Lista de software para síntesis orgánica asistida por ordenador.

El software de síntesis orgánica asistida por ordenador (CAOS) es un tipo de software de aplicación utilizado en química orgánica junto con la química computacional para facilitar las tareas de diseño, predicción y producción de reacciones químicas . El objetivo del CAOS es identificar una serie de reacciones químicas que, a partir de un compuesto de partida, puedan producir la molécula deseada . Los algoritmos del CAOS suelen utilizar dos bases de datos : una primera de reacciones químicas conocidas y una segunda de materiales de partida conocidos (es decir, moléculas disponibles comercialmente). Los planes sintéticos deseables son más económicos, tienen un alto rendimiento y evitan el uso de reacciones e intermedios peligrosos. Si bien generalmente se plantea como un problema de planificación, se han logrado avances significativos en el campo del CAOS.

• M1 RetroScore impulsado por CAS : demostración disponible, basada en modelos de aprendizaje automático entrenados con datos de CAS SciFinder.
• Syntheseus –
• ChemAIRS – demo disponible, desarrollado por Chemical.AI como un paquete de software comercial. Además de la retrosíntesis, la herramienta cuenta con algunas funciones únicas como la puntuación de accesibilidad sintética (SA) y la química de procesos. ^{[ 1 ]}
• Spaya – Herramienta de planificación de retrosíntesis de acceso libre proporcionada por Iktos. Archivada el 11/06/2023 en Wayback Machine.
• IBM RXN es un servicio gratuito basado en la nube, desarrollado por IBM , que utiliza modelos de IA para predecir reacciones químicas y generar rutas de retrosíntesis. Para los suscriptores de pago, este conjunto de herramientas también ofrece funcionalidades adicionales, como la integración robótica y el ajuste fino de modelos.
• AiZynthFinder: una herramienta de planificación retrosintética de código abierto y acceso gratuito, desarrollada en colaboración entre AstraZeneca y la Universidad de Berna. AiZynthFinder predice rutas sintéticas para un compuesto objetivo determinado y puede reentrenarse con el conjunto de datos del usuario, ya sea de fuentes públicas o privadas. ^{[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]}

• Manifold – Herramienta de búsqueda de compuestos y planificación de retrosíntesis de acceso libre para usuarios académicos, desarrollada por PostEra. Archivada el 13 de enero de 2022 en Wayback Machine.
• WODCA – sin versión de prueba; software propietario ^{[ 5 ]}
• Herramienta de exploración de síntesis orgánica (OSET) – software de código abierto , abandonado ^{[ 6 ]}
• CHIRON – sin versión de prueba; software propietario ^{[ 7 ]}
• SynGen – versión demo; software propietario ; un programa único para la generación automática de síntesis orgánica; se centra en generar las rutas sintéticas más cortas y de menor coste para un compuesto orgánico objetivo determinado, y por lo tanto es una herramienta útil para la planificación de la síntesis.
• LHASA – demostración disponible pero sin enlace (?); software propietario
• SYLVIA – versión demo; software propietario ; evalúa rápidamente la facilidad de síntesis de compuestos orgánicos; puede priorizar miles de estructuras (por ejemplo, generadas por experimentos de diseño de novo o recuperadas de grandes bibliotecas virtuales de compuestos) según su complejidad sintética ^{[ 8 ].}
• ChemPlanner (anteriormente ARChem – Route Designer) es un sistema experto que ayuda a los químicos a diseñar rutas sintéticas viables para sus moléculas objetivo; la base de conocimientos de las reglas de reacción se deriva algorítmicamente de bases de datos de reacciones, y los materiales de partida disponibles comercialmente se utilizan como puntos de terminación para la búsqueda retrosintética.
• ICSYNTH – demo disponible; software propietario ; una herramienta de diseño de síntesis asistida por computadora que permite a los químicos generar rutas sintéticas para una molécula objetivo y un árbol de síntesis interactivo de múltiples pasos; en su núcleo se encuentra una base de conocimiento químico algorítmica de bibliotecas de transformaciones que se generan automáticamente a partir de bases de datos de reacciones. ^{[ 9 ]}
• Chematica (ahora conocida como Synthia)
• ASKCOS – Conjunto de herramientas de código abierto para la planificación de síntesis y la química computacional. ^{[ 10 ]}

• Comparación de software para modelado de mecánica molecular
• Software de diseño molecular
• editor de moléculas
• Modelado molecular en GPU
• Lista de software para el modelado de nanoestructuras
• Métodos de química cuántica semiempíricos
• Métodos químicos computacionales en física del estado sólido , con condiciones de contorno periódicas.
• Programas de bonos de valencia