Articulo de referencia

PDLIM3

La proteína LIM asociada a la actina (ALP) , también conocida como proteína 3 del dominio PDZ y LIM, es una proteína que en humanos está codificada por el gen PDLIM3 . [ 5 ] [ 6...

La proteína LIM asociada a la actina (ALP) , también conocida como proteína 3 del dominio PDZ y LIM, es una proteína que en humanos está codificada por el gen PDLIM3 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] La ALP se expresa en gran medida en el músculo cardíaco y esquelético , donde se localiza en los discos Z y los discos intercalares . La función de la ALP es potenciar la reticulación de la actina por la alfa-actinina-2 y también parece ser esencial para la formación de la cavidad ventricular derecha y la función contráctil .

Estructura

ALP existe principalmente como dos variantes de empalme alternativo; una proteína de 39,2 kDa (364 aminoácidos) en el músculo esquelético y una proteína de 34,3 kDa (316 aminoácidos) en el músculo cardíaco y el músculo liso . [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] ALP tiene un dominio PDZ N-terminal y un dominio LIM C-terminal . Además, la subfamilia ALP contiene un dominio específico de 34 aminoácidos llamado motivo similar a ALP, que contiene secuencias consenso de la proteína quinasa C. [ 11 ] El dominio PDZ de ALP se une a la alfa actinina-2 , específicamente a sus repeticiones similares a la espectrina. [ 12 ] El dominio PDZ es un motivo compuesto de 80-120 aminoácidos con secuencias GLGF de cuatro residuos conservadas que interactúan típicamente con los extremos C de las proteínas del citoesqueleto. [ 13 ] La región de heterogeneidad en las dos isoformas se encuentra entre el dominio PDZ y el dominio LIM . [ 10 ] ALP se localiza en el cromosoma 4q35. [ 12 ] Se ha demostrado que la deleción de muscleblind-like 1 en ratones puede alterar el patrón de empalme de PDLIM3 . [ 14 ]

Función

Estudios han demostrado que la ALP está presente en la primera etapa de la miofibrilogénesis donde se une a la alfa actinina-2 , y esta asociación permanece intacta en las miofibrillas maduras donde la ALP se localiza en los discos Z y los discos intercalares . Sin embargo , la alfa actinina-2 no es necesaria para dirigir la ALP a las líneas Z. [ 15 ] Estudios en ratones knockout de ALP han demostrado que la ALP facilita el entrecruzamiento de filamentos de actina por la alfa actinina-2 , y la ausencia de ALP induce una formación anormal de la cámara ventricular derecha , displasia y cardiomiopatía . [ 16 ] Estudios adicionales que utilizan la deformación sistólica epicárdica del ventrículo derecho y el análisis de remodelación geométrica en estos animales revelaron que la ausencia de ALP disminuye la función contráctil del ventrículo derecho y altera el patrón de remodelación hipertrófica cardíaca . [ 17 ] Dos estudios que utilizan enfoques genómicos integradores para investigar modificadores genéticos de la deposición de colágeno [ 18 ] o capacidad intrínseca de carrera aeróbica (ARC) [ 19 ] han mapeado PDLIM3 a los respectivos loci de rasgos cuantitativos , lo que sugiere que ALP puede estar involucrada en redes moleculares relacionadas con estos fenómenos cardíacos.

Importancia clínica

Se ha observado inversión pericéntrica del cromosoma 4 en 10 pacientes, con defectos cardíacos asociados vinculados a deleciones terminales 4q35.1, que pueden afectar a PDLIM3 . [ 20 ]

Interacciones

ALP interactúa con:

