC: Apoyo a la investigación en bioinformática" . www.nbic.nl. Archivado del original el 31/10/2010.
  13. ↑ Bioinformatica in de klas
  14. ↑ Miembros de LOBIN
  15. ↑ Lista de productos de software clave de NBIC
  16. ↑ Servidor NBIC Trac
  17. ↑ Servidor NBIC Galaxy
  18. ↑ Página principal de la Conferencia de la Comunidad Galaxy 2011
  19. ↑ "Reunión BTN/GOBLET | GOBLET" . www.mygoblet.org . Consultado el 24 de agosto de 2016 .