Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

Epítopo

Un epítopo , también conocido como determinante antigénico , es la parte de un antígeno que es reconocida por el sistema inmunitario , específicamente por anticuerpos , células ...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

Un epítopo , también conocido como determinante antigénico , es la parte de un antígeno que es reconocida por el sistema inmunitario , específicamente por anticuerpos , células B o células T. La parte de un anticuerpo que se une al epítopo se denomina parátopo . Si bien los epítopos suelen ser proteínas extrañas , las secuencias derivadas del huésped que pueden ser reconocidas (como en el caso de las enfermedades autoinmunes) también son epítopos. [ 1 ]

Los epítopos de los antígenos proteicos se dividen en dos categorías, epítopos conformacionales y epítopos lineales , según su estructura e interacción con el parátopo. [ 2 ] Los epítopos conformacionales y lineales interactúan con el parátopo en función de la conformación tridimensional adoptada por el epítopo, la cual está determinada por las características superficiales de los residuos del epítopo involucrados y la forma o estructura terciaria de otros segmentos del antígeno. Un epítopo conformacional se forma por la conformación tridimensional adoptada por la interacción de residuos de aminoácidos discontinuos. En cambio, un epítopo lineal se forma por la conformación tridimensional adoptada por la interacción de residuos de aminoácidos contiguos. Un epítopo lineal no está determinado únicamente por la estructura primaria de los aminoácidos involucrados. Los residuos que flanquean dichos residuos de aminoácidos, así como los residuos de aminoácidos más distantes del antígeno, afectan la capacidad de los residuos de la estructura primaria para adoptar la conformación tridimensional del epítopo. [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] El 90% de los epítopos son conformacionales. [ 8 ]

Función

epítopos de células T

Los epítopos de células T [ 9 ] se presentan en la superficie de una célula presentadora de antígenos , donde se unen a moléculas del complejo mayor de histocompatibilidad (MHC). En los humanos, las células presentadoras de antígenos profesionales están especializadas en presentar péptidos MHC de clase II , mientras que la mayoría de las células somáticas nucleadas presentan péptidos MHC de clase I. Los epítopos de células T presentados por moléculas MHC de clase I son típicamente péptidos de entre 8 y 11 aminoácidos de longitud, mientras que las moléculas MHC de clase II presentan péptidos más largos, de 13 a 17 aminoácidos de longitud, [ 10 ] y las moléculas MHC no clásicas también presentan epítopos no peptídicos como los glucolípidos .

epítopos de células B

La parte del antígeno a la que se unen las inmunoglobulinas o los anticuerpos se llama epítopo de células B. [ 11 ] Los epítopos de células B se pueden dividir en dos grupos: conformacionales o lineales. [ 11 ] Los epítopos de células B son principalmente conformacionales. [ 12 ] [ 13 ] Hay tipos adicionales de epítopos cuando se considera la estructura cuaternaria. [ 13 ] Los epítopos que se enmascaran cuando se agregan las subunidades de proteínas se llaman criptotopos . [ 13 ] Los neotopos son epítopos que solo se reconocen cuando están en una estructura cuaternaria específica y los residuos del epítopo pueden abarcar múltiples subunidades de proteínas. [ 13 ] Los neotopos no se reconocen una vez que las subunidades se disocian. [ 13 ]

Actividad cruzada

Los epítopos a veces presentan reactividad cruzada. Esta propiedad es aprovechada por el sistema inmunitario para la regulación mediante anticuerpos antiidiotípicos (propuestos originalmente por el premio Nobel Niels Kaj Jerne ). Si un anticuerpo se une al epítopo de un antígeno, el parátopo puede convertirse en el epítopo de otro anticuerpo que se unirá a él. Si este segundo anticuerpo es de la clase IgM , su unión puede potenciar la respuesta inmunitaria; si es de la clase IgG , su unión puede atenuarla.

