Paleovirología

La paleovirología es el estudio de los virus que existieron en el pasado pero que ahora están extintos. En general, los virus no pueden dejar fósiles físicos; ^{[ 1 ]} por lo tanto, se utiliza evidencia indirecta para reconstruir el pasado. Por ejemplo, los virus pueden causar la evolución de sus huéspedes, y las huellas de esa evolución pueden encontrarse e interpretarse en la actualidad. ^{[ 2 ]} Además, algunos fragmentos genéticos virales que se endogenizaron en células de la línea germinal de un organismo antiguo se han transmitido hasta nuestros días como fósiles virales , ^{[ 2 ]} o elementos virales endógenos (EVE). ^{[ 3 ]} Los EVE que se originan de la integración de retrovirus se conocen como retrovirus endógenos , o ERV, ^{[ 4 ]} y la mayoría de los fósiles virales son ERV. Pueden conservar código genético de hace millones de años, de ahí la terminología de "fósil", aunque nadie ha detectado un virus en fósiles minerales . ^{[ 2 ]} Los fósiles virales más sorprendentes se originan a partir de virus de ADN y ARN no retrovirales .

Aunque no existe un sistema de clasificación formal para los EVE, se categorizan según la taxonomía de su origen viral. De hecho, todos los tipos de genoma viral y estrategias de replicación conocidos, según la clasificación de Baltimore , se han encontrado en el registro fósil genómico. ^{[ 5 ] [ 6 ]} Se han designado acrónimos para describir diferentes tipos de fósiles virales.

• EVE: Elemento viral endógeno
• ERV: Retrovirus endógeno
• HERV: Retrovirus endógeno humano
• NIRV: Los fósiles virales originados a partir de virus de ARN no retrovirales se han denominado virus de ARN integrados no retrovirales o NIRV. ^{[ 7 ] [ 8 ]} A diferencia de otros tipos de fósiles virales, la formación de NIRV requiere la utilización de la maquinaria de integración codificada por el genoma del huésped o por un retrovirus coinfectante. ^{[ 9 ]}

Otros fósiles virales se originan a partir de virus de ADN como los hepadnavirus (un grupo que incluye la hepatitis B ). ^{[ 10 ]}

Se han reportado intentos exitosos de "resucitar" virus extintos a partir de fósiles de ADN. ^{[ 11 ]} Además, Pithovirus sibericum fue revivido a partir de un núcleo de hielo de 30 000 años de antigüedad extraído del permafrost en Siberia , Rusia. ^{[ 12 ] [ 13 ]}

• ADN antiguo
• Retrovirus endógeno
• Proyecto Genoma Humano
• mutagénesis por inserción
• Virus iridiscente de invertebrados 31
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