CLASIFICAR

PSORT es una herramienta bioinformática utilizada para la predicción de sitios de localización de proteínas en células . ^{[ 1 ] [ 2 ]} Recibe como entrada la información de una secuencia de aminoácidos y su taxón de origen (por ejemplo, bacterias Gram negativas ). Luego analiza la secuencia de entrada aplicando las reglas almacenadas para diversas características de secuencia de señales de clasificación de proteínas conocidas. Finalmente, informa la probabilidad de que la proteína de entrada se localice en cada sitio candidato con información adicional.

Los investigadores que utilizan esta herramienta pueden predecir, con cierto grado de precisión, dónde es más probable que se localice una proteína en la célula. Esto se debe a que la localización de las proteínas se realiza mediante una maquinaria celular que reconoce secuencias de péptidos señal (similares a una dirección postal) y las traslada a la ubicación adecuada. El péptido señal suele eliminarse una vez que la proteína alcanza su destino. PSORT utiliza secuencias de péptidos señal conocidas para analizar y predecir a qué ubicación es más probable que se dirija una secuencia de entrada.

La localización de las proteínas es importante porque respalda la función que se les atribuye. Por ejemplo, se espera que las enzimas catalasa (proteínas que convierten el peróxido en agua y oxígeno) se localicen en un peroxisoma, ya que esta es una zona con alta actividad de peróxido. Mediante el análisis de la secuencia de un péptido señal y la localización visual por expresión de GFP , se obtiene evidencia sólida de esta función.

El programa fue escrito por el Dr. Kenta Nakai del Centro del Genoma Humano del Instituto de Ciencias Médicas de la Universidad de Tokio , Japón, y está disponible de forma gratuita para todos los usuarios.

• Sitio web de PSORT