Hispanopedia Wiki37°28′43″N 122°09′03″O / 37.4787, -122.1507 (sede)
Pacific Biosciences of California, Inc. (también conocida como PacBio) es una empresa biotecnológica estadounidense fundada en 2004 que desarrolla y fabrica sistemas para la secuenciación de genes y algunas observaciones biológicas novedosas en tiempo real. [2] [3] [ verificación fallida ] PacBio tiene dos plataformas de secuenciación principales: la secuenciación en tiempo real de una sola molécula (SMRT), basada en las propiedades de las guías de onda de modo cero y la secuenciación por química de unión (SBB), que utiliza nucleótidos nativos e incorporación sin cicatrices para la unión y extensión del ADN . [4] [5]
Historia
La empresa se fundó a partir de una investigación realizada en la Universidad de Cornell que combinaba el procesamiento de semiconductores y la fotónica con la investigación en biotecnología. [2] Tres estudiantes de posgrado del laboratorio de los profesores Watt W. Webb —Jonas Korlach— y Harold Craighead —Steve Turner y Mathieu Foquet— se convirtieron en los primeros empleados.
Comenzó bajo el nombre de Nanofluidics, Inc. La compañía recaudó casi US$ 400.000.000 en seis rondas de financiación principalmente de capital de riesgo , lo que la convirtió en una de las empresas emergentes más capitalizadas en 2010 antes de su oferta pública en octubre de ese año. [6] Los inversores clave incluyeron a Mohr Davidow Ventures, Kleiner, Perkins, Caufield & Byers , Alloy Ventures y Wellcome Trust . [2]
El primer producto comercial de la empresa, el PacBio RS, se vendió a un grupo limitado de clientes en 2010 y se lanzó comercialmente a principios de 2011. [7] [8] Una versión posterior del secuenciador llamada PacBio RS II se lanzó en abril de 2013. [9]
Liderazgo
En 2004, Hugh Martin, empresario residente de Kleiner Perkins, se convirtió en director ejecutivo. El 6 de enero de 2012, el miembro de la junta directiva Michael Hunkapiller, PhD, asumió el cargo de director ejecutivo. [10] Hunkapiller se jubiló en septiembre de 2020 y fue reemplazado por el presidente de la junta directiva, Christian Henry. [11] Henry fue vicepresidente ejecutivo y director comercial de Illumina antes de unirse a la junta directiva de PacBio en julio de 2018. [12]
Illumina: intento de adquisición
El 1 de noviembre de 2018, Illumina, Inc. acordó comprar PacBio por 1200 millones de dólares en efectivo. Se esperaba que el acuerdo se cerrara en el cuarto trimestre de 2019. [13] En diciembre de 2019, la Comisión Federal de Comercio presentó una demanda para bloquear la adquisición. [14] [15] El acuerdo se abandonó con un anuncio el 2 de enero de 2020. Illumina acordó además pagar a Pacific Biosciences una tarifa de rescisión de 98 millones de dólares estadounidenses más los pagos de extensión del acuerdo previamente acordados de 22 millones de dólares estadounidenses en febrero y 6 millones de dólares estadounidenses en marzo de 2020. [16]
Tecnología de secuenciación
Instrumentos de secuenciación
El primer instrumento científico de la compañía, llamado PacBio RS, fue lanzado a un conjunto limitado de clientes a fines de 2010, y su lanzamiento comercial completo a principios de 2011. [17] [8] El proveedor de secuenciación GATC Biotech fue seleccionado por Pacific Biosciences como su primer proveedor de servicios europeo a fines de 2010. [18] Se lanzó una nueva versión del secuenciador en abril de 2013, que produjo lecturas de secuencias más largas y un mayor rendimiento que el instrumento RS original. [9] El instrumento RS será oficialmente compatible hasta fines de 2021. [19] En septiembre de 2015, la compañía lanzó un nuevo instrumento de secuenciación, el Sequel System, con mayor capacidad de secuenciación en un tamaño más pequeño y un precio más bajo en comparación con el PacBio RS II. [20] Posteriormente, en octubre de 2022, PacBio lanzó un nuevo sistema de secuenciación, que puede secuenciar 1.300 genomas humanos por año en comparación con los 86 por año de las máquinas de secuenciación PacBio anteriores. [21]
Reactivos y células SMRT
Para utilizar cualquiera de los dos instrumentos, los clientes también deben adquirir paquetes de reactivos para la preparación y secuenciación del ADN y pequeños consumibles llamados "células SMRT". Las celdas para las primeras formas del secuenciador tienen un tamaño ligeramente inferior a un centímetro cuadrado y contienen decenas de miles de guías de onda de modo cero , [4] mientras que los sistemas más nuevos tienen una mayor densidad de celdas y contienen 25 millones de guías de onda de modo cero (ZMWG), lo que permite una secuenciación de ADN más rápida. [22] [21] [23]
Software y aplicaciones
Su producto de bioinformática de análisis secundario para el RS, llamado “SMRT Analysis”, era de código abierto . [24] Para el sistema Sequel, el software de análisis secundario se reorganizó como la aplicación “SMRT Link”. En 2013, la empresa lanzó nuevas herramientas bioinformáticas para el ensamblaje automatizado del genoma (HGAP) y el acabado (Quiver). [25] [26] [27]
Enlaces externos
- Sitio web de la empresa
- Perfil del Wall Street Journal
- Datos comerciales de PacBio:
- Presentaciones ante la SEC
- ¡Yahoo!
Referencias
- ^ "Formulario 8-K de Pacific Biosciences". Comisión de Bolsa y Valores de Estados Unidos . 15 de febrero de 2024.
- ^ abc bloomberg.com https://www.bloomberg.com/businessweek/globalbiz/content/dec2009/gb2009123_706120.htm.
