Hispanopedia WikiPATRIC [ 1 ] (Centro de Integración de Recursos de Patosistemas) era un sitio web de bioinformática bacteriana del Centro de Recursos de Bioinformática , creado originalmente en 2004. [ 2 ] Posteriormente se combinó con la Base de Datos de Investigación de la Influenza y el Centro de Recursos de Análisis y Base de Datos de Patógenos Virales para crear el Centro de Recursos de Bioinformática Bacteriana y Viral (BV-BRC). [ 3 ] Es un sistema de información que integra bases de datos y herramientas de análisis. Se centra en diversos datos (transcriptómicos, proteómicos, estructurales y bioquímicos) relacionados con patógenos bacterianos. PATRIC facilita la integración de diversos tipos de información sobre patógenos para apoyar la investigación biomédica sobre enfermedades infecciosas bacterianas.
Historia
PATRIC se inició como un proyecto de la División de Ciberinfraestructura de Virginia Tech y está financiado por los Institutos Nacionales de Alergias y Enfermedades Infecciosas ( NIAID ), un componente de los Institutos Nacionales de Salud ( NIH ). PATRIC utiliza datos filogenómicos bacterianos disponibles, datos proteómicos y otros datos experimentales diversos vinculados a patógenos específicos de numerosas fuentes. [ 4 ] La plataforma PATRIC proporciona una interfaz para la genómica comparativa . En 2019, el NIAID otorgó financiación adicional al Dr. Rick Stevens de la Universidad de Chicago para el Centro de Recursos Bioinformáticos, que actualmente engloba a PATRIC. [ 5 ]
Cobertura bacteriana
PATRIC incluye datos sobre las siguientes especies bacterianas:
Véase también
Referencias
- ↑ Gillespie JJ, Wattam AR, Cammer SA, Gabbard JL, Shukla MP, Dalay O, et al. (noviembre de 2011). " PATRIC: el recurso bioinformático bacteriano integral con un enfoque en especies patógenas humanas" . Infection and Immunity . 79 (11): 4286– 4298. doi : 10.1128/IAI.00207-11 . PMC 3257917. PMID 21896772 .
- ↑ Davis JJ, Wattam AR, Aziz RK, Brettin T, Butler R, Butler RM, et al. (enero de 2020). "El Centro de Recursos Bioinformáticos PATRIC: ampliando las capacidades de datos y análisis" . Nucleic Acids Research . 48 (D1) gkz943: D606– D612. doi : 10.1093/nar/ gkz943 . PMC 7145515. PMID 31667520 .
- ↑ Olson RD, Assaf R, Brettin T, Conrad N, Cucinell C, Davis JJ, et al. (enero de 2023). "Presentación del Centro de Recursos Bioinformáticos Bacterianos y Virales (BV-BRC): un recurso que combina PATRIC, IRD y ViPR" . Nucleic Acids Research . 51 (D1): D678– D689. doi : 10.1093/nar/gkac1003 . PMC 9825582. PMID 36350631 .
- ↑ Sobral B, Mao C, Shukla M, Sullivan D, Zhang C (3 de enero de 2013). «Investigación de enfermedades infecciosas basada en la informática». En Fred A, Gamboa H, Filipe J (eds.). Sistemas y tecnologías de ingeniería biomédica . Springer Berlin. pp. 3–11 . ISBN 9783642297526Consultado el 5 de marzo de 2022 .
- ↑ "Centros de Recursos Bioinformáticos para Enfermedades Infecciosas" . RePORTER . Institutos Nacionales de Salud de EE. UU. Número de proyecto 75N93019C00076-P00001-9999-1 . Consultado el 1 de diciembre de 2023 .
Enlaces externos
- Sitio web oficial
- Centros de Recursos Bioinformáticos. Página del NIAID que describe los objetivos y actividades de los BRC.
- Sitio web central del portal de patógenos para los cinco BRC; proporciona información resumida de todos los BRC.
- organizaciones de resistencia antimicrobiana
- Bases de datos biológicas
