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Articulo de referencia

Repetición de pentatricopéptido

La repetición de pentatricopéptido (PPR) es un motivo de secuencia de 35 aminoácidos . Las proteínas que contienen repeticiones de pentatricopéptido son una familia de proteínas...

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La repetición de pentatricopéptido (PPR) es un motivo de secuencia de 35 aminoácidos . Las proteínas que contienen repeticiones de pentatricopéptido son una familia de proteínas comunes en el reino vegetal . Se distinguen por la presencia de motivos PPR degenerados en tándem [ 1 ] y por la relativa ausencia de intrones en los genes que las codifican [ 2 ] .

Se han identificado aproximadamente 450 de estas proteínas en el genoma de Arabidopsis y otras 477 en el genoma del arroz . [ 3 ] A pesar del gran tamaño de la familia de proteínas, los datos genéticos sugieren que hay poca o ninguna redundancia de función entre las proteínas PPR en Arabidopsis . [ 2 ]

Actualmente se debate la función de las proteínas PPR. Se ha demostrado que muchas de ellas en Arabidopsis interactúan (a menudo de forma esencial) con las mitocondrias y otros orgánulos [ 2 ] y que posiblemente participan en la edición de ARN [ 4 ] . Sin embargo, se requieren muchas proteínas trans para que se produzca esta edición y la investigación continúa analizando qué proteínas son necesarias [ 5 ] .

Se ha resuelto la estructura de la PPR. Se pliega en una estructura hélice-giro-hélice similar a las que se encuentran en la repetición de tetratricopéptido . Varias repeticiones de la proteína forman un anillo alrededor de una molécula de ARN monocatenario de una manera sensible a la secuencia que recuerda a los efectores TAL . [ 6 ]

Ejemplos

Los genes humanos que codifican proteínas que contienen esta repetición incluyen:

Referencias

  1. ↑ Mingler MK, Hingst AM, Clement SL, Yu LE, Reifur L, Koslowsky DJ (noviembre de 2006). "Identificación de proteínas con repeticiones de pentatricopéptidos en Trypanosoma brucei". Mol. Biochem. Parasitol . 150 (1): 37– 45. doi : 10.1016/j.molbiopara.2006.06.006 . PMID 16837079 . 
  2. 1 2 3 Lurin C, Andrés C, Aubourg S, Bellaoui M, Bitton F, Bruyère C, Caboche M, Debast C, Gualberto J, Hoffmann B, Lecharny A, Le Ret M, Martin-Magniette ML, Mireau H, Peeters N, Renou JP, Szurek B, Taconnat L, Small I (agosto de 2004). "El análisis de todo el genoma de las proteínas repetidas pentatricopéptidos de Arabidopsis revela su papel esencial en la biogénesis de los orgánulos" . Célula vegetal . 16 (8): 2089– 103. doi : 10.1105/tpc.104.022236 . PMC 519200 . PMID 15269332 .  
  3. ↑ O'Toole N, Hattori M, Andres C, Iida K, Lurin C, Schmitz-Linneweber C, Sugita M, Small I (junio de 2008). "Sobre la expansión de la familia de genes de repetición de pentatricopéptidos en plantas" . Mol. Biol. Evol . 25 (6): 1120–8 . doi : 10.1093/molbev/msn057 . PMID 18343892 . 
  4. ↑ Kotera E, Tasaka M, Shikanai T (enero de 2005). "Una proteína con repeticiones de pentatricopéptidos es esencial para la edición de ARN en cloroplastos". Nature . 433 ( 7023): 326–30 . Bibcode : 2005Natur.433..326K . doi : 10.1038/nature03229 . PMID 15662426. S2CID 4416316 .  
  5. ^ Takenaka M, Verbitskiy D, Zehrmann A, Brennicke A (junio de 2010). "El cribado genético inverso identifica cinco proteínas PPR de clase E implicadas en la edición de ARN en las mitocondrias de Arabidopsis Thaliana" . J Biol Chem . 285 (35): 27122– 27129. doi : 10.1074/jbc.M110.128611 . PMC 2930711 . PMID 20566637 .  
  6. ↑ Yin P, Li Q, Yan C, Liu Y, Liu J, Yu F, et al. (diciembre de 2013). " Base estructural para el reconocimiento modular de ARN monocatenario por proteínas PPR". Nature . 504 (7478): 168– 71. Bibcode : 2013Natur.504..168Y . doi : 10.1038/nature12651 . PMID 24162847. S2CID 4471801 .