Mapeo de epítopos

epítopos de células T

Los epítopos de MHC de clase I y II pueden predecirse de forma fiable solo por medios computacionales, [ 14 ] aunque no todos los algoritmos de predicción de epítopos de células T in silico son equivalentes en su precisión. [ 15 ] Hay dos métodos principales para predecir la unión péptido-MHC: basados ​​en datos y basados ​​en la estructura. [ 11 ] Los métodos basados ​​en la estructura modelan la estructura péptido-MHC y requieren una gran potencia computacional. [ 11 ] Los métodos basados ​​en datos tienen un rendimiento predictivo superior al de los métodos basados ​​en la estructura. [ 11 ] Los métodos basados ​​en datos predicen la unión péptido-MHC basándose en secuencias de péptidos que se unen a moléculas de MHC. [ 11 ] Al identificar epítopos de células T, los científicos pueden rastrear, fenotipificar y estimular las células T. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]

epítopos de células B

Existen dos métodos principales de mapeo de epítopos: estudios estructurales o funcionales. [ 20 ] Los métodos para el mapeo estructural de epítopos incluyen la cristalografía de rayos X , la resonancia magnética nuclear y la microscopía electrónica . [ 20 ] La cristalografía de rayos X de complejos Ag-Ab se considera una forma precisa de mapear estructuralmente los epítopos. [ 20 ] La resonancia magnética nuclear puede utilizarse para mapear epítopos mediante datos sobre el complejo Ag-Ab. [ 20 ] Este método no requiere la formación de cristales, pero solo funciona con péptidos y proteínas pequeños. [ 20 ] La microscopía electrónica es un método de baja resolución que permite localizar epítopos en antígenos más grandes, como partículas virales. [ 20 ]

Los métodos para el mapeo funcional de epítopos suelen utilizar ensayos de unión como Western blot , Dot blot y/o ELISA para determinar la unión de anticuerpos. [ 20 ] Los métodos de competencia buscan determinar si dos anticuerpos monoclonales (mAB) pueden unirse a un antígeno al mismo tiempo o competir entre sí para unirse al mismo sitio. [ 20 ] Otra técnica implica la mutagénesis de alto rendimiento , una estrategia de mapeo de epítopos desarrollada para mejorar el mapeo rápido de epítopos conformacionales en proteínas estructuralmente complejas. [ 21 ] La mutagénesis utiliza mutaciones aleatorias/dirigidas al sitio en residuos individuales para mapear epítopos. [ 20 ] El mapeo de epítopos de células B puede utilizarse para el desarrollo de terapias con anticuerpos, vacunas basadas en péptidos y herramientas inmunodiagnósticas. [ 20 ] [ 22 ]

Etiquetas de epítopos

Los epítopos se utilizan a menudo en proteómica y en el estudio de otros productos génicos. Mediante técnicas de ADN recombinante, se pueden fusionar al gen secuencias genéticas que codifican epítopos reconocidos por anticuerpos comunes. Tras la síntesis , la etiqueta de epítopo resultante permite al anticuerpo encontrar la proteína u otro producto génico, lo que posibilita técnicas de laboratorio para la localización, purificación y caracterización molecular adicional, incluyendo la identificación de los socios de unión de la proteína. Los epítopos comunes utilizados para este propósito son Myc-tag , HA-tag , FLAG-tag , GST-tag , 6xHis , [ 23 ] V5-tag y OLLAS. [ 24 ] Munro y Pelham describieron por primera vez una etiqueta de epítopo para detectar y rastrear proteínas en 1984 [ 25 ] . Las etiquetas se adaptaron rápidamente para purificar proteínas [ 26 ] [ 27 ] y para detectar, aislar y clonar socios de interacción de proteínas [ 28 ] [ 29 ] . Estas etiquetas se denominaron originalmente "etiqueta de péptido" [ 30 ] , "inserción de epítopo" [ 31 ] , "secuencia marcadora" [ 32 ] y "adición de epítopo" [ 33 ] , hasta que se acuñó el término "etiqueta de epítopo" [ 34 ] y se popularizó.

