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Articulo de referencia

Centro Filipino del Genoma

Coordenadas : 14°39′06″N 121°04′18″E / 14.65157°N 121.07168°E / 14.65157; 121.07168 El Centro Filipino del Genoma ( PGC ) es un centro de investigación multidisciplinario ubicad...

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Coordenadas : 14°39′06″N 121°04′18″E / 14.65157°N 121.07168°E / 14.65157; 121.07168

El Centro Filipino del Genoma ( PGC ) es un centro de investigación multidisciplinario ubicado en Ciudad Quezón , Metro Manila , Filipinas , especializado en genómica .

Historia

El Centro del Genoma de Filipinas se estableció como una colaboración entre la Universidad de Filipinas y el Departamento de Ciencia y Tecnología (DOST) . [ 1 ] Se concibió por primera vez en 2009 en respuesta al brote de SARS que afectó a Hong Kong, los brotes de dengue que afectaron a Filipinas y la pandemia de gripe H1N1 en curso que se originó en México. Las primeras subvenciones recibidas por el PGC fueron para pruebas de diagnóstico de dengue y vigilancia de H1N1 . [ 2 ] Inicialmente, la instalación quedó bajo la jurisdicción de la Oficina del Presidente de la Universidad de Filipinas (UP) Diliman según la aprobación de la Junta de Regentes de la UP en su reunión del 31 de julio de 2009. [ 3 ]

El PGC se inauguró formalmente el 28 de noviembre de 2011. Al principio, el centro operó virtualmente. Desde enero de 2013 hasta la apertura de su edificio el 11 de septiembre de 2019, [ 4 ] estuvo ubicado temporalmente en el Instituto Nacional de Biología Molecular y Biotecnología de UP Diliman.

Para que los servicios de secuenciación de ADN y bioinformática fueran accesibles a los investigadores filipinos, se establecieron el Centro de Secuenciación de ADN (DSCF) y el Centro de Bioinformática (CFB) con el apoyo financiero del DOST. El 26 de febrero de 2016, la Junta de Regentes de la UP aprobó la transferencia de la gestión y supervisión del PGC de la Oficina del Presidente de la universidad a la Oficina del Vicerrector de Asuntos Académicos [ 3 ].

En 2019, PGC Mindanao [ 5 ] y PGC Visayas [ 6 ] se establecieron como oficinas satélite en Mindanao y Visayas respectivamente.

Pandemia de COVID-19 en Filipinas

En enero de 2020, el PGC, en colaboración con los Institutos Nacionales de Salud de la UP Manila, desarrolló un kit de detección de SARS-CoV-2 mediante RT-PCR . [ 7 ]

En abril de 2020, el Departamento de Salud designó al Centro del Genoma de Filipinas como el 18.º centro de pruebas de coronavirus. [ 8 ] También se le encomendó la tarea de realizar la secuenciación genómica de muestras de COVID-19. [ 9 ] En julio de 2021, el PGC Mindanao y el PGC Visayas también recibieron la tarea de detectar nuevas variantes con el plan de proporcionarles máquinas para realizar la secuenciación del genoma. [ 10 ] En septiembre de 2021, el PGC cambió su enfoque hacia la detección de nuevas variantes de COVID-19 en el país y se centró menos en realizar pruebas RT-PCR. [ 11 ]

Instalaciones

El PGC cuenta con dos "instalaciones centrales": la Instalación Central de Bioinformática (CFB) y la Instalación Central de Secuenciación de ADN (DSCF). Se prevé la creación de un biobanco como tercera instalación del PGC. [ 12 ] Las dos instalaciones fueron financiadas con una subvención de ₱100 millones (US$2,2 millones) durante tres años por el Consejo Filipino para la Investigación y el Desarrollo de la Industria, la Energía y las Tecnologías Emergentes (PCIEERD) del Departamento de Ciencia y Tecnología . [ 2 ]

Instalación central de secuenciación de ADN

Inaugurada el 24 de septiembre de 2013, la Instalación Central de Secuenciación de ADN (DSCF) fue la primera instalación central en abrir sus puertas. En la DSCF se realizan estudios genómicos en los campos de la agricultura, la biodiversidad, la medicina forense, la salud y la etnicidad, con el objetivo específico de atender las necesidades de los filipinos. [ 12 ] En la DSCF se ofrecen servicios de secuenciación de ADN y genoma . [ 2 ]

