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Articulo de referencia

Base de datos de fagos

Placa que muestra una capa bacteriana con zonas despejadas producidas por el fago Artharobacter GantcherGoblin. La base de datos de actinobacteriófagos , más conocida como Phage...

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Placa que muestra una capa bacteriana con zonas despejadas producidas por el fago Artharobacter GantcherGoblin.

La base de datos de actinobacteriófagos , más conocida como PhagesDB , es un sitio web de bioinformática que recopila y comparte información relacionada con el descubrimiento, la caracterización y la genómica de los virus que suelen infectar a las actinobacterias . [ 1 ] A principios de 2026, la base de datos contenía información sobre más de 30 000 bacteriófagos (fagos), así como más de 5 000 fagos completamente secuenciados. [ 2 ]

Diseño y características

PhagesDB tiene entradas individuales para cada virus diferente en la base de datos, junto con una página separada de GeneMark, [ 3 ] así como información de aminoácidos sobre los genomas de fagos . [ 4 ] [ 5 ] La tabla a continuación indica los diferentes tipos (por género de huésped bacteriano) y números de fagos secuenciados: [ 2 ]

Acceso y derechos sobre los datos

La información publicada en esta base de datos puede ser consultada libremente por cualquier persona, y se encuentra disponible una interfaz de programación de aplicaciones (API). [ 6 ] PhagesDB conserva algunos datos no publicados, incluidas secuencias genómicas realizadas recientemente. [ 7 ]

Véase también

Referencias

  1. ↑ Russell DA, Hatfull GF (1 de marzo de 2017). "PhagesDB: la base de datos de actinobacteriófagos" . Bioinformatics . 33 ( 5): 784–786 . doi : 10.1093/bioinformatics/btw711 . PMC 5860397. PMID 28365761 .  
  2. 1 2 "Página principal de la base de datos de actinobacteriófagos" . Consultado el 6 de enero de 2026 .
  3. ↑ Russell, Daniel A.; Hatfull, Graham F. (2017-03-01). "PhagesDB: la base de datos de actinobacteriófagos" . Bioinformatics . 33 ( 5): 784– 786. doi : 10.1093/bioinformatics/btw711 . ISSN 1367-4803 . PMC 5860397. PMID 28365761 .   
  4. ↑ "Phamerator" . phamerator.org . Consultado el 18 de abril de 2018 .
  5. ↑ Cresawn, SG (2011). "Phamerator: una herramienta bioinformática para la genómica comparativa de bacteriófagos" . BMC Bioinform . 12 395. doi : 10.1186/1471-2105-12-395 . PMC 3233612. PMID 21991981 .  
  6. ↑ "Interfaz de usuario Swagger" . phagesdb.org . Consultado el 16 de abril de 2018 .
  7. ↑ "Base de datos de actinobacteriófagos | Condiciones de uso" . phagesdb.org . Consultado el 16 de abril de 2018 .
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