Los péptidos también pueden unirse a proteínas que forman enlaces covalentes con el péptido, lo que permite una inmovilización irreversible. [ 35 ] Estas estrategias también se han aplicado con éxito al desarrollo del diseño de vacunas "centradas en epítopos". [ 36 ] [ 37 ]

Vacunas basadas en epítopos

La primera vacuna basada en epítopos fue desarrollada en 1985 por Chaim Jacob y sus colegas del Instituto Weizmann de Ciencias. [ 38 ] [ 39 ] Las vacunas basadas en epítopos estimulan las respuestas inmunitarias humorales y celulares utilizando epítopos aislados de células B o células T. [ 38 ] [ 22 ] [ 17 ] Estas vacunas pueden utilizar múltiples epítopos para aumentar su eficacia. [ 38 ] Para encontrar epítopos para la vacuna, se suele utilizar el mapeo in silico . [ 38 ] Una vez encontrados los epítopos candidatos, se diseñan y prueban las construcciones para determinar la eficacia de la vacuna. [ 38 ] Si bien las vacunas basadas en epítopos son generalmente seguras, un posible efecto secundario son las tormentas de citoquinas. [ 38 ]

Determinante neoantigénico

Un determinante neoantigénico es un epítopo en un neoantígeno , que es un antígeno de nueva formación que no ha sido reconocido previamente por el sistema inmunitario. [ 40 ] Los neoantígenos suelen estar asociados a antígenos tumorales y se encuentran en células oncogénicas. [ 41 ] Los neoantígenos y, por extensión, los determinantes neoantigénicos pueden formarse cuando una proteína sufre una modificación adicional dentro de una vía bioquímica como la glicosilación , la fosforilación o la proteólisis . Esto, al alterar la estructura de la proteína, puede producir nuevos epítopos que se denominan determinantes neoantigénicos, ya que dan lugar a nuevos determinantes antigénicos . El reconocimiento requiere anticuerpos específicos separados .

