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PNKP

La polinucleótido fosfatasa/quinasa bifuncional es una enzima que en humanos está codificada por el gen PNKP . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Un estudio estructural detallado de la proteína ...

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La polinucleótido fosfatasa/quinasa bifuncional es una enzima que en humanos está codificada por el gen PNKP . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Un estudio estructural detallado de la proteína de ratón cristalizada examinó tanto las actividades de 5´-polinucleótido quinasa como de 3'-polinucleótido fosfatasa . [ 8 ] Las características adicionales de la secuencia peptídica incluyen un dominio de asociación de horquilla (FHA), un sitio de unión de ATP y secuencias de localización nuclear y mitocondrial.

Interacciones

Se ha demostrado que PNKP interactúa con la ADN polimerasa beta [ 9 ] y XRCC1 . [ 9 ] [ 10 ]

Función en las enfermedades neurológicas

Se observó que el gen humano que codifica PNKP estaba mutado en pacientes [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] con microcefalia , convulsiones y defectos en la reparación del ADN . Un tipo de ataxia recesiva también se asocia con mutaciones de PNKP. [ 15 ] También existen variantes patológicas de PNKP recientemente caracterizadas. [ 16 ] Se han utilizado organismos modelo como ratones y Drosophila para generar más información. [ 17 ] [ 18 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000039650 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000002963 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Jilani A, Ramotar D, Slack C, Ong C, Yang XM, Scherer SW, et al. (septiembre de 1999). "Clonación molecular del gen humano PNKP, que codifica una quinasa de polinucleótidos 3'-fosfatasa y evidencia de su función en la reparación de roturas de la cadena de ADN causadas por daño oxidativo" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (34): 24176– 24186. doi : 10.1074/jbc.274.34.24176 . PMID 10446192 .  
  6. ^ Karimi-Busheri F, Daly G, Robins P, Canas B, Pappin DJ, Sgouros J, et al. (Septiembre de 1999). "Caracterización molecular de una ADN quinasa humana" . La Revista de Química Biológica . 274 (34): 24187– 24194. doi : 10.1074/jbc.274.34.24187 . PMID 10446193 .  
  7. ↑ "Gen Entrez: PNKP polinucleótido quinasa 3'-fosfatasa" .
  8. ↑ Garces F, Pearl LH, Oliver AW (noviembre de 2011). "La base estructural para el reconocimiento del sustrato por la quinasa de polinucleótidos 3' fosfatasa de mamíferos" . Molecular Cell . 44 (3): 385– 396. doi : 10.1016/j.molcel.2011.08.036 . PMC 4820033. PMID 22055185 .  
  9. 1 2 Whitehouse CJ, Taylor RM, Thistlethwaite A, Zhang H, Karimi-Busheri F, Lasko DD, et al. (enero de 2001). "XRCC1 estimula la actividad de la polinucleótido quinasa humana en los extremos dañados del ADN y acelera la reparación de roturas de cadena simple del ADN" . Cell . 104 (1): 107– 117. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00195-7 . PMID 11163244. S2CID 1487128 .   
  10. ↑ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, et al. (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humanas mediante espectrometría de masas" . Molecular Systems Biology . 3 (1) 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .   
  11. ↑ Dumitrache LC, McKinnon PJ (enero de 2017). "Mutaciones de la polinucleótido quinasa-fosfatasa (PNKP) y enfermedad neurológica" . Mechanisms of Ageing and Development . 161 (Pt A): 121–129 . doi : 10.1016/j.mad.2016.04.009 . PMC 5161711. PMID 27125728 .  
  12. ^ Shen J, Gilmore EC, Marshall CA, Haddadin M, Reynolds JJ, Eyaid W, et al. (Marzo de 2010). "Las mutaciones en PNKP provocan microcefalia, convulsiones y defectos en la reparación del ADN" . Genética de la Naturaleza . 42 (3): 245– 249. doi : 10.1038/ng.526 . PMC 2835984 . PMID 20118933 .   
  13. ↑ Issa L, Mueller K, Seufert K, Kraemer N, Rosenkotter H, Ninnemann O, et al. (abril de 2013). " Características clínicas y celulares en pacientes con microcefalia autosómica recesiva primaria y una nueva mutación de CDK5RAP2" . Orphanet Journal of Rare Diseases . 8 (1) 59. doi : 10.1186/1750-1172-8-59 . PMC 3639195. PMID 23587236 .   
  14. ↑ Kalasova I, Hanzlikova H, Gupta N, Li Y, Altmüller J, Reynolds JJ, et al. (abril de 2019). "Nuevas mutaciones de PNKP que causan reparación defectuosa de roturas de la cadena de ADN e hiperactividad de PARP1 en MCSZ" . Neurology. Genetics . 5 (2) e320. doi : 10.1212/NXG.0000000000000320 . PMC 6454307. PMID 31041400 .   
  15. ↑ Bras J, Alonso I, Barbot C, Costa MM, Darwent L, Orme T, et al. (marzo de 2015). " Las mutaciones en PNKP causan ataxia recesiva con apraxia oculomotora tipo 4" . American Journal of Human Genetics . 96 (3): 474– 479. doi : 10.1016/j.ajhg.2015.01.005 . PMC 4375449. PMID 25728773 .   
  16. ^ Gatti M, Magri S, Nanetti L, Sarto E, Di Bella D, Salsano E, et al. (noviembre de 2019). "De la microcefalia congénita a la ataxia cerebelosa de aparición en la edad adulta: fenotipos distintos y superpuestos en pacientes con mutaciones del gen PNKP". Revista Estadounidense de Genética Médica. Parte A. 179 (11): 2277– 2283. doi : 10.1002/ajmg.a.61339 . PMID 31436889 . S2CID 201275630 .   
  17. ↑ Shimada M, Dumitrache LC, Russell HR, McKinnon PJ (octubre de 2015). "La polinucleótido quinasa-fosfatasa permite la neurogénesis a través de múltiples vías de reparación del ADN para mantener la estabilidad del genoma" . The EMBO Journal . 34 (19): 2465–2480 . doi : 10.15252/embj.201591363 . PMC 4601665. PMID 26290337 .  
  18. ↑ Chakraborty A, Tapryal N, Venkova T, Mitra J, Vasquez V, Sarker AH, et al. (abril de 2020). "La deficiencia en la reparación de genes transcritos mediada por la unión de extremos no homólogos clásicos está relacionada con la patogénesis de la SCA3" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 117 (14): 8154– 8165. Bibcode : 2020PNAS..117.8154C . doi : 10.1073/pnas.1917280117 . PMC 7148577. PMID 32205441 .   

