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Articulo de referencia

PUF60

El factor de empalme de unión a poli(U) PUF60 es una proteína que en humanos está codificada por el gen PUF60 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] La proteína codificada por este gen es un...

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El factor de empalme de unión a poli(U) PUF60 es una proteína que en humanos está codificada por el gen PUF60 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]

La proteína codificada por este gen es una proteína de unión a Ro RNP. Interactúa con Ro RNP y se cree que esta interacción representa una ganancia de función para Ro RNP. Esta proteína también forma un complejo ternario con el elemento corriente arriba lejano (FUSE) y la proteína de unión a FUSE. Puede reprimir un gen reportero c-myc a través de FUSE. También se sabe que actúa sobre el factor de transcripción IIH e inhibe la transcripción activada. Este gen está implicado en el trastorno de xeroderma pigmentoso . Existen dos variantes de transcripción de empalme alternativo de este gen que codifican diferentes isoformas. Parece haber evidencia de múltiples sitios de poliadenilación para este gen. [ 8 ]

Interacciones

Se ha demostrado que PUF60 interactúa con U2AF2 . [ 9 ] [ 10 ]

Referencias

  1. 1 2 3 ENSG00000274081 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000179950, ENSG00000274081 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000002524 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Bouffard P, Barbar E, Brière F, Boire G (enero de 2000). "Clonación de interacción y caracterización de RoBPI, una nueva proteína que se une a las ribonucleoproteínas Ro humanas" . RNA . 6 ( 1): 66–78 . doi : 10.1017/S1355838200990277 . PMC 1369894. PMID 10668799 .  
  6. ↑ Liu J, He L, Collins I, Ge H, Libutti D, Li J, Egly JM, Levens D (febrero de 2000). "El represor que interactúa con FBP se dirige a TFIIH para inhibir la transcripción activada" . Molecular Cell . 5 (2): 331–41 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)80428-1 . PMID 10882074 . 
  7. ↑ Hastings ML, Allemand E, Duelli DM, Myers MP, Krainer AR (junio de 2007). Valcarcel J (ed.). "Control del empalme del pre-ARNm por los factores de empalme generales PUF60 y U2AF(65)" . PLOS ONE . 2 (6) e538. Bibcode : 2007PLoSO...2..538H . doi : 10.1371/journal.pone.0000538 . PMC 1888729. PMID 17579712 .  Icono de acceso abierto
  8. 1 2 "Gen Entrez: represor que interactúa con la proteína de unión a la fusión SIAHBP1" .
  9. ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (octubre de 2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .  
  10. ↑ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humanas mediante espectrometría de masas" . Biología de sistemas moleculares . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .  

Lecturas adicionales

  • Page-McCaw PS, Amonlirdviman K, Sharp PA (diciembre de 1999). "PUF60: una nueva actividad de empalme relacionada con U2AF65" . RNA . 5 ( 12): 1548–60 . doi : 10.1017/S1355838299991938 . PMC 1369877. PMID 10606266 .  
  • Poleev A, Hartmann A, Stamm S (julio de 2000). "Un factor trans-activo, aislado mediante el sistema de tres híbridos, que influye en el empalme alternativo del minigen de la proteína precursora amiloide". European Journal of Biochemistry . 267 (13): 4002–10 . doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01431.x . PMID 10866799 . 
  • Liu J, Akoulitchev S, Weber A, Ge H, Chuikov S, Libutti D, Wang XW, Conaway JW, Harris CC, Conaway RC, Reinberg D, Levens D (febrero de 2001). "Interacción defectuosa de activadores y represores con TFIH en xeroderma pigmentoso" . Cell . 104 ( 3): 353– 63. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00223-9 . PMID 11239393. S2CID 16066683 .  
  • Sandrock B, Egly JM (septiembre de 2001). "Un sistema de cuatro híbridos de levadura identifica a la quinasa activadora de Cdk como regulador de la helicasa XPD, una subunidad del factor de transcripción IIH" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (38): 35328–33 . doi : 10.1074/jbc.M105570200 . PMID 11445587 . 
  • Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (agosto de 2004). "Análisis proteómico, funcional y basado en dominios de proteínas de unión a 14-3-3 in vivo involucradas en la regulación del citoesqueleto y la organización celular" . Current Biology . 14 (16): 1436– 50. Bibcode : 2004CBio...14.1436J . doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325 .  
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (Septiembre de 2005). "Una red de interacción proteína-proteína humana: un recurso para anotar el proteoma". Celúla . 122 (6): 957– 68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .  
  • Liu J, Kouzine F, Nie Z, Chung HJ, Elisha-Feil Z, Weber A, Zhao K, Levens D (mayo de 2006). "El sistema FUSE/FBP/FIR/TFIIH es una máquina molecular que programa un pulso de expresión de c-myc" . The EMBO Journal . 25 (10): 2119–30 . doi : 10.1038/sj.emboj.7601101 . PMC 1462968. PMID 16628215 .  
  • Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (mayo de 2006). "Una red de interacción proteína-proteína para las ataxias hereditarias humanas y los trastornos de la degeneración de las células de Purkinje" . Cell . 125 ( 4): 801–14 . doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685 .  
  • Kew C, Huang W, Fischer J, Ganesan R, Robinson N, Antebi A (junio de 2020). "Regulación de la inmunidad conservada evolutivamente por el factor de empalme RNP-6/PUF60" . eLife . 9 e57591 . doi : 10.7554/eLife.57591 . PMC 7332298. PMID 32538777 .  
  • PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para el factor de empalme de unión a poli(U) humano PUF60.