Véase también

Referencias

  1. ↑ Mahmoudi Gomari, Mohammad; Saraygord-Afshari, Neda; Farsimadan, Marziye; Rostami, Neda; Aghamiri, Shahin; Farajollahi, Mohammad M. (1 de diciembre de 2020). "Oportunidades y desafíos de las técnicas de purificación de proteínas asistidas por etiquetas: aplicaciones en la industria farmacéutica". Biotechnology Advances . 45 107653. doi : 10.1016/j.biotechadv.2020.107653 . PMID 33157154. S2CID 226276355 .  
  2. ↑ Huang J, Honda W (abril de 2006). "CED: una base de datos de epítopos conformacionales" . BMC Immunology . 7 : 7. doi : 10.1186/1471-2172-7-7 . PMC 1513601. PMID 16603068 .  
  3. ↑ Anfinsen CB (julio de 1973). "Principios que rigen el plegamiento de las cadenas proteicas". Science . 181 (4096): 223– 230. Bibcode : 1973Sci...181..223A . doi : 10.1126/science.181.4096.223 . PMID 4124164 . 
  4. ↑ Bergmann CC, Tong L, Cua R, Sensintaffar J, Stohlman S (agosto de 1994). "Efectos diferenciales de los residuos flanqueantes en la presentación de epítopos de péptidos quiméricos" . Journal of Virology . 68 (8): 5306–10 . doi : 10.1128/JVI.68.8.5306-5310.1994 . PMC 236480. PMID 7518534 .  
  5. ↑ Bergmann CC, Yao Q, Ho CK, Buckwold SL (octubre de 1996). "Los residuos flanqueantes alteran la antigenicidad y la inmunogenicidad de los epítopos CTL de unidades múltiples" . Journal of Immunology . 157 (8): 3242–9 . doi : 10.4049/jimmunol.157.8.3242 . PMID 8871618. S2CID 24717835 .  
  6. ↑ Briggs S, Price MR, Tendler SJ (1993). "Especificidad fina del reconocimiento de anticuerpos de mucinas epiteliales asociadas al carcinoma: unión de anticuerpos a epítopos peptídicos sintéticos". European Journal of Cancer . 29A (2): 230– 7. doi : 10.1016/0959-8049(93)90181-E . PMID 7678496 . 
  7. ↑ Craig L, Sanschagrin PC, Rozek A, Lackie S, Kuhn LA, Scott JK (agosto de 1998). "El papel de la estructura en la reactividad cruzada de anticuerpos entre péptidos y proteínas plegadas". Journal of Molecular Biology . 281 (1): 183– 201. doi : 10.1006/jmbi.1998.1907 . PMID 9680484 . 
  8. ↑ Ferdous, Saba; Kelm, Sebastian; Baker, Terry S.; Shi, Jiye; Martin, Andrew CR (1 de octubre de 2019). " Epítopos de células B: discontinuidad y análisis conformacional" . Molecular Immunology . 114 : 643–650 . doi : 10.1016/j.molimm.2019.09.014 . PMID 31546099. S2CID 202747810 .  
  9. ↑ Steers NJ, Currier JR, Jobe O, Tovanabutra S, Ratto-Kim S, Marovich MA, et al. (junio de 2014). "Diseño de las regiones flanqueantes del epítopo para la generación óptima de epítopos CTL". Vaccine . 32 (28): 3509– 16. doi : 10.1016/j.vaccine.2014.04.039 . PMID 24795226 .  
  10. ↑ Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P (2002). Biología molecular de la célula (4.ª ed.). Nueva York: Garland Science. pág. 1401. ISBN   978-0-8153-3218-3.
  11. 1 2 3 4 5 6 Sánchez-Trincado, José L.; Gómez-Perosanz, Marta; Reche, Pedro A. (2017). "Fundamentos y métodos para la predicción de epítopos de células T y B" . Journal of Immunology Research . 2017 : 1–14 . doi : 10.1155/2017/2680160 . PMC 5763123. PMID 29445754 .  
  12. ↑ El-Manzalawy Y, Honavar V (noviembre de 2010). "Avances recientes en métodos de predicción de epítopos de células B" . Immunome Research . 6 (Supl. 2): S2. doi : 10.1186/1745-7580-6-S2-S2 . PMC 2981878. PMID 21067544 .  
  13. 1 2 3 4 5 Regenmortel, Marc HV (2009). "¿Qué es un epítopo de células B?". Protocolos de mapeo de epítopos . Métodos en biología molecular. Vol. 524. págs. 3–20 . doi : 10.1007/978-1-59745-450-6_1 . ISBN   978-1-934115-17-6. PMID 19377933 . 
  14. ↑ Koren, E.; Groot, Anne De; Jawa, V.; Beck, K.; Boone, T.; Rivera, D.; Li, L.; Mytych, D.; Koscec, M.; Weeraratne, D.; Swanson, S.; Martin, W. (1 de enero de 2007). "Validación clínica de la predicción 'in silico' de la inmunogenicidad de una proteína terapéutica recombinante humana" . Publicaciones de la facultad del Instituto de Inmunología e Informática . 124 (1): 26– 32. doi : 10.1016/j.clim.2007.03.544 . PMID 17490912. S2CID 12867280 .  
  15. ↑ De Groot, Anne S.; Martin, William (mayo de 2009). "Reducción de riesgos, mejora de resultados: Bioingeniería de terapias proteicas menos inmunogénicas". Inmunología Clínica . 131 (2): 189– 201. doi : 10.1016/j.clim.2009.01.009 . PMID 19269256 . 
