En biología molecular, el dominio PUA ( dominio de pseudouridina sintasa y transglicosilasa de arqueosina ) es un dominio de unión a ARN ancestral . [ 1 ]
Estructura
El dominio PUA consta de 64-96 aminoácidos que forman un plegamiento alfa/beta compacto. Presenta seis hebras beta y dos hélices alfa que cierran la estructura. [ 2 ]
Función
El dominio PUA se encuentra en diversas familias de proteínas [ 1 ] involucradas en:
- Modificación del ARN: pseudouridina sintasas, arqueosina transglicosilasas, ARN metiltransferasas
- Biogénesis de los ribosomas: ribonucleoproteínas con caja H/ACA , componentes del complejo de la telomerasa.
- Traducción: factores de iniciación eucariotas
- Metabolismo: glutamato quinasas ( biosíntesis de prolina )
Mecanismo de reconocimiento del ARN
El dominio PUA utiliza una distintiva "reborde de doble filo" formada por el bucle alfa1-beta2 y la hebra beta6 para la unión al ARN, mientras que una "hendidura adyacente" alfa1-beta2 se adapta a los extremos sobresalientes del ARN monocatenario. Presenta dos modos de unión principales: la unión lateral reconoce el surco menor de los tallos de ARN bicatenario; y la unión terminal reconoce el extremo inferior/terminal de los tallos de ARN a través del surco mayor . [ 1 ]
Evolución y distribución
Las proteínas con el dominio PUA se encuentran en bacterias , arqueas y eucariotas . Este dominio ha evolucionado como un módulo de interacción de ARN flexible, donde diferentes proteínas utilizan variaciones en la composición de aminoácidos para lograr patrones específicos de reconocimiento de ARN, manteniendo al mismo tiempo la estructura básica. [ 1 ]
Relevancia clínica
Las proteínas del dominio PUA son esenciales para procesos celulares fundamentales. [ 2 ] Algunos ejemplos de enfermedades asociadas son:
- Las mutaciones en la proteína disquerina conducen a la disfunción de los telómeros ( disqueratosis congénita ) [ 3 ].
- MCT1 está implicado en el cáncer a través de su papel en la proliferación celular [ 4 ].
- Las mutaciones de Nsun6 pueden provocar discapacidad intelectual [ 5 ].
Referencias
- ^ Pérez -Arellano I, Gallego J, Cervera J (octubre de 2007 ) . "El dominio PUA: una descripción estructural y funcional". El Diario FEBS . 274 (19): 4972– 4984. doi : 10.1111/j.1742-4658.2007.06031.x . PMID 17803682 .
- ^ Cerrudo CS, Ghiringhelli PD, Gomez DE (enero de 2014). "Universo proteico que contiene un dominio de unión a ARN de PUA". El Diario FEBS . 281 (1): 74– 87. doi : 10.1111/feb.12602 . hdl : 11336/32610 . PMID 24393395 .
- ↑ Garus A, Autexier C (diciembre de 2021). "Disquerina: una pseudouridina sintasa esencial con funciones multifacéticas en la biogénesis de ribosomas, el empalme y el mantenimiento de telómeros" . RNA . 27 ( 12): 1441– 1458. doi : 10.1261/rna.078953.121 . PMC 8594475. PMID 34556550 .
- ↑ Silva A, Cerqueira MC, Rosa B, Sobral C, Pinto-Ribeiro F, Costa MF, et al. (marzo de 2023). " Valor pronóstico de la sobreexpresión del transportador de monocarboxilato 1 en el cáncer: una revisión sistemática" . International Journal of Molecular Sciences . 24 (6): 5141. doi : 10.3390/ijms24065141 . PMC 10049181. PMID 36982217 .
- ↑ Mattioli F, Worpenberg L, Li CT, Ibrahim N, Naz S, Sharif S, et al. (septiembre de 2023). "Las variantes bialélicas en NSUN6 causan un trastorno del neurodesarrollo autosómico recesivo". Genetics in Medicine . 25 (9) 100900. doi : 10.1016/j.gim.2023.100900 . hdl : 10261/395062 . PMID 37226891 .
- dominios de proteínas
- Pliegues de proteínas
- superfamilias de proteínas