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000154553 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000031636 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. Bouju S, Piétu G, Le Cunff M, Cros N, Malzac P, Pellissier JF, Pons F, Léger JJ, Auffray C, Dechesne CA (enero de 1999). "Exclusión del gen de la proteína LIM asociada a la actinina específica del músculo (ALP) de los genes candidatos de la distrofia muscular facioescapulohumeral (FSHD) 4q35". Trastornos neuromusculares . 9 (1): 3– 10. doi : 10.1016/S0960-8966(98)00087-X . PMID 10063829. S2CID 24449614 .  
  6. Piétu G, Alibert O, Guichard V, Lamy B, Bois F, Leroy E, Mariage-Sampson R, Houlgatte R, Soularue P, Auffray C (junio de 1996). "Nuevos transcritos genéticos expresados ​​preferentemente en músculos humanos revelados mediante hibridación cuantitativa de una matriz de ADNc de alta densidad" . Genome Research . 6 (6): 492– 503. doi : 10.1101/gr.6.6.492 . PMID 8828038 . 
  7. "Gen Entrez: PDLIM3 PDZ y dominio LIM 3" .
  8. "Secuencia de proteína para la proteína 3 del dominio PDZ y LIM humano (Uniprot: Q53GG5-2)" . Base de datos del Atlas de Proteínas de Organelas Cardíacas (COPaKB) . Archivado del original el 22 de junio de 2015. Consultado el 22 de junio de 2015 .
  9. "Secuencia de proteína para la proteína 3 del dominio PDZ y LIM humano (Uniprot: Q53GG5)" . Base de datos del Atlas de Proteínas de Organelas Cardíacas (COPaKB) . Archivado del original el 22 de junio de 2015. Consultado el 22 de junio de 2015 .
  10. 1 2 Pomiès P, Macalma T, Beckerle MC (octubre de 1999). "Purificación y caracterización de una proteína PDZ-LIM que se une a la alfa-actinina y que se regula positivamente durante la diferenciación muscular" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (41): 29242– 50. doi : 10.1074/jbc.274.41.29242 . PMID 10506181 . 
  11. Te Velthuis AJ, Isogai T, Gerrits L, Bagowski CP (7 de febrero de 2007). "Perspectivas sobre la evolución molecular de la familia PDZ/LIM e identificación de un nuevo motivo proteico conservado" . PLOS ONE . 2 (2): e189. Bibcode : 2007PLoSO...2..189T . doi : 10.1371/journal.pone.0000189 . PMC 1781342. PMID 17285143 .  
  12. 1 2 3 Xia H, Winokur ST, Kuo WL, Altherr MR, Bredt DS (octubre de 1997). "Proteína LIM asociada a la actinina: identificación de una interacción de dominio entre PDZ y motivos de repetición similares a la espectrina" . The Journal of Cell Biology . 139 (2): 507– 15. doi : 10.1083/jcb.139.2.507 . PMC 2139795. PMID 9334352 .  
  13. Ponting CP, Phillips C (marzo de 1995). "Dominios DHR en sintrofinas, sintasas de NO neuronales y otras proteínas intracelulares". Trends in Biochemical Sciences . 20 (3): 102–3 . doi : 10.1016/s0968-0004(00)88973-2 . PMID 7535955 . 
  14. Dixon DM, Choi J, El-Ghazali A, Park SY, Roos KP, Jordan MC, Fishbein MC, Comai L, Reddy S (12 de marzo de 2015). "La pérdida de muscleblind-like 1 produce patología cardíaca y persistencia de isoformas de empalme embrionarias" . Scientific Reports . 5 : 9042. Bibcode : 2015NatSR...5E9042D . doi : 10.1038/srep09042 . PMC 4356957. PMID 25761764 .  
  15. Henderson JR, Pomiès P, Auffray C, Beckerle MC (marzo de 2003). "Distribución de ALP y MLP durante la miofibrilogénesis en cardiomiocitos cultivados". Cell Motility and the Cytoskeleton . 54 (3): 254– 65. doi : 10.1002/cm.10102 . PMID 12589684 . 
  16. 1 2 Pashmforoush M, Pomiès P, Peterson KL, Kubalak S, Ross J, Hefti A, Aebi U, Beckerle MC, Chien KR (mayo de 2001). "Ratones adultos deficientes en la proteína del dominio LIM asociada a la actinina revelan una vía de desarrollo para la cardiomiopatía del ventrículo derecho". Nature Medicine . 7 (5): 591– 7. doi : 10.1038/87920 . PMID 11329061 . S2CID 1781328 .  
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  18. Lodder EM, Scicluna BP, Beekman L, Arends D, Moerland PD, Tanck MW, Adriaens ME, Bezzina CR (dic. 2014). "Un enfoque genómico integrador identifica múltiples genes implicados en la deposición de colágeno cardíaco" . Circulation: Cardiovascular Genetics . 7 (6): 790–8 . doi : 10.1161/CIRCGENETICS.114.000537 . PMID 25217174 . 
  19. Lee SJ, Ways JA, Barbato JC, Essig D, Pettee K, DeRaedt SJ, Yang S, Weaver DA, Koch LG, Cicila GT (septiembre de 2005). "Perfil de expresión génica de los ventrículos izquierdos en un modelo de rata de capacidad intrínseca de carrera aeróbica". Physiological Genomics . 23 (1): 62–71 . CiteSeerX 10.1.1.321.9888 . doi : 10.1152/physiolgenomics.00251.2004 . PMID 16033863 .  
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Lecturas adicionales

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  • Xia H, Winokur ST, Kuo WL, Altherr MR, Bredt DS (octubre de 1997). "Proteína LIM asociada a la actinina: identificación de una interacción de dominio entre PDZ y motivos de repetición similares a la espectrina" . The Journal of Cell Biology . 139 (2): 507–15 . doi : 10.1083/jcb.139.2.507 . PMC 2139795. PMID 9334352 .  
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  • Klaavuniemi T, Kelloniemi A, Ylänne J (junio de 2004). "El motivo similar a ZASP en la proteína LIM asociada a la actinina es necesario para la interacción con la varilla de alfa-actinina y para la localización en la línea Z muscular" . The Journal of Biological Chemistry . 279 (25): 26402–10 . doi : 10.1074/jbc.M401871200 . PMID 15084604 . 

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  • Arola AM, Sanchez X, Murphy RT, Hasle E, Li H, Elliott PM, McKenna WJ, Towbin JA, Bowles NE (abril de 2007). "Las mutaciones en PDLIM3 y MYOZ1 que codifican proteínas de la línea Z de los miocitos se encuentran con poca frecuencia en la miocardiopatía dilatada idiopática". Molecular Genetics and Metabolism . 90 (4): 435–40 . doi : 10.1016/j.ymgme.2006.12.008 . PMID 17254821 . 
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