  16. ↑ Peters, Bjoern; Nielsen, Morten; Sette, Alessandro (26 de abril de 2020). "Predicciones de epítopos de células T" . Annual Review of Immunology . 38 (1): 123– 145. doi : 10.1146/annurev-immunol-082119-124838 . PMC 10878398. PMID 32045313. S2CID 211085860 .   
  17. 1 2 Ahmad, Tarek A.; Eweida, Amrou E.; El-Sayed, Laila H. (diciembre de 2016). "Mapeo de epítopos de células T para el diseño de vacunas potentes". Vaccine Reports . 6 : 13–22 . doi : 10.1016/j.vacrep.2016.07.002 .
  18. ^ Dezfulian MH, Kula T, Pranzatelli T, Kamitaki N, Meng Q, Khatri B, Perez P, Xu Q, Chang A, Kohlgruber AC, Leng Y, Jupudi AA, Joachims ML, Chiorini JA, Lessard CJ, Farris AD, Muthuswamy SK, Warner BM, Elledge SJ (diciembre de 2023). "TScan-II: una plataforma a escala genómica para la identificación de novo de epítopos de células T CD4 +" . Celúla . 186 (25): 5569– 86. doi : 10.1016/j.cell.2023.10.024 . PMC 10841602 . PMID 38016469 .  
  19. ↑ Kula T, Dezfulian MH, Wang CI, Abdelfattah NS, Hartman ZC, Wucherpfennig KW, Lyerly HK, Elledge SJ (agosto de 2019). "T-Scan: un método genómico para el descubrimiento sistemático de epítopos de células T" . Cell . 178 ( 4): 1016–28 . doi : 10.1016/j.cell.2019.07.009 . PMC 6939866. PMID 31398327 .  
  20. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Potocnakova, Lenka; Bhide, Mangesh; Pulzova, Lucia Borszekova (2016). "Una introducción al mapeo de epítopos de células B y la predicción de epítopos in silico" . Journal of Immunology Research . 2016 : 1–11 . doi : 10.1155/2016/6760830 . PMC 5227168. PMID 28127568 .  
  21. ↑ Davidson, Edgar; Doranz, Benjamin J. (septiembre de 2014). "Un enfoque de mutagénesis de escopeta de alto rendimiento para mapear epítopos de anticuerpos de células B" . Immunology . 143 ( 1): 13– 20. doi : 10.1111/imm.12323 . PMC 4137951. PMID 24854488 .  
  22. 1 2 Ahmad, Tarek A.; Eweida, Amrou E.; Sheweita, Salah A. (2016). "Mapeo de epítopos de células B para el diseño de vacunas y diagnósticos eficaces" . Trials in Vaccinology . 5 : 71–83 . doi : 10.1016/j.trivac.2016.04.003 .
  23. ↑ Park HR, Cockrell LM, Du Y, Kasinski A, Havel J, Zhao J, Reyes-Turcu F, Wilkinson KD, Fu H (2008). "Interacciones proteína-proteína" . En Walker J, Rapley R (eds.). Manual de biométodos moleculares . Manuales de protocolos Springer (2.ª ed.). Humana Press. págs. 463–494 , véase pág. 467. doi : 10.1007/978-1-60327-375-6 . ISBN   978-1-60327-374-9.
  24. ↑ Novus, Biologicals. "Etiqueta de epítopo OLLAS" . Novus Biologicals . Consultado el 23 de noviembre de 2011 .
  25. ↑ {{cite journal | vauthors = Munro S, Pelham HR | title = Uso del etiquetado de péptidos para detectar proteínas expresadas a partir de genes clonados: mapeo por deleción de dominios funcionales de hsp 70 de Drosophila. | journal = EMBO J. | date = 1984 | volume = 3 | issue = 13 | pages = 3087–3093 | doi = 10.1002/j.1460-2075.1984.tb02263
  26. ↑ {{cite journal | vauthors = Hopp TP, Prickett KS, Price VL, et al. | title = Una secuencia marcadora de polipéptido corta útil para la identificación y purificación de proteínas recombinantes. | journal = Bio/Technology. | date = 1988 | volume = 6 | issue = 10 | pages = 1204–1210 | doi = doi.org/10.1038/nbt1088-1204
  27. ↑ {{cite journal | vauthors = Field J, Nikawa J, Broek D, et al. | title = Purificación de un complejo de adenilil ciclasa sensible a RAS de Saccharomyces cerevisiae mediante un método de adición de epítopos. | journal = Mol Cell Biol. | date = 1988 | volume = 8 | issue = 5 | pages = 2159-2165 | doi = doi.org/10.1128/MCB.8.5.2159
  28. ↑ {{cite journal | vauthors = Squinto SP, Aldrich TH, Lindsay RM, et.al | title = Identification of functional receptors for ciliary neurotrophic actor on neuronal cell lines and primary neurons | journal = Neuron | date = 1990 | volume = 5 | issue = 6 | pages = 757-766 | PMID = 2176509 | doi = 10.1016/0896-6273(90)90334-c
  29. ↑ {{cite journal | vauthors = Davis S, Aldrich TH, Valenzuela DM, et al | title = El receptor del factor neurotrófico ciliar | journal = Science | date = 1991 | volume = 253 | issue = 5015 | pages = 59-63 | PMID = 1648265 | doi = 10.1126/science.1648265
