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Articulo de referencia

POLDIP2

La proteína 2 que interactúa con la polimerasa delta, también conocida como proteína de 38 kDa que interactúa con la polimerasa delta (PDIP38), está codificada por el gen POLDIP...

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La proteína 2 que interactúa con la polimerasa delta, también conocida como proteína de 38 kDa que interactúa con la polimerasa delta (PDIP38), está codificada por el gen POLDIP2 en humanos. [ 5 ] [ 6 ]

Este gen codifica una proteína que interactúa con la subunidad delta p50 de la ADN polimerasa. La proteína codificada también interactúa con el antígeno nuclear de células proliferantes. Algunos transcritos de este gen se superponen en una orientación cola con cola con el gen de la proteína 1 inducida por el factor de necrosis tumoral alfa (TNFAIP1). [ 6 ] POLDIP2 / PDIP38 es una proteína multifuncional que se ha identificado tanto en el núcleo [ 7 ] como en la mitocondria [ 8 ] [ 9 ].

Interacciones

En el núcleo, se ha demostrado que POLDIP2 interactúa con PCNA , [ 5 ] mientras que en la mitocondria se ha demostrado que POLDIP2 interactúa con proteínas que constituyen el nucleoide del ADN mitocondrial [ 10 ] y la proteasa AAA + CLPXP [ 9 ] [ 11 ] donde modula tanto la especificidad como la estabilidad de esta máquina proteolítica.

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000004142 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000001100 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 Liu L, Rodriguez-Belmonte EM, Mazloum N, Xie B, Lee MY (marzo de 2003). "Identificación de una nueva proteína, PDIP38, que interactúa con la subunidad p50 de la ADN polimerasa delta y el antígeno nuclear de células proliferantes" . The Journal of Biological Chemistry . 278 (12): 10041– 7. doi : 10.1074/jbc.M208694200 . PMID 12522211 . 
  6. 1 2 "Entrez Gene: POLDIP2 polimerasa (dirigida por ADN), proteína 2 de interacción con delta" .
  7. ↑ Wong A, Zhang S, Mordue D, Wu JM, Zhang Z, Darzynkiewicz Z, et al. (octubre de 2013). "PDIP38 se transloca a los espliceosomas/manchas nucleares en respuesta al daño del ADN inducido por UV y es necesario para el empalme alternativo de MDM2 inducido por UV" . Cell Cycle . 12 (19): 3184–93 . doi : 10.4161/cc.26221 . PMC 3865014. PMID 23989611 .   
  8. ↑ Xie B, Li H, Wang Q, Xie S, Rahmeh A, Dai W, Lee MY (junio de 2005). "Caracterización adicional de la proteína 38 que interactúa con la ADN polimerasa delta humana" . The Journal of Biological Chemistry . 280 (23): 22375–84 . doi : 10.1074/jbc.M414597200 . PMID 15811854 . 
  9. 1 2 Strack PR, Brodie EJ, Zhan H, Schuenemann VJ, Valente LJ, Saiyed T, et al. (noviembre de 2020). " La proteína 38 que interactúa con la polimerasa delta (PDIP38) modula la estabilidad y la actividad de la proteasa mitocondrial AAA+ CLPXP" . Communications Biology . 3 (1): 646. doi : 10.1038/s42003-020-01358-6 . PMC 7647994. PMID 33159171 .   
  10. ↑ Cheng X, Kanki T, Fukuoh A, Ohgaki K, Takeya R, Aoki Y, et al. (diciembre de 2005). "PDIP38 se asocia con proteínas que constituyen el nucleoide del ADN mitocondrial" . Journal of Biochemistry . 138 (6): 673–8 . doi : 10.1093/jb/mvi169 . PMID 16428295 .  
  11. ↑ Paredes F, Sheldon K, Lassègue B, Williams HC, Faidley EA, Benavides GA, et al. (febrero de 2018). "Poldip2 es una proteína sensible al oxígeno que controla la lipoilación y activación de PDH y αKGDH para apoyar la adaptación metabólica en hipoxia y cáncer" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 115 (8): 1789– 1794. Bibcode : 2018PNAS..115.1789P . doi : 10.1073/pnas.1720693115 . PMC 5828627. PMID 29434038 .   

Lecturas adicionales

  • Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, et  al. (octubre de 2000). "Clonación y análisis funcional de ADNc con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente no definidos expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+" . Genome Research . 10 (10): 1546– 60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934. PMID 11042152 .  
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (noviembre de 2000). "Clonación de ADN mediante recombinación sitio-específica in vitro" . Genome Research . 10 (11): 1788– 95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .  
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (septiembre de 2000). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala" . EMBO Reports . 1 (3): 287– 92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .  
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, et  al. (octubre de 2004). " Del ORFeoma a la biología: una vía de genómica funcional" . Genome Research . 14 (10B): 2136–44 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930. PMID 15489336 .  
  • Xie B, Li H, Wang Q, Xie S, Rahmeh A, Dai W, Lee MY (junio de 2005). "Caracterización adicional de la proteína 38 que interactúa con la ADN polimerasa delta humana" . The Journal of Biological Chemistry . 280 (23): 22375–84 . doi : 10.1074/jbc.M414597200 . PMID 15811854 . 
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, et  al. (septiembre de 2005). "Una red de interacción proteína-proteína humana: un recurso para anotar el proteoma". Cell . 122 ( 6): 957– 68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923 .  
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, et  al. (octubre de 2005). "Hacia un mapa a escala del proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Nature . 437 ( 7062): 1173–8 . Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514. S2CID 4427026 .  
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, et  al. (enero de 2006). " La base de datos LIFEdb en 2006" . Nucleic Acids Research . 34 (número especial sobre bases de datos): D415-8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501. PMID 16381901 .  
  • Klaile E, Müller MM, Kannicht C, Otto W, Singer BB, Reutter W, et  al. (septiembre de 2007). "El receptor de adhesión celular molécula de adhesión celular 1 relacionada con el antígeno carcinoembrionario regula el tráfico nucleocitoplasmático de la proteína 38 que interactúa con la ADN polimerasa delta" . The Journal of Biological Chemistry . 282 (36): 26629–40 . doi : 10.1074/jbc.M701807200 . PMID 17623671 .