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PADI4

La proteína arginina deiminasa tipo 4 es una proteína humana que en los humanos está codificada por el gen PADI4 . [ 5 ] [ 6 ] La proteína como enzima , específicamente la prote...

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La proteína arginina deiminasa tipo 4 es una proteína humana que en los humanos está codificada por el gen PADI4 . [ 5 ] [ 6 ] La proteína como enzima , específicamente la proteína arginina deiminasa , es un tipo de hidrolasa .

Biología molecular

El gen humano se encuentra en el brazo corto del cromosoma 1, cerca del telómero (1p36.13). Está ubicado en la cadena Watson (positiva) y tiene una longitud de 55.806 bases. La proteína tiene 663 aminoácidos y un peso molecular de 74.095 Da. [ 5 ]

Función

Este gen pertenece a una familia de genes que codifica enzimas responsables de la conversión de residuos de arginina a citrulina ( citrulinación ). Este gen puede desempeñar un papel en el desarrollo de granulocitos y macrófagos , lo que conduce a la inflamación y la respuesta inmunitaria. [ 6 ] PADI4 desempeña un papel en la epigenética , [ 7 ] la deiminación de argininas en las histonas H3 y H4 puede actuar de forma antagónica a la metilación de arginina . [ 8 ]

Esta proteína se puede encontrar en oligómeros y se une a 5 iones de calcio por subunidad. Cataliza la siguiente reacción:

  • Proteína L - arginina + H₂O = proteína L -citrulina + NH₄⁺

Distribución subcelular y tisular

Normalmente se encuentra en el citoplasma , el núcleo y los gránulos citoplasmáticos de los eosinófilos y neutrófilos . No se expresa en monocitos ni linfocitos periféricos . También se expresa en el tejido sinovial de pacientes con artritis reumatoide .

Referencias

  1. 1 2 3 ENSG00000159339 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000280908, ENSG00000159339 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000025330 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 Nakashima K, Hagiwara T, Ishigami A, Nagata S, Asaga H, Kuramoto M, et al. (septiembre de 1999). "Caracterización molecular de la peptidilarginina deiminasa en células HL-60 inducida por ácido retinoico y 1alfa,25-dihidroxivitamina D(3)" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (39): 27786– 27792. doi : 10.1074/jbc.274.39.27786 . PMID 10488123 .  
  6. 1 2 "Gen Entrez: PADI4 peptidil arginina deiminasa, tipo IV" .
  7. ↑ Sams KL, Mukai C, Marks BA, Mittal C, Demeter EA, Nelissen S, et al. (octubre de 2022). "Pubertad tardía, anomalías en las gonadotropinas y subfertilidad en ratones machos con doble deleción de Padi2/Padi4" . Reproductive Biology and Endocrinology . 20 (1): 150. doi : 10.1186/s12958-022-01018-w . PMC 9555066. PMID 36224627 .   
  8. ↑ Kouzarides T (febrero de 2007). "Modificaciones de la cromatina y su función" . Cell . 128 (4): 693–705 . doi : 10.1016/j.cell.2007.02.005 . PMID 17320507 . 