  30. ↑ {{cite journal | vauthors = Munro S, Pelham HR | title = Uso del etiquetado de péptidos para detectar proteínas expresadas a partir de genes clonados: mapeo por deleción de dominios funcionales de hsp 70 de Drosophila. | journal = EMBO J. | date = 1984 | volume = 3 | issue = 13 | pages = 3087–3093 | doi = 10.1002/j.1460-2075.1984.tb02263
  31. ↑ {{cite journal | vauthors = McMahon AP, Moon RT | title = La expresión ectópica del protooncogén int-1 en embriones de Xenopus conduce a la duplicación del eje embrionario | journal = Cell | date = 1989 | volume = 58 | issue = 6 | pages = 1075–1084 | doi = doi.org/10.1016/0092-8674(89)90506-0
  32. ↑ {{cite journal | vauthors = Hopp TP, Prickett KS, Price VL, et al. | title = Una secuencia marcadora de polipéptido corta útil para la identificación y purificación de proteínas recombinantes. | journal = Bio/Technology. | date = 1988 | volume = 6 | issue = 10 | pages = 1204–1210 | doi = doi.org/10.1038/nbt1088-1204
  33. ↑ {{cite journal | vauthors = Field J, Nikawa J, Broek D, et al. | title = Purificación de un complejo de adenilil ciclasa sensible a RAS de Saccharomyces cerevisiae mediante un método de adición de epítopos. | journal = Mol Cell Biol. | date = 1988 | volume = 8 | issue = 5 | pages = 2159-2165 | doi = doi.org/10.1128/MCB.8.5.2159
  34. ↑ {{cite journal | vauthors = Squinto SP, Aldrich TH, Lindsay RM, et al.| title = Identification of functional receptors for ciliary neurotrophic factor on neuronal cell lines and primary neurons | journal = Neuron | date = 1990 | volume = 5 | issue = 6 | pages = 757–766 | doi = ddoi.org/10.1016/0896-6273(90)90334-c
  35. ↑ Zakeri B, Fierer JO, Celik E, Chittock EC, Schwarz-Linek U, Moy VT, Howarth M (marzo de 2012). "Etiqueta peptídica que forma un enlace covalente rápido a una proteína, mediante la ingeniería de una adhesina bacteriana" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 109 (12): E690–7. Bibcode : 2012PNAS..109E.690Z . doi : 10.1073/pnas.1115485109 . PMC 3311370. PMID 22366317 .  
  36. ↑ Correia BE, Bates JT, Loomis RJ, Baneyx G, Carrico C, Jardine JG, et al. (marzo de 2014). "Prueba de principio para el diseño de vacunas centradas en epítopos" . Nature . 507 (7491): 201– 6. Bibcode : 2014Natur.507..201C . doi : 10.1038/nature12966 . PMC 4260937. PMID 24499818 .   
  37. ↑ McBurney SP, Sunshine JE, Gabriel S, Huynh JP, Sutton WF, Fuller DH, et al. (junio de 2016). "Evaluación de la protección inducida por una vacuna de ADN/estructura de proteína del dominio III de la envoltura del virus del dengue serotipo 2 en primates no humanos" . Vaccine . 34 ( 30): 3500– 7. doi : 10.1016/j.vaccine.2016.03.108 . PMC 4959041. PMID 27085173 .   
  38. 1 2 3 4 5 6 Parvizpour, Sepideh; Pourseif, Mohammad M.; Razmara, Jafar; Rafi, Mohammad A.; Omidi, Yadollah (junio de 2020). "Diseño de vacunas basado en epítopos: una visión general completa de los enfoques bioinformáticos". Drug Discovery Today . 25 (6): 1034– 42. doi : 10.1016/j.drudis.2020.03.006 . PMID 32205198. S2CID 214629963 .  
  39. ↑ Jacob, CO; Leitner, M.; Zamir, A.; Salomon, D.; Arnon, R. (1985). "Priming immunization against cholera toxin and E. coli thermo-labile toxin by a cholera peptide short péptido-beta-galactosidasa hybrid syntedd in E. coli" . The EMBO Journal . 4 (12): 3339– 3343. doi : 10.1002/j.1460-2075.1985.tb04086.x . ISSN 0261-4189 . PMC 554663 . PMID 3004953 .   
  40. ↑ Hans-Werner V (2005). "Sustancias químicas formadoras de neoantígenos". Encyclopedic Reference of Immunotoxicology . p. 475. doi : 10.1007/3-540-27806-0_1063 . ISBN  978-3-540-44172-4.
  41. ↑ Neoantígeno. (s.f.) Diccionario Médico de Mosby, 8.ª edición. (2009). Recuperado el 9 de febrero de 2015 de Medical Dictionary Online.
  • Los anticuerpos se unen a las formas conformacionales en las superficies de los antígenos (Janeway, Inmunobiología, Sección 3.8).
  • Los antígenos pueden unirse en cavidades o surcos, o en superficies extendidas en los sitios de unión de los anticuerpos (Janeway, Inmunobiología, Figura 3.8).