Instalación central para bioinformática

El Centro de Bioinformática (CFB) es una instalación que proporciona generación y análisis de datos genómicos a investigadores locales del ámbito académico, instituciones gubernamentales y organizaciones privadas. También ofrece almacenamiento de datos genómicos. Además, cuenta con el apoyo de una supercomputadora IBM Blue Gene , utilizada por la Administración Filipina de Servicios Atmosféricos, Geofísicos y Astronómicos (PAGASA) y el Proyecto de Evaluación Operativa Nacional de Peligros (Proyecto NOAH) para la predicción meteorológica y la modelización del cambio climático, además de su uso en investigación genómica. El CFB se inauguró el 14 de abril de 2014, y la supercomputadora entró en funcionamiento ese mismo día. [ 13 ]

Servicios de diagnóstico y laboratorio

PGC Mindanao ofrece diversos servicios de diagnóstico y laboratorio a investigadores y laboratorios locales. Estos servicios incluyen preparación de muestras, espectrofotometría , fluorometría , reacción en cadena de la polimerasa , electroforesis , citometría de flujo y otros servicios bioinformáticos y de laboratorio.

El equipo avanzado de PGC Mindanao se encuentra alojado temporalmente en los diferentes laboratorios de CSM: Biotecnología , Biología Molecular y Laboratorio de Extracción . [ 14 ]

Directores

Referencias

  1. ↑ Keswani, Chetan (14 de octubre de 2019). Bioeconomía para el desarrollo sostenible . Springer Nature. pág.  45. ISBN 978-981-13-9431-7. Consultado el 15 de septiembre de 2021 .
  2. 1 2 3 Estospace, Eden (4 de marzo de 2015). "Centro del Genoma Filipino: Un gran paso en la investigación sanitaria y agrícola" . Innovación empresarial . Archivado del original el 24 de abril de 2018. Recuperado el 21 de abril de 2018 .
  3. 1 2 "Acerca de" . Centro del Genoma de Filipinas . Consultado el 21 de abril de 2018 .
  4. ↑ Tomacruz, Sofía (12 de septiembre de 2019). "LOOK: UP abre un centro de investigación genómica de vanguardia" . Rappler . Consultado el 15 de septiembre de 2021 .
  5. ↑ Centro del Genoma Filipino. "PGC Mindanao participa en un estudio genómico colaborativo del SARS-CoV-2 utilizando una plataforma de secuenciación portátil" . Centro del Genoma Filipino . Consultado el 15 de septiembre de 2021 .
  6. ↑ "Historia" . pgc.upv.edu.ph. Centro Filipino del Genoma Visayas. 20 de noviembre de 2020. Consultado el 15 de septiembre de 2021 .
  7. ↑ Deyro, Elizabeth Ruth (13 de marzo de 2020). "Cómo un equipo de científicos filipinos desarrolló un kit de prueba para la COVID-19" . CNN Filipinas . Archivado del original el 15 de septiembre de 2021. Recuperado el 15 de septiembre de 2021 .
  8. ↑ Magsambol, Bonz (24 de abril de 2020). "El Centro del Genoma de Filipinas es el 18.º centro de pruebas de coronavirus del país" . Rappler . Consultado el 15 de septiembre de 2021 .
  9. ↑ Gonzales, Cathrine (6 de mayo de 2021). "Experta señala el 'muy bajo' muestreo de PH para la secuenciación del genoma de COVID-19" . INQUIRER.net . Recuperado el 15 de septiembre de 2021 .
  10. ↑ Lena, Perla (23 de julio de 2021). "PGC equipará centros de Visayas y Mindanao para la secuenciación del genoma" . www.pna.gov.ph. Consultado el 15 de septiembre de 2021 .
  11. ↑ Deiparine, Christian (13 de septiembre de 2021). "El centro de genómica reduce las pruebas de COVID-19 para centrarse en la detección de variantes" . Philstar.com . Consultado el 15 de septiembre de 2021 .
  12. 1 2 Luces, Kim (25 de septiembre de 2013). "El Centro de Genómica de PHL abre nuevas instalaciones de secuenciación de ADN para investigadores locales" . GMA News . Recuperado el 21 de abril de 2018 .
  13. ↑ Ronda, Rainier Allan (15 de abril de 2014). "DOST activa supercomputadora de IBM" . ABS-CBN News . Philippine Daily Inquirer . Consultado el 21 de abril de 2018 .
  14. ↑ "Servicios" . Centro del Genoma de Filipinas . Consultado el 22 de abril de 2021 .