Lecturas adicionales

  • Nakashima K, Hagiwara T, Ishigami A, Nagata S, Asaga H, Kuramoto M, et  al. (septiembre de 1999). "Caracterización molecular de la peptidilarginina deiminasa en células HL-60 inducida por ácido retinoico y 1alfa,25-dihidroxivitamina D(3)" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (39): 27786– 27792. doi : 10.1074/jbc.274.39.27786 . PMID 10488123 . 
  • Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, et  al. (octubre de 2000). "Clonación y análisis funcional de ADNc con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente no definidos expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+" . Genome Research . 10 (10): 1546– 1560. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934. PMID 11042152 .  
  • Asaga H, Nakashima K, Senshu T, Ishigami A, Yamada M (julio de 2001). "Localización inmunocitoquímica de la peptidilarginina deiminasa en eosinófilos y neutrófilos humanos". Journal of Leukocyte Biology . 70 (1): 46– 51. doi : 10.1189/jlb.70.1.46 . PMID 11435484. S2CID 11448270 .  
  • Nakashima K, Hagiwara T, Yamada M (diciembre de 2002). "Localización nuclear de la peptidilarginina deiminasa V y la deiminación de histonas en granulocitos" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (51): 49562– 49568. doi : 10.1074/jbc.M208795200 . PMID 12393868 . 
  • Suzuki A, Yamada R, Chang X, Tokuhiro S, Sawada T, Suzuki M, et  al. (agosto de 2003). "Los haplotipos funcionales de PADI4, que codifican la enzima citrulinante peptidilarginina deiminasa 4, están asociados con la artritis reumatoide". Nature Genetics . 34 (4): 395– 402. doi : 10.1038/ng1206 . PMID 12833157. S2CID 20136298 .  
  • Barton A, Bowes J, Eyre S, Spreckley K, Hinks A, John S, Worthington J (abril de 2004). "Un haplotipo funcional del gen PADI4 asociado con la artritis reumatoide en una población japonesa no está asociado en una población del Reino Unido". Arthritis and Rheumatism . 50 (4): 1117– 1121. doi : 10.1002/art.20169 . PMID 15077293 . 
  • Chavanas S, Méchin MC, Takahara H, Kawada A, Nachat R, Serre G, Simon M (abril de 2004). "Análisis comparativo de los grupos de genes de peptidilarginina deiminasa de ratón y humano revela segmentos no codificantes altamente conservados y un nuevo gen humano, PADI6". Gene . 330 : 19–27 . doi : 10.1016/j.gene.2003.12.038 . PMID 15087120 . 
  • Arita K, Hashimoto H, Shimizu T, Nakashima K, Yamada M, Sato M (agosto de 2004). "Base estructural para la activación de PAD4 humana inducida por Ca(2+)". Nature Structural & Molecular Biology . 11 (8): 777– 783. doi : 10.1038/nsmb799 . PMID 15247907. S2CID 11947135 .  
  • Hoppe B, Heymann GA, Tolou F, Kiesewetter H, Doerner T, Salama A (noviembre de 2004). "Alta variabilidad de la peptidilarginina deiminasa 4 (PADI4) en una población blanca sana: caracterización de seis nuevas variantes de los exones 2-4 de PADI4 mediante un nuevo enfoque basado en la secuenciación específica de haplotipos". Journal of Molecular Medicine . 82 (11): 762– 767. doi : 10.1007/s00109-004-0584-6 . PMID 15338034. S2CID 8356741 .  
  • Cuthbert GL, Daujat S, Snowden AW, Erdjument-Bromage H, Hagiwara T, Yamada M, et  al. (septiembre de 2004). " La deiminación de histonas antagoniza la metilación de arginina" . Cell . 118 (5): 545– 553. doi : 10.1016/j.cell.2004.08.020 . PMID 15339660. S2CID 8948511 .  
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  • Lee YH, Coonrod SA, Kraus WL, Jelinek MA, Stallcup MR (marzo de 2005). "Regulación del ensamblaje y la función del complejo coactivador mediante la metilación y desmetiliminación de la arginina de la proteína" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 102 (10): 3611– 3616. Bibcode : 2005PNAS..102.3611L . doi : 10.1073/pnas.0407159102 . PMC 553305. PMID 15731352 .  
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  • Chang X, Han J (marzo de 2006). " Expresión de la peptidilarginina deiminasa tipo 4 (PAD4) en varios tumores". Carcinogénesis molecular . 45 (3): 183– 196. doi : 10.1002/mc.20169 . PMID 16355400. S2CID 40916607 .  
  • Plenge RM, Padyukov L, Remmers EF, Purcell S, Lee AT, Karlson EW, et  al. (diciembre de 2005). "Replicación de supuestas asociaciones de genes candidatos con artritis reumatoide en >4000 muestras de Norteamérica y Suecia: asociación de susceptibilidad con PTPN22, CTLA4 y PADI4" . American Journal of Human Genetics . 77 (6): 1044–1060 . doi : 10.1086/498651 . PMC 1285162. PMID 16380915 .  
  • Hoppe B, Häupl T, Gruber R, Kiesewetter H, Burmester GR, Salama A, Dörner T (2006). "Análisis detallado de la variabilidad de la peptidilarginina deiminasa tipo 4 en pacientes alemanes con artritis reumatoide: un estudio de casos y controles" . Arthritis Research & Therapy . 8 (2): R34. doi : 10.1186/ar1889 . PMC 1526594. PMID 16469113 .