Phikzvirus

Phikzvirus (sinónimo: virus similares a PhiKZ , Phikzlikevirus antes de 2015) es un género de virus de la clase Caudoviricetes , de la familia Chimalliviridae . Las bacterias son sus huéspedes naturales. Existen tres especies en este género. ^{[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]}

Los fagos de este género se consideran fagos grandes o "gigantes" debido a que el tamaño de su genoma supera los 200 kb. Se sabe que tres fagos de este género (φKZ, φPA3 y 201φ2-1) ensamblan una estructura de "núcleo fágico" similar en función al núcleo celular eucariota , que contiene ADN, así como la maquinaria de replicación y transcripción. El ADN en replicación está rodeado por una red proteica bidimensional que, hasta el momento, se sabe que está compuesta únicamente por la proteína PhuN (Phage Nuclear Enclosure). Estos fagos también establecen un huso bipolar mediante una proteína PhuZ similar a la tubulina , que centra el núcleo fágico. La proteína ChmA (Phage Nuclear Enclosure) recibió el nombre de quimalina (ChmA) en honor a los quimalíes, ya que protege el ADN del fago de las defensas del huésped, como las enzimas de restricción y los sistemas CRISPR -Cas. ^{[ 5 ]}

Las siguientes tres especies se asignan al género: ^{[ 3 ]}

• Virus Pseudomonas PA7
• Virus Pseudomonas phiKZ
• Virus Pseudomonas SL2

Los phikzvirus no tienen envoltura , con cabeza y cola. La cabeza tiene simetría icosaédrica (T=27), con un diámetro relativamente grande de unos 140  nm. La cola mide alrededor de 160  nm de largo y 35  nm de ancho. ^{[ 2 ]}

Los genomas son circulares, de aproximadamente 280 kb de longitud. ^{[ 2 ]} Dos de las tres especies han sido secuenciadas completamente y están disponibles en ICTV. Su longitud oscila entre 211 k y 280 k nucleótidos, con entre 201 y 306 proteínas. Los genomas completos, junto con otro genoma similar pero no clasificado, están disponibles aquí . ^{[ 4 ]}

La replicación viral es citoplasmática. El virus se adhiere a la célula huésped mediante sus fibras terminales y expulsa el ADN viral al citoplasma del huésped mediante la contracción de su vaina de la cola. La transcripción se realiza mediante una plantilla de ADN. Una vez replicados los genes virales, se ensambla y empaqueta la procápside. Posteriormente, se ensambla la cola y los viriones maduros se liberan por lisis. Las bacterias son el huésped natural. La transmisión se produce por difusión pasiva. ^{[ 2 ]}

Según el informe del ICTV de 2009, el género de virus similares a PhiKZ fue aceptado inicialmente como un nuevo género, al mismo tiempo que las tres especies que contiene. Esta propuesta está disponible aquí . En 2012, el nombre se cambió a Phikzlikevirus . Esta propuesta está disponible aquí . ^{[ 6 ]} Posteriormente, el género fue renombrado como Phikzvirus .

• Viralzone : Virus similar a Phikz
• ICTV