Métodos de predicción de epítopos

  • Rubinstein ND, Mayrose I, Martz E, Pupko T (septiembre de 2009). "Epitopia: un servidor web para predecir epítopos de células B" . BMC Bioinformatics . 10 : 287. doi : 10.1186/1471-2105-10-287 . PMC 2751785. PMID 19751513 .  
  • Rubinstein ND, Mayrose I, Pupko T (febrero de 2009). "Un enfoque de aprendizaje automático para predecir epítopos de células B". Inmunología molecular . 46 (5): 840– 7. doi : 10.1016/j.molimm.2008.09.009 . PMID 18947876 . 
  • Saravanan V, Gautham N (octubre de 2015). "Aprovechamiento de la biología computacional para la predicción exacta de epítopos lineales de células B: un nuevo descriptor de características basado en la composición de aminoácidos". Omics . 19 (10): 648– 658. doi : 10.1089/omi.2015.0095 . PMID 26406767 . 
  • Singh H, Ansari HR, Raghava GP (2013). "Método mejorado para la predicción de epítopos lineales de células B utilizando la secuencia primaria del antígeno" . PLOS ONE . 8 (5) e62216. Bibcode : 2013PLoSO...862216S . doi : 10.1371/journal.pone.0062216 . PMC 3646881. PMID 23667458 .  

Bases de datos de epítopos

  • MHCBN: Una base de datos de epítopos de células T y ligandos MHC/TAP
  • Bcipep: Una base de datos de epítopos de células B
  • SYFPEITHI — Primera base de datos en línea de epítopos de células T
  • IEDB — Base de datos de epítopos de células T y B con anotación del contexto de reconocimiento — Financiada por los NIH
  • ANTIJEN — Base de datos de epítopos de células T y B del Instituto Jenner, Reino Unido.
  • IMGT/3Dstructure-DB — Estructuras tridimensionales de epítopos de células B y T con anotación de IG y TR — IMGT, Montpellier, Francia
  • SEDB: Una base de datos de epítopos estructurales — Financiada por la Universidad de Pondicherry y el DIT.
  • Epítopos en los encabezamientos de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.