{{cite web}}: Falta o está vacío|title=( ayuda ) [ enlace muerto permanente ] - ^ Brakmann, Susanne (5 de abril de 2010). "Un ribosoma en acción". Nature . 464 (7291): 987–988. doi : 10.1038/464987a . PMID 20393548. S2CID 1742990.
- ^ ab Rhoads, Anthony; Au, Kin Fai (1 de octubre de 2015). "Secuenciación PacBio y sus aplicaciones". Genómica, proteómica y bioinformática . 13 (5): 278–289. doi : 10.1016/j.gpb.2015.08.002 . ISSN 1672-0229. PMC 4678779 . PMID 26542840.
- ^ Eisenstein, Michael (1 de enero de 2023). "Illumina enfrenta rivales de lectura corta". Nature Biotechnology . 41 (1): 3–5. doi :10.1038/s41587-022-01632-4. ISSN 1546-1696. PMID 36653497. S2CID 255971472 . Consultado el 8 de marzo de 2023 .
- ^ Austin, Colleen DeBaise y Scott (9 de marzo de 2010). "Evaluación de empresas jóvenes prometedoras" . Wall Street Journal – vía www.wsj.com.
- ^ "PacBio revela las especificaciones del sistema beta para RS; dice que el lanzamiento comercial está previsto para la primera mitad de 2011" . GenomeWeb . 7 de diciembre de 2010.
- ^ ab "PacBio envía los dos primeros sistemas comerciales; la cartera de pedidos crece hasta 44" . GenomeWeb . 3 de mayo de 2011.
- ^ ab "Nuevos productos: RS II de PacBio; gemelos" . GenomeWeb . 16 de abril de 2013.
- ^ "Michael Hunkapiller entra y Hugh Martin sale como director ejecutivo de Pacific Biosciences". 6 de enero de 2012. Consultado el 10 de agosto de 2020 .
- ^ "Pacific Biosciences nombra a Christian Henry como presidente y director ejecutivo". 7 de agosto de 2020. Consultado el 10 de agosto de 2020 .
- ^ "Personas en las noticias: Christian Henry, Mike Hunkapiller, Karen Tay Koh, Michael Vounatsos y más". 6 de marzo de 2020. Consultado el 10 de agosto de 2020 .
- ^ Farr, Christina (1 de noviembre de 2018). "El gigante de la secuenciación de ADN Illumina acaba de comprar a su rival Pac Bio por 1200 millones de dólares. He aquí el motivo". CNBC. Archivado desde el original el 14 de julio de 2019.
- ^ Matthew, Herper (17 de diciembre de 2019). "La FTC toma medidas para bloquear la adquisición de PacBio por parte del secuenciador de ADN Illumina". STAT News . Consultado el 31 de marzo de 2021 .
- ^ "FTC impugna la propuesta de adquisición de PacBio por parte de Illumina". Comisión Federal de Comercio . 17 de diciembre de 2019 . Consultado el 31 de marzo de 2021 .
- ^ "Illumina abandona acuerdo de 1.200 millones de dólares para comprar su rival Pacific Biosciences". CNBC. 2 de enero de 2020. Archivado desde el original el 3 de enero de 2020. Consultado el 3 de enero de 2020 .
- ^ "PacBio anuncia los primeros 10 clientes para el secuenciador de moléculas individuales de 695.000 dólares; los primeros envíos están previstos para el segundo trimestre" . GenomeWeb . 23 de febrero de 2010.
- ^ "GATC Biotech será el primer proveedor de servicios europeo para PacBio RS" . GenomeWeb . 21 de septiembre de 2010.
- ^ "PacBio planea actualizaciones para la secuela y dejará de producir RSII en 2021" . GenomeWeb . 3 de agosto de 2018.
- ^ http://www.pacb.com/blog/introducing-the-sequel-system-the-scalable-platform-for-smrt-sequencing/ [ fuente autopublicada ]
- ^ ab Hale, Conor. "PacBio presenta su primer secuenciador de ADN de lectura corta más una actualización del sistema de lectura larga". Fierce Biotech . Consultado el 7 de marzo de 2023 .
- ^ Levene, MJ; Korlach, J.; Turner, SW; Foquet, M.; Craighead, HG; Webb, WW (31 de enero de 2003). "Guías de onda de modo cero para análisis de moléculas individuales en altas concentraciones". Science . 299 (5607): 682–686. Bibcode :2003Sci...299..682L. doi :10.1126/science.1079700. ISSN 0036-8075. PMID 12560545. S2CID 6060239.
- ^ LeMieux, Julianna (1 de diciembre de 2022). "PacBio busca dejar atrás a la competencia en el abarrotado espacio de la secuenciación". GEN Biotechnology . 1 (6): 476–478. doi :10.1089/genbio.2022.29066.jle. ISSN 2768-1572. S2CID 255024364 . Consultado el 8 de marzo de 2023 .
- ^ Pacific Biosciences (23 de febrero de 2015) "Análisis" [ fuente autopublicada ]
- ^ "Nuevos productos: Análisis SMRT 1.4 de PacBio" . GenomeWeb . 29 de enero de 2013.
- ^ "Terminando genomas con HGAP". 6 de mayo de 2013.
- ^ Chin, Chen-Shan; Alexander, David H.; Marks, Patrick; Klammer, Aaron A.; Drake, James; Heiner, Cheryl; Clum, Alicia; Copeland, Alex; Huddleston, John; Eichler, Evan E.; Turner, Stephen W.; Korlach, Jonas (5 de junio de 2013). "Ensamblajes de genomas microbianos terminados y no híbridos a partir de datos de secuenciación SMRT de lectura larga" . Nature Methods . 10 (6): 563–569. doi :10.1038/nmeth.2474. PMID 23644548. S2CID 205421576.