Lecturas adicionales

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  • Mani RS, Karimi-Busheri F, Fanta M, Cass CE, Weinfeld M (2003). "Estudios espectroscópicos de la unión de ADN y ATP a la polinucleótido quinasa humana: evidencia de un complejo ternario". Biochemistry . 42 (41): 12077– 12084. doi : 10.1021/bi030127b . PMID 14556639 . 
  • Loizou JI, El-Khamisy SF, Zlatanou A, Moore DJ, Chan DW, Qin J, et  al. (2004). "La proteína quinasa CK2 facilita la reparación de roturas de cadena simple del ADN cromosómico" . Cell . 117 (1): 17– 28. doi : 10.1016/S0092-8674(04)00206-5 . PMID 15066279. S2CID 8592154 .  
  • Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, et  al. (2004). " Mapeo proteómico funcional de una vía de señalización humana" . Genome Research . 14 (7): 1324– 1332. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148. PMID 15231748 .  
  • Wiederhold L, Leppard JB, Kedar P, Karimi-Busheri F, Rasouli-Nia A, Weinfeld M, et  al. (2004). "Reparación por escisión de bases de ADN independiente de endonucleasa AP en células humanas" . Célula molecular . 15 (2): 209– 220. doi : 10.1016/j.molcel.2004.06.003 . PMID 15260972 . 
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  • Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, et  al. (2005). "Dinámica del proteoma nucleolar". Nature . 433 ( 7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413. S2CID 4344740 .  
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, et  al. (2005). "Hacia un mapa a escala del proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Nature . 437 ( 7062): 1173– 1178. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514. S2CID 4427026 .  
  • Audebert M, Salles B, Weinfeld M, Calsou P (2006). "Participación de la polinucleótido quinasa en una vía de reparación de roturas de doble cadena de ADN dependiente de la poli(ADP-ribosa) polimerasa-1". Journal of Molecular Biology . 356 (2): 257– 265. doi : 10.1016/j.jmb.2005.11.028 . PMID 16364363 . 
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, et  al. (2006). " Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Cell . 127 (3): 635– 648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .  
  • Karimi-Busheri F, Rasouli-Nia A, Allalunis-Turner J, Weinfeld M (2007). "La polinucleótido quinasa humana participa en la reparación de roturas de doble cadena de ADN mediante la unión de extremos no homólogos, pero no mediante recombinación homóloga" . Cancer Research . 67 (14): 6619– 6625. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-07-0480 . PMID 17638872 . 
  • Mani RS, Fanta M, Karimi-Busheri F, Silver E, Virgen CA, Caldecott KW, et  al. (2007). "XRCC1 estimula la polinucleótido quinasa al mejorar su discriminación de daños y su desplazamiento de los intermediarios de reparación del ADN" . The Journal of Biological Chemistry . 282 (38): 28004– 28013. doi : 10.1074/jbc.M704867200 . PMID 17650498 . 
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