La protocadherina alfa-12 es una proteína que en humanos está codificada por el gen PCDHA12 . [ 5 ] [ 6 ]
Este gen pertenece al grupo de genes alfa de la protocadherina, uno de los tres grupos de genes relacionados que se encuentran en tándem en el cromosoma 5 y que presentan una organización genómica inusual, similar a la de los grupos de genes de los receptores de células B y T. El grupo de genes alfa está compuesto por 15 genes de la superfamilia de las cadherinas , relacionados con los genes CNR del ratón, y consta de 13 secuencias codificantes muy similares y dos más distantemente relacionadas. La disposición en tándem de 15 exones N-terminales, o exones variables, va seguida de exones C-terminales , o exones constantes, que son compartidos por todos los genes del grupo. Los grandes exones N-terminales, sin interrupción, codifican cada uno seis ectodominios de cadherina, mientras que los exones C-terminales codifican el dominio citoplasmático. Estas proteínas de adhesión celular, similares a las cadherinas neuronales , son proteínas integrales de la membrana plasmática que probablemente desempeñan un papel fundamental en el establecimiento y la función de conexiones intercelulares específicas en el cerebro. Se ha observado empalme alternativo y se han sugerido variantes adicionales, pero aún no se ha determinado su naturaleza de longitud completa. [ 6 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000251664 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000007440 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ Wu Q, Maniatis T (julio de 1999). "Una organización sorprendente de una gran familia de genes de adhesión celular similares a la cadherina neural humana" . Cell . 97 ( 6): 779–90 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80789-8 . PMID 10380929. S2CID 6014717 .
- 1 2 "Entrez Gene: PCDHA12 protocadherina alfa 12" .
Lecturas adicionales
- Yagi T, Takeichi M (2000). " Genes de la superfamilia de las cadherinas: funciones, organización genómica y diversidad neurológica" . Genes Dev . 14 (10): 1169– 80. doi : 10.1101/gad.14.10.1169 . PMID 10817752. S2CID 44844497 .
- Nollet F, Kools P, van Roy F (2000). "El análisis filogenético de la superfamilia de las cadherinas permite la identificación de seis subfamilias principales, además de varios miembros solitarios". J. Mol. Biol . 299 (3): 551– 72. doi : 10.1006/jmbi.2000.3777 . PMID 10835267 .
- Martineau J, Barthélémy C, Jouve J, et al. (1992). "Monoaminas (serotonina y catecolaminas) y sus derivados en el autismo infantil: cambios relacionados con la edad y efectos de los fármacos". Developmental Medicine & Child Neurology . 34 (7): 593– 603. doi : 10.1111/j.1469-8749.1992.tb11490.x . PMID 1380929. S2CID 28807066 .
- Sugino H, Hamada S, Yasuda R, et al. (2000). "Organización genómica de la familia de genes de cadherina CNR en ratones y humanos". Genomics . 63 (1): 75– 87. doi : 10.1006/geno.1999.6066 . PMID 10662547 .
- Wu Q, Maniatis T (2000). "Los exones grandes que codifican múltiples ectodominios son una característica distintiva de los genes de protocadherina" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3124– 9. Bibcode : 2000PNAS...97.3124W . doi : 10.1073 /pnas.060027397 . PMC 16203. PMID 10716726 .
- Wu Q, Zhang T, Cheng JF, et al. (2001). "Análisis comparativo de secuencias de ADN de grupos de genes de protocadherina de ratón y humanos" . Genome Res . 11 (3): 389– 404. doi : 10.1101/gr.167301 . PMC 311048. PMID 11230163 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Schmutz J, Martin J, Terry A, et al. (2004). "La secuencia de ADN y el análisis comparativo del cromosoma 5 humano" . Nature . 431 ( 7006): 268– 74. Bibcode : 2004Natur.431..268S . doi : 10.1038/nature02919 . PMID 15372022. S2CID 4373053 .
- Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). "Secuencia señal y trampa de palabras clave in silico para la selección de cDNA humanos de longitud completa que codifican proteínas de secreción o de membrana a partir de bibliotecas de cDNA con tapa de oligo" . DNA Res . 12 (2): 117–26 . doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
- Genes en el cromosoma 5 humano
- restos de proteínas